苏晓泉团队开发出基于微生物组大数据的疾病检测方法

微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力,但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢?中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法,为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems(美国微生物学会会刊)。 作为与生俱来、无处不在的“小伙伴”,微生物组与人体、环境的健康有着千丝万缕的关联。同时,菌群检测具有非侵入性、可量化、可预警等优势。因此,如何用菌群来判断和识别人体或环境的健康状态,一直是精准医学和大健康的热点问题之一。但是,作为一种疾病诊断手段,菌群面临着三个关键的挑战。 首先,“漏诊”问题:现有的检测手段通常只针对特定疾病,并依赖于该疾病已知的标识微生物来构建检测模型。然而很多疾病尚无明确标识物,而且同一种疾病在不同人群中的生物标识物种经常不尽一致,因此难以普适性地判断待检样本是否健康。其次,“误诊”问题:同一种生物标识经......阅读全文

世界微生物数据中心落户微生物所

  在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上,经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过,中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出,成为世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持单位。   W

微生物所发表中国微生物组数据平台

  10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

有毒微生物助力物种大灭绝

一般来说,科学家们认为,大约 2.5 亿年前,即二叠纪末期,西伯利亚火山喷出的温室气体主要推动了大规模灭绝事件。这些气体导致极端变暖,进而导致 80% 的所有海洋物种以及许多陆地物种灭绝。直到现在,科学家们还无法确切解释高温是如何导致这些物种死亡的。近日,美国加州大学河滨分校领导的一项研究表明,高温

农业微生物-将迎大突破

“现在俺愁的不是销量,愁的是产量供不上。”河南省新蔡县牛湾村益生菌水稻种植基地负责人彭东文乐呵呵地说,“俺的生态稻,在4月份开始种秧时就全部预售完了。”前不久,河南省新蔡县牛湾村益生菌水稻种植基地的“丰收季”如期举办。得益于益生菌技术的使用,这种水稻在生长周期内,病害、虫害率极大降低,不但减少了化肥

农业微生物-将迎大突破

  “现在俺愁的不是销量,愁的是产量供不上。”河南省新蔡县牛湾村益生菌水稻种植基地负责人彭东文乐呵呵地说,“俺的生态稻,在4月份开始种秧时就全部预售完了。”  前不久,河南省新蔡县牛湾村益生菌水稻种植基地的“丰收季”如期举办。得益于益生菌技术的使用,这种水稻在生长周期内,病害、虫害率极大降低,不但减

三大净化水质微生物

  水族馆、养鱼厂、育苗厂等人造水体的封闭循环系统中的关键技术与设备是作为净水微生物的“生物包”。当今生物包中的微生物有以下三大类:   1.土著微生物   是在当时当地水源水域中土生土长的微生物,在水中或固着在生物包的填料上形成生物膜,是在自然状态下形成的。   传统的生物包不是利用人工培育

2014大数据与数据科学进展主题论坛在京举行

  12月27日,2014年大数据与数据科学进展主题论坛在京举行。包括徐宗本等5位院士在内的来自学界、商界和政府部门的60多名专家学者参加了论坛,围绕今年国际上大数据与数据科学的最新进展和面临的挑战展开了研讨。  本次论坛由中国计算机学会主办,中国计算机学会大数据专家委员会、中科院虚拟经济与数据科学

2022大数据科技传播奖揭晓

由中国科技新闻学会、湖南省科协、衡阳市人民政府联合开展的2022年大数据科技传播奖评选活动近日揭晓,共评出特殊贡献奖7名,作品奖9件,团体奖13个,个人奖28名。本次评选活动经郭华东、李兰娟、褚君浩等院士担纲的大数据科技传播奖评审委员会严格评选审定,依照《大数据科技传播奖奖励办法》规定,评选中国工程

三大数据展现南水北调工程效益

新华社北京8月25日电 题:三大数据展现南水北调工程效益新华社记者刘诗平8月25日,南水北调中线穿黄工程通过水利部主持的设计单元工程完工验收。至此,南水北调东、中线155个设计单元工程全部通过水利部完工验收。据统计,如今南水北调工程累计调水超过560亿立方米、受益人口超过1.5亿人,充分展现了这一工

我国微生物大数据平台建设获进展

  近日,中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心团队题为World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia

首个国际ISO微生物数据标准正式发布

  微生物资源是国家的重要战略资源,微生物数据资源则是微生物资源共享和开发的关键环节,数据资源的丰富性、准确性和共享水平,决定着微生物学领域研究和应用的综合能力。  2020年11月9日,国际标准化组织生物技术委员会(ISO/TC 276)正式发布微生物资源中心数据管理和数据发布标准(ISO 217

郭华东:大数据+大科学=大发现

中科院遥感与数字地球所所长 郭华东院士   “大数据是财富,是资源,是科研的战略高地。大数据正在改变人们的研究方式,是人类认识自然和行星地球的新钥匙。”  这是中国科学院院士、中科院遥感与数字地球所所长郭华东于日前在北京召开的大数据与科学发现国际研讨会上做出的判断。从数据发展历史看,19世纪70年代

微生物组大数据搜索引擎入选中国医药生物技术十大进展

   目前,中科院青岛生物能源与过程研究所研发的“微生物组大数据搜索引擎”(Microbiome Search Engine; MSE)入选“2016年中国医药生物技术十大进展”。   微生物组(又称“菌群”)在人体中与生俱来,与人体健康息息相关。因此,对海量微生物组“大数据”的搜索与挖掘,有助于认

6大亮点!12所“双一流”高校就业数据大起底

  谈起应届毕业生就业的话题,双一流人才的去向是其中一个备受瞩目的风向标。  日前,清华、北大等12所双一流高校陆续发布了《2021年毕业生就业质量报告》。在刚刚过去的一年,面对疫情形势反复、行业政策调整等种种变局,应届研究生的就业方向产生了一些刻着鲜明“时代烙印”的新变化。  而对大多数高校毕业生

微生物“全球大搬家”人类“功”不可没

  随着城市化和高强度集约化农业的发展,人类正以前所未有的速度和规模改变着微生物的全球迁徙和分布。9月15日,《科学》杂志刊登了中科院城市环境研究所及国际合作者的一篇论文,系统阐述了微生物通过人与动物、污水及其他物质的流通在全球范围的迁徙及其环境与生态效应。   文章指出,污水的处理促进了微生物

-医疗大数据何去何从-听听几位大咖的前瞻

  当大数据遇上医疗,到底会产生怎样的火花?11月28-29日,2015中国医疗健康大数据峰会暨智慧医疗专家委员会年会在京召开,来自医疗界、产业界的专家学者们齐聚一堂,畅聊医疗大数据激起的改变以及日后的无限可能。  贵州省卫计委卫生信息中心主任严刚:建起国内首个大数据中心  国家发改委于2011年提

嵌入式大容量数据存储解决方案

方案简介随着高性能嵌入式微处理器价格的逐渐降低以及芯片级存储介质的存储密度的提高,采用以高性能嵌入式微处理器为系统核心,结合大容量存储芯片,实现高性能、低功耗、低成本、小体积的嵌入式大容量数据存储,具有无可比拟的优势…详细信息:成功案例某单位舰载信息黑匣子消防主机监控与采集终端应用背景随着32位嵌入

COD测定时数据不准,偏差大的原因

数据不准,偏差大:1、选用仪器的低量程档测量;2、氯离子的影响,如果水样中氯离子超过1000mg/L,可将水样稀释后测量;如果稀释后COD浓度很低,可能为试剂的问题,试剂过期或者保存不当变质,或者非原厂试剂;空白样的问题,空白样不准确对测量结果影响很大;蒸馏水不纯,或者选用其他类型水(如桶装水、矿泉

国际微生物大数据联合研究中心在京挂牌

  近日,国家“863”计划“微生物数字化信息系统集成关键技术研发”项目推进会在京举行。其间,由中科院微生物所、中科院上海生命科学研究院、上海生物信息技术研究中心等单位组成的国际微生物大数据联合研究中心挂牌。  随着信息技术的发展,我国微生物大数据研究步入世界前列。据主持“微生物数字化信息系统集成关

全球微生物组大数据搜索引擎上线

  日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。   微生物组,又称“菌群”。

世界微生物数据中心与泰国国家微生物资源保藏中心合作

  9月11日至15日,世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms,简称WDCM)主任、中科院微生物研究所信息中心主任马俊才研究员赴泰国国家基因工程及生物技术中心(National Center for Genetic Enginee

微生物培养箱三大适用范围

适用范围BD系列自然对流完全适合于微生物的培养、微生物加热及调节。BF系列尤其适合于试样有较高批量和产出量的应用场合。KB系列适用于在广阔温度范围内的复杂用途和交替温度的场合。可选附件内部防水电源插座连接到总开关,用于连接内腔里的辅助设备。PT100温度传感器原地或灵活机动安装,用于试验物料内温度精

微生物七大基本检测技术有哪些

微生物检验常规技术zhi包括七个项目,涉及培养基配制、消毒灭菌、微生物的分离纯化培养、接种、无菌操作、显微观察、染色、计数、菌种保藏及血清学检验等多项微生物基本技术。

微生物检验必须掌握的三大耐药机制

微生物检验必须掌握的三大耐药机制  你知道什么是微生物检验吗?你对微生物检验了解吗?下面是我为大家带来的关于微生物检验必须要知道的三大耐药机制的知识,欢迎阅读。   一、产生灭活抗生素的各种酶   1、 β—内酰胺酶(β-lactamase)  β—内酰胺类抗生素都共同具有一个核心β—内酰胺环,其基

微生物分类包括那七大类

  微生物按细胞结构特点,可将其分为三种类型:  ①非细胞型微生物:无典型的细胞结构,仅有核心和蛋白质衣壳组成,核心中只有RNA或DNA一种核酸,只能在活细胞内生长繁殖,病毒为其代表;  ②原核细胞型微生物:细胞的分化程度较低,仅有原始核质,呈环状裸DNA团块结构医|学教|育网搜集整理,无核膜和核仁

微生物所举办第二届世界微生物数据中心研讨会

  6月7日至8日,在中科院国际合作局和中科院生物局的支持下,由世界微生物数据中心(WDCM)、世界菌种保藏中心联合会(WFCC)、联合国教科文组织(UNESCO)、中科院应用微生物研究网络(RNAM)、中科院微生物研究所、国际科技数据委员会(CODATA)、亚洲微生物资源保藏和可持

2020年大数据产业规模将达千亿元

  大数据作为信息经济必备的战略资源,已成为引领信息时代的重要基石,云计算作为信息技术应用和服务模式创新的集合体,是支撑大数据深化应用的基础平台。为提升创新创业能力,疏解非首都功能、构建“高精尖”经济结构,昨日,市政府常务会审议通过《北京市大数据和云计算发展行动计划(2016-2020年)》。  该

手持式烟气流速仪大容量数据存储

一、产品概述DL-6600SG型烟气流速检测仪(以下简称检测仪)为便携式监测仪,广泛应用于锅炉、炉窑以及各种排风管道的气体流速、气体流量、气体动压、静压及温度等参数的测定。二、适用范围本仪器采用皮托管法测量管道中气体流速,可对各种锅炉、工业炉窑以及排风管道的气体流速、温度、压力等参数进行检测,仪器采

数据中心电力浪费大-行业有何办法应对?

  电力行业的浪费主要在两个部分,服务器利用不足和错误的激励方向,后者则主要出现在多租户数据中心。在多租户数据中心,激烈的对象应该是能源效率策略制定者以及能源费用支付者,NRDC建议采取措施来加速能源节省步伐及规模。  激励需要用对地方  虽然多租户设施被认为比自建设施更具备能源效率,但是NRDC表