本病预后和虫株毒力及受感染者的感受性有关。
本病先天性的预后多较严重，不治疗的病例的病死率约12%。最常见的后遗症为视网膜脉络膜炎，其次为脑内钙化、精神障碍、脑积水、小脑畸形和抽搐等。
本病获得性如及时治疗，预后多较好。中等度急性获得性如不治疗，淋巴结肿大等症状可持续数月，但多无不良后果而自然消退。特异性治疗可以缩短病程。多器官被侵犯时，特别有免疫抑制的病例，后果非常严重。
