GenePix 4300A&4400A微阵列基因芯片扫描仪
Molecular Devices公司推出的GenePix®4300A和GenePix® 4400A基因芯片扫描仪,此平台可通过优化分辨率以获取更高成像质量。配有5μm/pixel或2.5 μm/pixel的扫描分辨率检测器,至多可选四色激光器,16位发射滤光片。使得此芯片扫描仪可针对更多种荧光染料分子进行检测。此外,结合了GenePix Pro微阵列芯片图像分析软件和Acuity微阵列信息数据分析软件,GenePix系统提供了强大、灵活和易于使用全套方案,便于更好的获取和分析不同类型的数据,例如包括核苷酸、蛋白、组织和细胞。
主要特点:
1,高分辨率成像
2,兼容各种样品类型
3,四色激光器
4,16位发射滤光片转轮
5,先进的GenePix pro图像分析软件
仪器优势:
1,未来可升级:GenePix® 4300A 微阵列芯片扫描仪拥有 5μm/像素的分辨率, 并可随时升级至 2.5μm/像素。因此, 可根据研究需要优化扫描仪至较佳分辨率。
2,完全自主选择染料:此扫描仪虽然内置多达 4 个固态二极管和气体激光器, 但仍是一台结构紧凑的台式仪器。激光光源的灵活性很高, 多达 12 个可供用户选择的发射滤光片位置, 可方便您随意选择任何荧光染料进行检测(CyTM3 和 CyTM5 染料、荧光素、GFP、Texas Red、Alexa Fluor® 染料或量子点等)。
3,值得信赖的微阵列信号:GenePix® 4300 与 4400 微阵列芯片扫描仪拥有卓越的定位性能和均一性, 您可运行需要的应用, 如目前最新一代的 NimbleGen® 阵列或阵列 CGH 试验。经过测试的指定 +/- 2% 平场均一性, 这些扫描仪可分辨 200 对线/毫米 (LPPM) 的空间频率, 并在较高分辨率时拥有至少 50% 的对比度 (CTF)。
4,数据噪音减少: 具有优秀的信噪比 (SNR) 表现。GenePix® 微阵列基因芯片扫描仪会选择原件, 如低噪声数模转换器和光电倍增管 (PMT)、较高质量的滤光片和传感器, 以降低散射光的干扰。结合这些改进, 可使噪声降至较低水平, 并大大增加灵敏度。较高的灵敏度仅需使用较低功率的激光强度, 这样可显著降低您的荧光染料的降解。
5,易碎组件减少:您的微阵列在我们的扫描仪上是安全的。凭借其全新设计的 6-点玻片支架, 我们通过依靠高精度加工技术可避免由于使用动态自动对焦时造成部件可靠性降低的风险。
6,高占空比设计:经改进的高占空比电机确保尽量延长转移和对焦电机的使用寿命。正在申请专利的新型音圈目的是尽量减少振动和优化散热。
7,GenePix 4400A 微阵列基因芯片扫描仪:能够支持用户根据实际需求在 2.5 和 100 微米/像素之间的分辨率中进行扫描, 从而使您能够轻松应对市面上较高密度微阵列芯片的要求。
可采集高分辨率图像,自动PMT平衡
GenePix 4400A基因芯片扫描仪支持用户在2.5μm/pixel和100 μm/pixel分辨率情况下获取数据,可针对具体实验的需求优化图像分辨率和文件的大小。具有5 μm分辨率的4300A系统可根据用户需要随时升级至具有更高分辨率的4400A系统。此外,两种型号的扫描仪均具有自动调节PMT增益的功能,可简便、快速对信号强度和通道的平衡进行优化。
出色的灵活性满足各种荧光染料的检测
4300A和4400A基因芯片扫描仪内置四色激光光源,支持更多种不同类型荧光染料的检测,16位滤光片转轮可方便用户根据需要随时增加新的发射滤光片,大大提高系统的灵活性。(见图一)根据需求随时增加激光光源。
极强的样品兼容性
4300A和4400A基因芯片扫描仪除了可以灵活的支持各种不同的荧光染料检测,也可通过调节聚焦位置和激光器强度兼容更多不同类型样品。焦距可调满足用户使用凹凸不平的芯片载体,如膜包被芯片或嵌入式芯片,可以获取更高的图像质量。激光器能量可调节,步进仅1%可以提供强大成像的控制能力,无论是强大稳定的信号或微弱不稳定的信号均可以完美呈现。内置所有激光器均具有自动校正功能,可以动态的监测激光器微小的波动,确保每个像素点均可获得稳定的、持续的信号。此外,由于所有GenePix系统可直接对微阵列序列表面进行成像分析,无论您使用何种微阵列基片,甚至此基片为非通明物质。
采用非共聚焦光路
采用非共聚焦光路的GenePix 4300A和4400A基因芯片扫描仪可用于微阵列芯片成像分析。共聚焦技术很早就用于较厚样品的组织进行薄层扫描成像,然后采用3-D重构的方式。(如图二)然而,微阵列芯片上大多数背景信号来源于非特异性的杂交反应,它们与样品位于同样的焦平面上,此外,绝大多数微阵列基因芯片表面为非均一平面。由于共聚焦成像系统具有非常窄的景深,会受到各种不同基质载体的较佳焦平面的变化而产生波动。我们的GenePix基因芯片扫描仪设计要求能够在各种微阵列芯片表面收集更多的光学信号同时还能够避免附近杂散光的干扰。
优质的高信噪比
4300A和4400A基因芯片扫描仪结合了优质的低噪音数字化技术和超灵敏的PMT检测器,与传统白光CCD系统比较而言提高5至10倍信噪比。
软件和硬件的高度结合
所有GenePix基因芯片扫描仪家族成员在设计之初就被要求能与GenePix Pro微阵列分析软件完美整合在一起。(如图三)扫描仪和软件之间这种无缝式的通信方式确保了其科高效的获取和分析相应实验数据,也能够实时检测扫描仪工作状态。可选的Acuity微阵列信息分析软件,具有数据库储存能力、群集算法、高级统计学能力和可视化界面。
GenePix 4300/4400 微阵列基因芯片扫描仪
三色激光器, 获得更高分辨率和更好图像质量
Molecular Devices 的 GenePix® 4300A 和 GenePix® 4400A 基因芯片扫描仪平台可通过优化分辨率以获取zei高成像质量。配有 5μm 或 2.5μm zei大扫描分辨率检测器, zei多可选四色激光器, 16位发射滤光片。使得此芯片扫描仪可针对更多种荧光染料分子进行检测。GenePix 系统与 GenePix® Pro 微阵列图像分析软件以及 Acuity® 微阵列芯片信息学软件整合一起使用, 可为各类微阵列的数据采集和分析提供强大、灵活且易用的解决方案, 包括核酸、蛋白质、组织和细胞阵列。
概览
优势
支持高密度微阵列芯片的检测并获得更高分辨率;
未来可升级: GenePix® 4300A 微阵列芯片扫描仪拥有 5µm/像素的zei大分辨率, 并可随时升级至 2.5µm/像素。因此, 可根据研究需要优化扫描仪至zei佳分辨率。
完全自主选择染料:此扫描仪虽然内置多达 4 个固态二极管和气体激光器, 但仍是一台结构紧凑的台式仪器。激光光源的灵活性很高, 多达 12 个可供用户选择的发射滤光片位置, 可方便您随意选择任何荧光染料进行检测(CyTM3 和 CyTM5 染料、荧光素、GFP、Texas Red、Alexa Fluor® 染料或量子点等)。
值得信赖的微阵列信号: GenePix® 4300 与 4400 微阵列芯片扫描仪拥有卓越的定位性能和均一性, 您可运行zei需要的应用, 如zei新一代的 NimbleGen® 阵列或阵列 CGH 试验。经过测试的指定 +/- 2% 平场均一性, 这些扫描仪可分辨 200 对线/毫米 (LPPM) 的空间频率, 并在zei高分辨率时拥有至少 50% 的对比度 (CTF)。
数据噪音减少: 具有无与伦比的信噪比 (SNR) 表现。GenePix® 微阵列基因芯片扫描仪会选择zei好原件, 如低噪声数模转换器和光电倍增管 (PMT)、zei高质量的滤光片和传感器, 以降低散射光的干扰。结合这些改进, 可使噪声降至zei低水平, 并大大增加灵敏度。无与伦比的灵敏度仅需使用zei低功率的激光强度, 这样可显著降低您的荧光染料的降解。
易碎组件减少:您的微阵列在我们的扫描仪上是安全的。凭借其全新设计的 6-点玻片支架, 我们通过依靠高精度加工技术可避免由于使用动态自动对焦时造成部件可靠性降低的风险。
高占空比设计:经改进的高占空比电机确保尽量延长转移和对焦电机的使用寿命。正在申请专利的新型音圈目的是尽量减少振动和优化散热。
GenePix 4400A 微阵列基因芯片扫描仪:能够支持用户根据实际需求在 2.5 和 100 微米/像素之间的分辨率中进行扫描, 从而使您能够轻松应对市面上zei高密度微阵列芯片的要求。
应用
蛋白质组:尽管尚未实现全蛋白质组分析, 微阵列芯片仍然促进了蛋白质组学领域取得长足进展。蛋白质组学展现出广泛动态复杂性;哺乳动物中不同蛋白质的数量一定超过基因数量, 因而需要合适的技术以进行相应分析。GenePix 系统的灵活性很高, 尤其是当加入高通量的 GenePix® SL50 自动玻片加载系统后, 可为研究人员提供zei佳的组合方式。
蛋白质阵列
多肽阵列
抗体阵列
ELISA 阵列
反相阵列
基因组学:针对基因组序列本身, 微阵列可用于识别全新基因、转录因子的结合位点、DNA 拷贝数变化、基础基因序列变异(如新发现病原体菌株或人类致病基因的复杂突变)。
SNP 基因分型
微阵列比较基因组杂交 (aCGH) 阵列
转录组学: 使用高密度微阵列芯片, 给复杂疾病转录水平的研究检测带来影响。通过zei新微阵列检测技术的发展, 现在可以总体上定量分析转录水平, 并将这些数据与疾病相关信息进行整合。基于微阵列的转录组学可利用受影响和未受影响的个体绘制出某一疾病的关键基因区域, 然后通过识别关键区域中的差异表达基因来确定致病基因。
基因表达阵列
RNA 干扰 (RNAi) 阵列
MicroRNA (miRNA) 阵列
表观遗传学:基因是承载着遗传信息的基本单位, 但这些信息仅在由表观基因组适当编码时才产生影响。DNA 甲基化模式是细胞类型特异性的, 与染色质结构相关。DNA 微阵列可用于识别甲基化模式, 而且 GenePix 微阵列芯片扫描仪自动化解决方案使研究人员能够更快地识别这些模式。
DNA 甲基化阵列
染色质免疫沉淀 (ChIP) 阵列
新型应用
微阵列研究的创造性和广泛适用性不受任何限制, 而且经各种不同的微阵列应用证明, 可执行大规模定量分析。GenePix® 微阵列芯片扫描仪系统可提供zei灵活的研究解决方案和自由度。
组织阵列
量子点
碳水化合物阵列
化合物阵列
兼容性
GenePix 4300/4400 微阵列基因芯片扫描仪兼容仪器:
GenePix® SL50 自动玻片加载系统
GenePix® Pro 7 数据采集和分析软件
标准显微镜玻片(1“ x 3“、25 x75 mm;0.9-1.1mm 厚)
软件
GenePix® 4300/4400 微阵列基因芯片扫描仪和 GenePix® Pro 微阵列分析软件组成一个完整的检测平台。扫描仪和软件的无缝通信确保其具有无与伦比的高效率的数据采集和分析能力, 能够实时获取样品信息。可选 Acuity® 微阵列基因芯片信息学软件, 组成完整的系统, 提供数据库存储、聚类算法、高级统计学和可视化功能。
技术参数 | |
zei大扫描面积 | 22 x 75mm |
zei高分辨率 | 4300A: 5µm, 4400A:2.5µm |
扫描方法 | 顺序扫描;用户设置扫描顺序 |
光源 | 多达 4 个激光器(全部为内置);488nm, 532nm, 594nm, 635nm |
激光器设置 | 能量用户可调, 范围在 5-100% 之间(1% 增加) 发射滤光片:16 位用户可选滤光片转轮 |
检测器 | 光电倍增管 (PMT) , 自动增益和手动增益调节设置 |
zei佳聚焦位置 | 可在 -50 至 +200μm 之间调整(1μm 递增) |
光路 | 非共聚焦 |
发射滤光片 | 请参考下面“配置”一节 |
扫描方法 | 顺序扫描 |
扫描时间: | 全面积4 分钟/单通道, 10μm 分辨率 |
分辨率 | 4300A-可在 5-100μm 之间调节, 4400A-可在 2.5-100μm 之间调节 |
数字分辨率 | 16 位 |
图像格式 | TIFF格式单图或多图 |
动态范围 | SNR > 3 时, 4 个数量级 |
旋转均匀性 | 小于 ±4% 非均匀性 |
图像类型 | 单图像或多图像 TIFF |
条码阅读 | 基于图像的条码读码器;支持所有一维和二维条形码 |
一般参数 | |
尺寸 (cm) | 43cm (16.9“) x 65cm (25.6“) x 34cm (13.4“)(宽x深x高) |
重量 | 45 kg (99 lbs) |
电源 | 85 - 264VAC (110 - 340VDC) 通用电源 |
线路频率 | 50-60Hz |
功率 | 150W |
保险丝 | 2.0A(慢),5 x 20mm |
尺寸 (in) | 16.9(宽)×13.4(高)×25.6(深) |
计算机接口 | USB2.0 |
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产品 | 货号 |
GenePix 4300A 基因芯片扫描仪包括 GenePix Pro, 532nm 绿色激光器和 635nm 红色激光器 | GENEPIX 4300 |
GenePix 4400A 基因芯片扫描仪包括 GenePix Pro, 532nm 绿色激光器和 635nm 红色激光器 | GENEPIX 4400 |
GenePix Pro 软件 v7 许可证 | 5004757 |
Acuity 微阵列基因芯片信息管理软件 | ACUITY PTO |
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