对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析
贝勒医学院的研究人员近日对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析，并将结果发表在《Cell》杂志上。这种全面的研究策略有助于深入了解结肠癌，并有望推动早期诊断和新型疗法的开发。Bing Zhang博士 在贝勒医学院分子和人类遗传学教授Bing Zhang的领导下，研究团队生成了基因组和蛋白质组数据，并利用生物信息学工具开展分析。他们最终生成了第一份系统的目录，说明结肠癌肿瘤及癌旁正常组织所产生的蛋白质有何不同。 “我们不仅能够确认先前描述的结肠癌分子标志物，还能够发现肿瘤和正常组织之间的蛋白质差异，”Zhang教授指出，他是本文的共同通讯作者。 研究人员还发现，基因组和蛋白质组数据的结合大大提高了他们对结肠癌细胞的认识。“SOX9就是一个例子，”Zhang教授说，“基因组数据表明，SOX9是一个肿瘤抑制基因，因为它在结肠癌中经常发生突变，从而导致蛋白质无法产生或产量减少。” “不过，当我们观察蛋白质组数据，也就是癌症......阅读全文
对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析
贝勒医学院的研究人员近日对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析，并将结果发表在《Cell》杂志上。这种全面的研究策略有助于深入了解结肠癌，并有望推动早期诊断和新型疗法的开发。Bing Zhang博士 在贝勒医学院分子和人类遗传学教授Bing Zhang的领导下，研究团队生成了基因组和蛋白质组
基因组研究发现结肠癌发病机理
日本理化学研究所基因组序列分析项目负责人中川英刀和兵库县医科大学教授池内浩基的联合研究小组，对炎症性肠疾病转化结肠癌患者的全基因组进行解析，发现了结肠癌发病机理。该研究成果将于近日发表在美国《Oncotarget》科学杂志上。 图片来源源于网络 在日本，溃疡性大肠炎和克罗恩病等炎
基因组研究发现结肠癌发病机理
日本理化学研究所基因组序列分析项目负责人中川英刀和兵库县医科大学教授池内浩基的联合研究小组，对炎症性肠疾病转化结肠癌患者的全基因组进行解析，发现了结肠癌发病机理。该研究成果将于近日发表在美国《Oncotarget》科学杂志上。 在日本，溃疡性大肠炎和克罗恩病等炎症性肠疾病患者近年来数量激增，目
人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示出新的治疗策略
在一项新的研究中，来自美国国家癌症研究所、贝勒医学院、太平洋西北国家实验室、华盛顿大学、范德堡大学和得克萨斯大学卫生科学中心等研究机构的研究人员通过对来自患者的结肠癌组织产生的全部基因和蛋白的分析，对这种肿瘤有了更全面的认识，并指出新的癌症生物学机制和可能的新治疗策略。这项研究强烈支持对肿瘤组织
Cell：人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示新的治疗策略
近日，美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析，全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原，并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human Colon Can
植物组织制备基因组DNA实验
氯化铯法 CTAB法 实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则
植物组织制备基因组DNA实验
实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部， 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤 收取1
从动物组织提取基因组DNA
实验概要本实验以哺乳动物新鲜组织为材料，学习基因组DNA提取的一般方法。实验原理基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
2019年5月2日，Cell杂志报道了美国休斯敦贝勒医学院研究人员利用基因、转录、蛋白及翻译后修饰等多组学技术，对结肠癌/癌旁组织进行了系统、全面的分析，整合多组学结果为后续癌症治疗方案提供了新思路，同时也为生物标志物筛选、药物靶点、分子分型等研究工作奠定理论基础。实验背景结肠癌是世界上死亡率排名第
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
原文： Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities 原文链接： https://www.sciencedirect.com/science/article/
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA.真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
蛋白质组学之逆袭，深度注释基因组
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。 从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完
植物组织制备基因组DNA实验——CTAB法
实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部， 从而达到提取的目的。实验材料植物组织试剂、试剂盒CTAB液2-疏基乙醇TE高盐TE氯仿异戊醇仪器、耗材研钵离心机培养箱实验步骤1. 在所需量
整合基因组和组织学信息－基因组学公司联手开拓新前沿
10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学（spatial genomics）领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域，它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（三）
人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的，将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识，同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设，以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具，使得人类能够横跨癌症基因组
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（一）
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完成了对多种物
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（二）
针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵
黄种人将有首张基因组图谱
我国科学家绘制完成 有利实现个性化诊治 世界上第一个黄种人基因组序列图即将由中国科学家绘制完成，这项工作正在位于深圳市盐田区的深圳华大基因研究院内紧锣密鼓地进行着。 该研究计划被命名为“炎黄一号”。计划发言人叶佳说，以黄种人的基因组图谱为研究目标，将为黄种人的
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
组学期刊三巨头：《基因组、蛋白质组与生物信息学报》
近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄 从编委到现任执行副主编，美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，以下简称GPB）期刊结缘已近10年。前些年，该刊编辑部不时找他约稿子，以解“缺米之炊”
骨组织的蛋白质组学研究成果
邹汉法近年来广泛开展了蛋白质组学和多肽组学新技术新方法的研究，近两年来相关研究成果已在Mol. Cel. Proteomics(IF 9.876)，Angew. Chem. Int. Ed.(IF 9.596)，Nucleic Acids Research(IF 7.
植物组织制备基因组DNA实验——氯化铯法
利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中，染色体会发生机械断裂，产生大小不同的片段，因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作，如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓， 以保证得到较长的DNA。实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即
黄种人基因组图谱有望在深圳面世
记者昨天（２９日）获悉，人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深圳面世，并计划在今年高交会期间向全世界发布。为实现这一目标，目前，百余位深圳华大基因研究院科学家正在紧张有序地进行相关工作。 人类的基因图谱非常复杂，但破解人类的基因组图谱，对制药和医疗等方面的作用非常巨大。基因工程技
首张非洲人全基因组图谱问世
据《自然》杂志报道，2月6日，美国加州Illumina生物技术公司宣布，他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前，科学家已经对两位白人男性（James Watson和Craig Venter）和一位中国男性进行了全基因组测序，但从未对非洲人进行研究。因此，这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男
基因组测序新公司工作全靠机器人
CG公司的基因组测序工作完全由机器人完成工作人员正在蓝色幽暗的“车间”内操作检测设备 美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在，一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起，那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过，一家名为“整
－万人基因组计划里程碑成果
今天，《自然》（Nature）出版社公布了迄今为止最大规模的群体基因组测序成果。一系列描述这些数据的资源及应用的研究论文同时发布在Nature、Nature Genetics、Bioinformatics和Nature Communications杂志上。 罕见遗传变异是指群体中相对较少的人所
PNAS：特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”
近日，发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中，来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点，研究人员发现了一种新型特殊蛋白，其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性。 文章中，研究者对T细胞和B细胞的发育也进行了深入研究，这两种细胞均是保
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定