婴幼儿肝细胞癌的临床症状无特异性，常有食欲不振、厌食、体重减轻或不增加，呕吐、腹痛较少见。晚期可出现黄疸、腹水。腹部膨隆是婴幼儿肝细胞癌患儿的常见症状，婴幼儿肝细胞癌患儿的父母常会注意到或通过体检发现上腹包块，绝大多数病儿因腹部肿大而就诊。
婴幼儿肝细胞癌的体征主要有面色苍白、腹部膨隆、肝脏肿大，查体在右上腹可触及肿大的肝脏，质地坚硬，表面光滑，大者可达盆腔，可触及瘤结节并伴有触痛。晚期可出现黄疸、腹水。其他症状包括发育不良、易激惹等。
部分婴幼儿肝细胞癌男性患儿以性早熟为始发症状，发生率为2.3%，表现为生殖器增大，声调低沉及阴毛生长等,原因是肿瘤细胞可合成人绒毛膜促性腺激素（HCG）。
