1，用于显微切割的组织切片可以是冰冻切片、石蜡包埋的组织切片或细胞涂片。切片的厚度可为4~10µ；m，冰冻切片需经甲醛或乙醇固定。
2，用于显微切割的组织切片还必须染色，以便于进行目标细胞群或单一细胞的定位。染色可以用普通方法，如1%~2%的甲基绿、0.1%的核固红、3.6%的瑞氏染液或2%的苏木素等，也可用免疫组织化学染色，如要切割霍奇金淋巴瘤组织切片上的R－S细胞时，可用CD15或CD30单克隆抗体染色进行靶细胞示踪。
3，显微切割的方法有手工操作法和激光捕获显微切割(laser capture microdissection ,LCM)技术，后者的基本原理是：将组织切片放在倒置显微镜的载物台上，并在切片表面覆盖一层乙烯乙酸乙烯酯(ethylene vinyl acetate ,EVA)薄膜。激光束从切片的上方垂直射下来，使其光路与显微镜聚光器的光路共轴，光斑正好落在显微镜视野中心，即要切割的区域。该区的EVA膜揭起来，与之相连的细胞也随之被完好地从切片上切割下来；将带有细胞的EVA膜放入试管内经蛋白酶消化使细胞与膜分开，同时也将细胞裂解，获得待提物质，如DNA，RNA或蛋白质等。