放射性同位素标记的DNA序列测定分析

DNA样品

硅化液 PAGE胶 质粒DNA 碱变性液 T7测序试剂盒 无水乙醇

注射器 测序板 电泳仪 离心机

1.  测序板硅化，流水、ddH2O洗，无水乙醇洗，晾干。

2.  灌胶：装好测序板，玻璃板以15-30°角度倾斜放置，用50ml注射器将凝胶灌到两块玻璃之间，将鲨鱼齿梳子的平端插入胶的上缘，深约0.5-1cm。夹好，将测序板放水平。聚合约3hr后预电泳。

3.  预电泳：按照说明要求安装好电泳装置，在上槽和下槽注入1×TBE。设置温度50℃，功率100W，时间约30min。

（同时准备测序反应）

4.  质粒DNA 双链碱变性：DNA 3-5μg溶于32μl ddH2O中，加2N NaOH 8μl，混匀，室温静置15min。加3M NaAc 7μl，无水乙醇120μl，混匀，-20℃放置30min。离心12000g× 15min，弃上清，70%乙醇500μl洗一次，离心12000g×7min。弃上清，晾干沉淀，10μl灭菌ddH2O溶解。

5.  模板与引物复性：加2μl测序引物、2μl Annealing buffer， 混匀，稍稍离心，65℃温育 5min，立即放置于37℃10min，室温5min以上。

6.  标记反应：加 3μl labeling mixture 、1μl相应放射性同位素（10μCi）、2μl T7测序酶（使用前以稀释液1∶5稀释），混匀，离心，置37℃5min。

7.  预先准备四个0.5ml微量离心管，标上A、C、G、T，分别在其中加入2.5μl的ddATP、ddCTP、ddGTP、ddTTP。

8.  链终止反应：在A、C、G、T四个微量离心管中分别加入反应液4.5μl，37℃ 5min。加入stop solution 5μl，短暂离心。

9.  上样：关上预电泳电源，冲洗胶平面，将鲨鱼齿插入胶平面中约1-2mm形成加样孔。将四个反应管置80℃ 2min。立即取1.5-2μl加到加样孔上。

10．电泳: 50℃，100W，电泳2.5hr后，暂停电泳，在预留孔二次上样后，继续电泳2.5hr。

11．下胶：停止电泳，取下测序板，倒掉电泳缓冲液。拆开测序板，凝胶应粘在未硅化的的玻璃板上。裁一张比胶稍大一些的滤纸，平铺在胶上，掀起滤纸，凝胶就被一起掀起。

12．压片：将凝胶盖上保鲜膜，用monitor测读放射强度，以估计曝光时间。在暗室中覆上X光片，置暗夹中，-70℃放射自显影。

13．洗片、读片：取出暗夹，回到室温。经D72显影、酸性定影液定影，水洗，晾干。在X光片灯上读出序列。

1. 测序板清洗、硅化的好坏直接影响灌胶及下胶。处理不好时容易导致灌胶时气泡的产生，下胶时则易使电泳胶损坏。

2. 灌胶时要避免胶的渗漏；注射器将凝胶灌到两块玻璃之间时，注意速度的控制，防止气泡的产生。

3. 测序反应及电泳上样时要注意小心操作，防止放射性同位素污染，同时要加强整个后续实验过程中自身的防护。

4. 规范、妥善处理放射性同位素接触物品及废弃物。