1）直接涂片：萋-尼（热染法）或Kinyoun（冷染法）抗酸染色，找抗酸菌。
2）集菌涂片：主要方法有沉淀集菌法和漂浮集菌法。
3）荧光显微镜检查法：金胺“O”染色，在荧光显微镜下分枝杆菌可发出荧光。
