发布时间:2018-11-12 17:27 原文链接: 北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数据库LncBook、多物种全基因组核小体定位图谱数据库NucMap以及一篇介绍大数据中心整体资源建设进展的文章。

  自成立以来,BIGD面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,围绕国家精准医学和重要战略生物资源的组学数据,建立了针对原始数据递交、存储与共享的数据库GSA,基因组变异数据库GVM,基因组归档数据库GWH,基因表达数据库GEN,DNA甲基化数据库Methbank,基于维基的生物学知识库Science Wikis,大数据挖掘与分析的工具和方法的数据库Biocode。在完成了基础数据库资源建设之后,又进一步开发了LncBook、EWAS、EDK、PED等一系列针对不同研究领域的专业数据库。这些特色数据库的建设完成将更有助于生物大数据的利用与转化,真正实现了BIGD将数据存好、管好、用好的目标。

  核酸研究期刊每年发布一次全球数据中心整体建设情况,自2016年至今,连续三年发布北京基因组所生命与健康大数据中心资源建设情况,并在今年一月的数据库专刊中将该中心评价为国际重要数据中心之一。


相关文章

一文速览!10月国内外15家生物药企融资超40亿!

据不完全统计,10月份,共有15家国内外创新生物药企完成了融资事件,总金额超40亿人民币。从融资轮次来看,早期融资仍占多数,其中B轮以前融资占比超过75%,仅有2家企业完成B轮融资。从融资金额来看,披......

大脑共变模式揭秘基因/心理与疼痛敏感性之谜

疼痛是不愉快的主观体验,但对疼痛感知的敏感性存在较大的个体间差异。探究疼痛敏感性个体差异的产生机制,对于阐释慢性疼痛的易感性并进行个性化疼痛管理具有重要意义。已有研究提示,疼痛敏感性的个体差异可能受到......

Cellectis股价飙升超180%!阿斯利康又投2.45亿

今日,阿斯利康与Cellectis达成了一项利润丰厚的合作协议,将向这家法国生物技术公司投资2.45亿美元,进一步加强了其致力于开发细胞和基因疗法产品的承诺。该消息令Cellectis的股价在周三盘前......

卫健委发布《卫生健康信息数据元目录 第1部分:总则》等34项卫生行业标准

近日,卫健委发布《卫生健康信息数据元目录第1部分:总则》等34项推荐性卫生行业标准,,涉及总则、标识、实验室检查、医学诊断等项目,详情如下:标准编号标准名称代替标准编号WS/T363.1—2023卫生......

清华脑与智能实验室团队:揭示基因信息如何利用细胞形成组织空间形态

近日,清华大学脑与智能实验室与北京大学前沿交叉学科研究院组成的国际科学家团队开发了一种新的计算方法,可以利用单细胞转录组数据重构细胞的空间组织。研究表明,这种名为DeNovoCoalescentEmb......

故意的还是不小心?诺奖得主被曝14篇论文数据异常

ThomasC.Südhof于2013年与JamesRothman和RandySchekman共同获得诺贝尔生理学或医学奖,以表彰他们发现了调节细胞内主要运输系统——囊泡运输的机制的突出贡献。在202......

病毒入侵时,生命体如何自我保护?

在生命体内存在在这样的一种英雄主义:细菌在杀死入侵病毒的那一刻“壮烈牺牲”,与其“同归于尽”,以完成保护生命体的重任。早在20世纪50年代,科学家们就通过间接的手段检测到了一种同归于尽的自我保护行为,......

国家药监局:已批准100余个细胞和基因治疗产品开展临床试验

10月7日,国家药监局网站发布《关于政协第十四届全国委员会第一次会议第02469号(医疗卫生类215号)提案答复的函》(以下简称《答复》)。针对丁列明委员提出的《关于加强精准医学时代个体化定制药物研发......

农科院油料所:发现花生黄曲霉抗性关键候选基因

近日,中国农科院油料所花生花遗传育种创新团队有效破解了花生黄曲霉抗性机理,并发掘出了关键候选基因,为抗性育种提供了重要的理论指导,相关学术成果发表在国际期刊《前沿研究杂志》(JournalofAdva......

一种全新的酶可对抗寄生的基因组TE序列

科学家们发现了一种名为PUCH的酶,它对于阻止寄生DNA序列在我们基因组中的传播至关重要。这一发现可以让我们深入了解我们的身体如何识别和对抗内部威胁(如基因组寄生虫)和外部威胁(如病毒和细菌)。德国美......