1974年Golafield 首先报告输血后非甲非乙型肝炎。1989年英国科学家迈克尔·侯顿(Michael Houghton)和他的同事们测出了病毒的基因序列，克隆出了丙肝病毒，并命名本病及其病毒为丙型肝炎（HepatitisC）和丙型肝炎病毒（HCV）。由于HCV基因组在结构和表型特征上与人黄病毒和瘟病毒相类似，将其归为黄病毒科HCV。
2017年10月27日，世界卫生组织国际癌症研究机构公布的致癌物清单初步整理参考，丙型肝炎病毒（慢性感染）在一类致癌物清单中。
