家族性高脂蛋白血症Ⅱb型（FCH）患者并发冠心病的危险性明显性增加，所以纠正高脂血症是很有必要的。治疗的第1步是采用饮食疗法。不过，许多FCH患者单用饮食疗法难达到理想的降低血脂的效果，常需要考虑应用药物治疗。
已报道用于治疗FCH的药物有：烟酸、纤维酸类、三羟基三甲基戊二酰辅酶A（HMG-CoA）还原酶抑制剂和鱼油。
烟酸类药物
能抑制VLDL合成，并使LDL生成减少，所以适应于治疗家族性高脂蛋白血症Ⅱb型（FCH），但该类药物的副作用较多。
纤维酸类衍生物
是治疗家族性高脂蛋白血症Ⅱb型（FCH）较为适合的药物。该类药物可显著地降低VLDL浓度，但降低LDL水平效果并不很明显。
HMG-CoA还原酶抑制剂
对家族性高脂蛋白血症Ⅱb型（FCH）具有良好的降脂作用，这类药物不但能显著降低血浆胆固醇水平，也能使血浆三酰甘油浓度明显下降。
鱼油
能抑制VLDL的合成,对治疗家族性高脂蛋白血症Ⅱb型（FCH）有一定的作用。此外，鱼油还能改善餐后高三酰甘油血症。不过鱼油的治疗剂量要求较大，才能获得有效作用。小剂量鱼油（<5g/d=一般无明显降血脂作用。
胆汁酸螯合剂（树脂）
如氯贝丁酚不适合用于治疗家族性高脂蛋白血症Ⅱb型（FCH），因为这类药物使VLDL水平升高，可加重高三酰甘油血症。