苔藓植物的生态学特征不同于高等植物，所以对于它们的生理生态研究是十分重要的。对于 苔藓植物的配子体体积、枝直根、枝条长度、分枝数、枝尖数(芽体等)等性状会随着环境条件的变化而发生一定程度的变化，但是传统的方法无法定量地获得这些 性状的数据.近年来对于植物根系的测定一般可以采用根系分析系统进行测定，也为研究苔藓植物的遗传性稳定性作出了很大的贡献。
WinRHIZO是一套专业的根系分析系统软件，在获得扫描图像后通过该软件能够快速简便地获得根系总长度、投影面积、表面积、平均直径、总体积、根尖数、根的分叉数、根系交叠数等指标少-泛运用十根系形态和构造研究.侧葫鲜类植物呈甸旬状，其整体形态、分枝特点等类似十被子植物中的根系.根系的形态特点可以用总长度、分枝数、突出数、投影面积、表 面积、直径、体积等参数进行描述，而侧葫鲜类的配子体枝条总长度、分枝数、表面积、枝(带叶)茎和枝的直径等与根须的有很强的对应性。
人们通过环境条件模拟发现借助根系分析系统，通过对不同环境条件下同一类群配子体形态参数的测定和分析，可以了解该鲜类植物的形态可塑性，结合生境指标，能够了解环境条件对侧葫类配子体形态的影响，或者一借助十形态上的变化，了解环境的变化情况.因此，根系分析仪在侧葫类植物的生理生态学研究上，具有应用潜力。