发布时间:2019-05-20 23:18 原文链接: 人类基因组测序或将只需数分钟

来自伦敦帝国理工学院的科学家正在开发一种技术,它能够在几分钟内完成个人基因组的测序,且费用比目前的技术要低得多。研究人员已经将这项原型技术申请专利,其研究成果发表在近期的《纳米快报》(Nano  Letters)杂志上。 

   在这个新研究中,研究人员证明能在50nm孔中利用电荷高速推动DNA链。当DNA链出现在芯片后面时,它的编码序列被一种电极隧道接头(tunnelling  electrode  junction,生物通译)读取。电线之间的2nm间隔支持一种电流,它能与每个碱基的不同电信号相互作用。然后,一台强大的计算机能够解析碱基的信号,以构建出基因组序列。 

   一直以来,因纳米孔测序的高速和高通量,它被认为是DNA测序技术的重大进步。在典型的纳米孔实验中,生物分子在电力驱动下穿过一个外加电场的纳米孔。这导致孔内离子电流的特征性阻断。通过分析,能提取出有关分子性质的一些信息,如长度、成分以及与其他分子的相互作用。但是,目前基于粒子电流阻断或荧光的检测似乎还缺乏时空的分辨率,不能获得结构信息。 

   而另一种基于DNA的隧道运输的检测方法有望打破这些限制。因其源于量子力学,隧道电流随距离迅速衰减,从而提高空间分辨率,还提供了分子的特异性。 

   帝国理工学院化学系的Emanuele  Instuli博士解释了研究时面临的挑战:“直到现在还很难精确对齐接头和纳米孔。此外,对这种尺寸电线的改造接近原子规模,实际上已达现有仪器的极限。然而,在实验中,我们能够让两个铂电线进入电极接头,其间隔足够小,让电流能够通过。” 

   研究人员通过隧道光谱学鉴定出有功能的隧道装置,随后第一次证明能在纳米孔平台上同时进行隧道检测和DNA分子的离子电流检测。这是迈向超快DNA隧道测序的重要一步。 

   与现有技术相比,这项技术有几个明显优势:纳米孔测序很快、很简单;硅芯片比目前使用的一些易损材料更耐用,它们能够处理、洗涤、并重新使用很多次,而完全不会折损其性能。 

   作者之一,化学系Joshua  Edel博士谈到:“与目前的技术相比,这个装置能够带来更廉价的测序:只需几美元而已。我们还未试过全基因组测序,但是初期实验表明理论上能够在几分钟内完成人类基因组的全基因组扫描。它显然快得多,更可靠,且有望放大成一种装置,每秒钟读取1千万个碱基。”

相关文章

避菌核病,这项研究让油菜更艳丽

实验室里培育的油菜花课题组供图近日,《植物通讯》上在线发表了题为《利用CRISPR编辑BnaIDA基因创建抗裂角、花器官不脱落和避菌核病甘蓝型油菜新种质》的论文。该研究利用CRISPR/Cas9系统成......

被氯酚污染后鱼类“女宝”更多的分子机制获揭示

2,4-二氯酚通过雌激素受体ESR2a依赖的信号途径导致斑马鱼原始生殖细胞数量增加兰州大学供图氯酚作为化工原料被广泛使用于工农业生产和日常生活中,为水环境普遍存在的一类持久性有机污染物。氯酚类化合物可......

因美纳持续推动“加速器计划”,新投资6家新创业公司

因美纳近日表示,其因美纳“加速器计划”已投资了来自世界各地的六家新创业公司。这些公司包括AcrobatGenomics,这是斯坦福大学的一个衍生公司,它使用高通量CRISPR基因编辑来填补其新疗法的管......

科学家鉴定出“好斗”抑制基因

美国索尔克研究所科学家的一项新研究确定了大脑中的一个基因和一组细胞,它们在抑制果蝇的攻击性方面起着关键作用。该研究结果7日发表在《科学进展》上,或有助于解释帕金森病等疾病——帕金森病有时会导致行为改变......

四川农大在白三叶原花青素生物合成机制研究获进展

白三叶是世界范围内广泛栽培的优质豆科牧草,其营养价值高、蛋白质含量丰富,为各种畜禽所喜食。然而,白三叶原花青素含量极低,家畜过多单一采食后,蛋白质易在瘤胃中迅速发酵水解,导致大量气体和泡沫形成,引起臌......

灯塔水母保持永生的长寿基因被找到了

北京8月30日,据英国《新科学家》网站29日报道,西班牙科学家通过比较两种相似水母的DNA,发现了可阻止和逆转永生水母衰老的基因。研究人员称,这一基因可能与人类衰老有关,最新研究有望为再生医学以及治疗......

基因揭示人类骨盆如何进化以适应直立行走

与大猩猩和黑猩猩的骨盆(左、中)相比,人类的骨盆是弯曲的并向外旋转,以支持直立行走。图片来源:TERENCECAPELLINI宽而呈盆状的骨盆是人类的标志性物理特征,没有它,我们就不能直立行走,也不能......

天津工生所在维生素工业菌种基因编辑方面取得进展

苜蓿中华根瘤菌含有维生素B12的全部合成基因,可以高效合成维生素B12,但其同源重组效率低,缺乏有效的基因编辑工具,严重限制了菌种的改造。因此,亟需在苜蓿中华根瘤菌中建立高效的基因编辑工具。中国科学院......

英国生物银行在GWAS中发现了与人类特征的新关联

根据欧洲分子生物学实验室欧洲生物信息学研究所的一对研究人员的一项研究,一套新的分析工具使系统地搜索拷贝数变异与复杂的人类特征或条件之间的联系成为可能。“我们提出了一个强大的CNV到表型发现过程,该过程......

基因检测并非万能,5000人测试10.9%漏检

一项新的研究发现,对疑似患有心肌病或心律失常的患者进行更全面的基因检测会导致额外的诊断,而这些诊断可能会因疾病特异性检测而被遗漏。西北大学的研究人员指出,通过更广泛的测试提高诊断率的可能性与收到不确定......