脑炎；脑病；麻疹包涵体脑炎(MIBE)（参见【禁忌】)；亚急性硬化性全脑炎(SSPE)；格林-巴利综合征(GBS)；热性惊厥；无热性惊厥或癫痫发作；共济失调；多发性神经炎；多发性神经病变；眼性麻痹；感觉异常。
上市后应用的数据表明，在接种后30天内，极少出现在时间上与接种相关的明显中枢系统反应，如脑炎和脑病。但提示以上一些病例可能由麻疹疫苗引起。接种麻疹活病毒疫苗之后出现此类严重的神经系统病症的风险，远低于野生型麻疹病毒引起的脑炎和脑病(1/2000)。
在过去的25年中（1971-1996），对全球使用了2亿多人次的M-M-R和本品进行了上市后监测，结果表明，诸如脑炎和脑病等严重不良事件一直罕见报道。
对于从未感染野生型麻疹但接种了麻疹疫苗的儿童，有发生亚急性硬化性全脑炎（SSPE）的报道，这些病例中的一部分可能是由于在出生后的第1年中得过未确诊的麻疹感染或接种过麻疹疫苗。根据估计的在本土范围内麻疹疫苗分布情况，麻疹疫苗接种导致的SSPE相关病例的发病率约为1/100万。它远远低于因野生型麻疹引发的SSPE（发病率6～22/100万）。根据CDC进行的回顾性病例对照研究结果，认为麻疹疫苗的总体作用是通过预防内在SSPE高风险性的麻疹，以达到预防SSPE的目的。
接种麻疹、腮腺炎、风疹疫苗后已有无菌性脑膜炎病例报道。尽管已证实腮腺炎疫苗Urabe株与无菌性脑膜炎之间的因果关系，但尚无证据能表明本品中Jeryl Lynn腮腺炎疫苗与无菌性脑膜炎之间存在相关性。
