施一公组:人源PKD1和PKD2复合物的结构

  在“Structure of the human PKD1/PKD2 complex”文章中,施一公组专注的是一种常见遗传病——常染色体显性遗传多囊肾病(ADPKD)。这一疾病主要关联两个基因突变,即pkd1和pkd2。研究团队首次报道了多囊肾病相关蛋白PKD1和PKD2复合物整体近原子分辨率的冷冻电镜结构。

  常染色体显性遗传多囊肾病是慢性肾脏病的重要诱因之一,发病率为1/400-1/1000,全球约1200万患者深受这一疾病的影响。约50%患者会发展到终末期肾功能衰竭,需要进行异源肾脏移植或者终身血液透析治疗。我国约有150万此疾病患者,每年都有数以万计的患者苦苦等待无偿捐献的肾源或者通过无休止的透析维持生命。ADPKD不仅给患者造成严重的身体和精神上的折磨,同时给患者家庭带来沉重的经济负担。

  人源pkd1基因定位于16号染色体,编码了长度为4302个氨基酸包含11次跨膜螺旋的蛋白PKD1。而由pkd2编码的PKD2蛋白是PKD1的伴侣分子,对PKD1的折叠、在细胞器间的转运、和蛋白成熟具有极其重要的作用。

  施一公组利用冷冻电镜技术,获得截短的人类PKD1/PKD2复合体结构,分辨率达到3.6 Å。他们发现,PKD1和PKD2蛋白会形成一个独特的一比三复合物 ( 1 PKD1: 3 PKD2 )。具体而言,PKD1包含一个电压门控性离子通道(VGIC),通过与PKD2相互作用形成一个非规范的TRP通道体系结构。这一过程中,PKD1中的S6螺旋会在中间断裂,形成S6a和S6b两段。除了VGIC之外,PKD1还有一个5-TM结构域和一个胞质PLAT结构域。

图1:A.人源PKD1和PKD2蛋白的拓扑结构示意图。B.人源PKD1和PKD2蛋白复合物结构;C.人源PKD1独特的通道结构域。(图片来源:清华大学生命科学学院)

  这些结构的解析为PKD蛋白功能的研究建立了一个框架,并进一步为常染色体显性多囊肾病的病因以及治疗对策提供新的线索。

  颜宁组:人源Ptch1蛋白的冷冻电镜结构

  Hedgehog ( Hh )信号通路在胚胎发育中很重要,它的过度活跃与癌症有关。该通路的核心是一种被称为Patched 1 (Ptch1) 的膜受体。它间接抑制一种称为Smoothened的G蛋白偶联受体。当Ptch1结合分泌的蛋白Hh时,这种抑制得到缓解,通路打开。

  颜宁课题组报道了人类Ptch1的冷冻电镜结构,Ptch1分别以3.9 Å和3.6 Å的分辨率与人类Sonic hedgehog ( ShhN )的N末端结构域复合;利用这些冷冻电镜结构,该课题组观察到了Ptch1的12个跨膜结构域以及两个细胞外结构域ECD1与ECD2。

  此外,他们还发现两种结构中都存在两种类固醇状的密度,通过进一步结构导向的突变分析表明,ShhN和Ptch1之间的相互作用依赖于类固醇。类固醇结合缺陷Ptch1突变体的结构显示明显的构象重排。

  人类Ptch1及其与ShhN的复合物的结构揭示了Ptch1和ShhN之间识别的分子基础;同时Ptch1中两个类固醇结合位点的鉴定也为未来研究Hh通路建立了重要的框架。

相关文章

科学家开发冷冻电镜颗粒挑选新方法

人工智能赋能生物学再获新进展。中国科学院生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心与中国科学院自动化研究所多模态人工智能系统实验室杨戈团队合作,以人工智能技术赋能原位结构生物学,提出了一种基于弱监督......

研究提出基于弱监督学习的冷冻电镜颗粒挑选新方法

生物大分子的结构与功能随着细胞生理状态的变化而不断进行动态调整。原位结构生物学是在接近自然生理状态下研究生物大分子结构和功能的科学。原位冷冻电镜技术(Cryo-ET)以高分辨率和在接近生理条件下观察样......

研究提出基于弱监督学习的冷冻电镜颗粒挑选新方法

生物大分子的结构与功能随着细胞生理状态的变化而不断进行动态调整。原位结构生物学是在接近自然生理状态下研究生物大分子结构和功能的科学。原位冷冻电镜技术(Cryo-ET)以高分辨率和在接近生理条件下观察样......

我国科研人员提出冷冻电镜颗粒挑选新方法

“人工智能+”赋能科学研究有新进展。记者12日从中国科学院自动化所获悉,该所和中国科学院生物物理所等单位的科研人员以人工智能技术赋能原位结构生物学,提出了一种基于弱监督深度学习的快速准确颗粒挑选方法D......

我国冷冻电镜再发Nature三维结构解析免疫机制

10月2日,《自然》杂志在线发表了我国科学家的一项关于免疫系统如何发挥作用的重要成果。通过海量的实验与计算,来自中国科学院物理所、中国医学科学院等单位的研究人员,成功解析与原核短Ago系统相关的高分辨......

喜报|PNAS:颜宁团队发布2023年首个研究成果

电压门控钠通道Nav1.6在中枢神经系统(CNS)神经元放电中起着至关重要的作用。Nav1.6的功能异常可能导致癫痫等神经系统疾病。因此,Nav1.6的特异性抑制剂具有治疗潜力。2023年1月25日,......

2023年,颜宁团队首个研究成果发表!

电压门控钠通道Nav1.6在中枢神经系统(CNS)神经元放电中起着至关重要的作用。Nav1.6的功能异常可能导致癫痫等神经系统疾病。因此,Nav1.6的特异性抑制剂具有治疗潜力。2023年1月25日,......

1180万元|北师大珠海校区采购这家冷冻电镜

近日,北京师范大学珠海校区发布“北京师范大学珠海校区理工实验平台场发射透射电子显微镜(生物电镜)、等离子体聚焦离子束扫描电镜采购(包二)”中标,花费1180万元采购赛默飞冷冻聚焦离子束主机和Sante......

Cell:颜宁团队破解药物联合使用的致命副作用机制

抗病毒药物索非布韦(sofosbuvir)与抗心律失常药物胺碘酮的药物相互作用已被报道可引起致命的心跳减慢。据报道,Sofosbuvir及其类似物MNI-1可增强胺碘酮对心肌细胞钙离子处理的抑制作用,......

1.5亿预算,光明科学城技改及零星增项工程开启

近日,光明科学城发布《光明科学城启动区土建工程项目技改及零星增项工程》,欲采购冷冻电镜、猴笼、核磁屏蔽设备等多项相关系统,涉及金额1.5亿。据悉,该项目建设单位为同济大学建筑设计研究院(集团)有限公司......