由于HPLC分离过程涉及物理化学作用、流体动力カ学、热力学过程等，因而对固定相基质材料的物理化学性质有比较严格的要求。液相色谱固定相基质可分为无机氧化物、有机聚合物和无机有机杂化材料三种类型。杂化基质作为一类新型液相色谱固定相基质，近两年发展较快，但大多尚处于研究阶段。无机和有机两类基质的主要特征比较见表1。
表1 液相色谱主要固定相基质比较
项目 | 无机基质 | 有机基质 |
种类 | 氧化硅、氧化铝、氧化锆、氧化钛、氧化铈、氧化钍、氧化镁等无机氧化物及复合无极氧化物、分子筛、羟基磷灰石、石墨化碳等 | 聚羟基甲基丙烯酸丙酯（PHAM）、2-羟基甲基丙烯酸与二甲基丙烯酸酯的共聚物（HEMA）、聚乙烯醇（PVA）等亲水性聚合物；聚苯乙烯-二乙烯基苯交联共聚物（PS-DVB）、聚二乙烯基苯（DVB）、聚甲基丙烯酸酯等疏水性聚合物或烷基配体改性PS-DVB、PHAMHEMA、PVA等；葡聚糖、琼脂糖、纤维素、糊精等 |
优点 | 机械强度高，溶胀性小，耐高压、可通过表面改性引入多种功能基 | 化学稳定性好，使用pH值范围宽；表面性质均匀，溶质和固定相之间较少发生非特征性吸附；蛋白质等生物活性物质的回收率高，具有较好的重复性和独特的选择性；易获得较高的柱容量（吸附容量、离子交换容量等） |
缺点 | 表面性质比较复杂，容易导致溶质分子非特征性吸附和多保留机理，改性固定相稳定性和重复性不够理想 | 固定相机槭强度不高，随流动相中有机溶剂变化时会溶胀，微生物存在时易降解，耐高温性能较差，色谱柱效比较低 |
实际应用中很难得到完全理想的固定相基质，一般需要根据分离分析的具体要求，综合考虑与权衡后进行选择。
