皮肤干细胞的分化发育受多种因素，主要分为细胞内调控和细胞外调控两大类。
细胞内调控主要指细胞内的一些结构蛋白、结构因子、转录因子、端粒酶等通过各种方式对干细胞的增殖分化进行调控；
细胞外调控是指干细胞所处的微环境及基板的变化，以及相邻细胞对干细胞的影响都会影响皮肤干细胞的增殖分化。
