生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank， EMBL， DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT， PIR，OWL， NRL3D， TrEMBL等，蛋白质片段数据库有PROSITE， BLOCKS，PRINTS等，三维结构数据库有PDB， NDB，BioMagResBank，CCSD等，与蛋白质结构有关的数据库还有SCOP， CATH， FSSP， 3D-ALI， DSSP等，与基因组有关的数据库还有ESTdb，OMIM，GDB， GSDB等，文献数据库有Medline， Uncover等。另外一些公司还开发了商业数据库......阅读全文
生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank， EMBL， DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT， PIR，OWL，
成都生物所开发新型生物信息学软件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年来，随着测序技术的快速发展，动物（尤其是非模式动物）全基因组数据（WGS）获取变得简单、便宜，这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含
沃特世Paradigm科学搜索软件便于科学信息的访问
使科学组织可以充分利用科学内容做出更好的循证决策 宾夕法尼亚州费城，2013年3月18日 。Waters公司今天宣布它正在扩大其实验室信息产品，另外还有Paradigm™科学搜索软件，一个强大的信息访问平台。 Paradigm™科学搜索软件使得科学组织的科学家、工程师和管理者可以
重磅！布鲁克宣布收购IP2蛋白质组学软件
2020年9月30日，布鲁克对外宣布最近收购了IP2（Integrated Proteomics Pipeline）搜索引擎和蛋白质组学工作流程软件平台。IP2搜索引擎由美国Scripps研究所John Yates III教授与Robin Park、Tao Xu博士共同创立Integrated
Proteome－公司Scaffold－2.1软件现支持安捷伦Spectrum－Mill－搜索平台
2008年8月7日安捷伦科技 分析测试百科 译SANTA CLARA, Calif., and PORTLAND, Ore., 安捷伦科技和蛋白质组软件公司（Proteome Software）今天宣布，Proteome公司的Scaffold 2.1版本软件，现在可以处理从安捷伦的Spectru
Google向美国区域的搜索实验室用户开放搜索生成体验
在GoogleI/O之后注册了搜索实验室的美国用户现在可以开始使用一些早期实验，包括SGE（搜索生成体验）、代码提示和添加到表单。如果你想尝试这些功能，你可以通过访问这个网站注册，如果你已经注册，还可以在那里查看你的等待名单状态。该公司表示，其生成性人工智能驱动的搜索将使搜索更容易，用户将能够更快地
首个图像识别软件诞生－用图片定位文件提升搜索效率
达特茅斯大学的研究人员开发了一个人工智能软件，在互联网上使用图片来搜索定位文件，这比以往的文件搜索具有更大的准确性。 这个新系统，最初是用图片来搜索定位的，现在也可以应用视频文件，首次显示出机器学习图片识别和检索算法的技术已经成熟，足以提高大量文档的在线搜索效率。该系统采用图像和视频数据而不是
核酸和蛋白质序列分析1
在获得一个基因序列后，需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子／外显子分析、ORF分析、表达谱分析等，能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等，识别调控区的顺式作用元件，可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本
主要分子对接软件功能特点介绍
DOCKDock是应用最广泛的分子对接软件之一，由Kuntz课题组开发。Dock应用半柔性对接方法，固定小分子的键长和键角，将小分子配体拆分成若干刚性片断，根据受体表面的几何性质，将小分子的刚性片断重新组合，进行构像搜索。在能量计算方面，Dock考虑了静电相互作用、范德华力等非键相互作用，在进行构像
分子生物学常用数据库汇总及推荐
分子生物学主要研究具体生物大分子在某一生物学行为过程中的表达变化、功能和作用方式；主要涉及基因的表达调控、蛋白相互作用、信号分子间的交互对话等。分子生物学实验常需要我们在具体实验前对所关注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素调控、与哪些分子可能存在潜在的相互作用，可能参与哪些生物学行为等进行一些初步
安捷伦在ASMS上发布多款软件和数据库
分析测试百科网讯 正在进行的2016美国ASMS会议上，安捷伦发布展出了一系列质谱系统、软件和技术。除了硬件之外，本次会议上安捷伦也更新了一些重要的软件工具和数据库。 安捷伦MassHunter BioConfirm 软件有了全新的药物-抗体计算器，这使得非专家级液质用户能够表征抗体
Agilent扩展生物学分析软件
新增遗传关联和拷贝数变异分析功能 2009年12月22日，北京 —安 捷 伦科技公司(纽约证券交易所：A)发布了其广受欢迎的可用于微阵列数据可视化分析的最新一代桌面软件产品--GeneSpring GX 11，以及其企业版本-- GeneSpring Workgroup 11。 Gene
miRNA的特征、功能及识别方法等详解（二）
miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs——lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA 3’非编码区端，以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制，进而抑制蛋白质合成，阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3’非编码区有部分同源
采用生物信息学和实验方法联合分析转录组信息
The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the development of high-throughput functional geno
ThermoFisher推出Proteome－Discoverer蛋白质组学软件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白质组学研究的突破性生物软件 质量信息学平台提供了强大的分析、开放和灵活架构，易于使用的界面 2008年5月30日，圣何塞，服务科学，世界领先的赛默飞世尔科技公司，今天宣布将在ASMS 2008（第56届美国质谱大会）上
生物信息学新进展
计算机技术和人类基因组计划的发展，应运而生了一门新兴的学科——生物信息学，该学科包含了两个交叉领域的工作：用于建立现代生物学所需信息系统框架（支持生物学的信息管理系统、分析工具和通讯网络）的研究开发工作，即传统意义上的生物信息学（bioinformatics）；旨在理解基本生物学问题的基于计算的研究
布鲁克新品发布@USHUPO
#摘要# 应用在免疫肽组学的PaSER™ Novor，具有更快速、实时从头测序的特点 使用PaSER 2023b蛋白质组学软件实现无需构建谱图库的dia-PASEF数据分析（Library-free dia-PASEF®） 与Mass Dynamics合作, 实现4D-Proteomics
珀金埃尔默整合ChemDraw软件与云端应用搜索协作工作流程
ChemOffice+ Cloud应用让化学研究员在快速检索化学结构和数据的同时，还能轻松创建和共享重要报告 致力于为创建更健康的世界而持续创新的技术领导企业珀金埃尔默，日前推出其新款ChemDraw®应用——ChemOffice®+Cloud，该应用可简化、促进并加快化学通信工作流
BioRad信息学光谱软件和光谱数据库被这家公司收购了！
分析测试百科网讯 近日，John Wiley and Sons 宣布收购Bio-Rad信息产品，包括该公司的光谱软件和光谱数据库。此次收购为Wiley的Science Solutions部门增加了专业和内容强大的软件，进一步增强了实验室的影响力。本次收购协议的条款未披露。 Wiley Rese
蛋白组学的研究方法
蛋白组学的研究方法如下：蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基（20/4）, 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化和糖基化等，给分离和分析蛋白质带来很
布鲁克发布PaSER重磅更新，强大新算法支持diaPASEF
布鲁克PaSER™ 2022软件加入TIMS DIA-NN模块，具有处理dia-PASEF®数据的能力 创新的TIMScore算法支持dda-PASEF数据和dia-PASEF库，与TIMS DIA-NN相结合，仅需35分钟梯度即可从200ng K562裂解液中鉴定约9000种蛋白质组 TI
美国政府停摆给中国生命科学界的警示
美国政府停摆给中国生命科学界的警示：中国需要自主的“国家生物信息学中心“ 10月1日，由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧，联邦政府的非核心部门被迫关门了两个多星期。其中医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站在此期间处
蛋白组学分析软件一览
蛋白组学分析软件 StartFragmentProtParam 瑞士蛋白质专家分析系统中的子程序，适用于蛋白质序列的物理-化学参数（氨基酸、原子组成，等电点，消光系数等） MultiIdent 瑞士蛋白质专家分析系统中的子程序，适用于通过等电点、分子量、氨基酸组成、序列标签、肽指纹数据等识别蛋白 A
生物信息学mapping率高或低代表什么意思
生物信息学高度依赖于网络。实际上，你需要的几乎所有资源，都可以从网上下到。你需要关注你研究领域所需要的那些，而不是全部的资源。我原来常用的：NCBI：持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具，以及BLAST序列比对搜索工具，PUBMED文献数据库，Taxonomy数据
不同植物SBPbox基因家族的比较分析
实验概要本研究利用生物信息学资源和工具，对双子叶和单子叶模式生物拟南芥和水稻中的SBP-box基因家族进行了比较分析。利用两个物种的SBP-box基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树。在系统发生树的末端节点上鉴定出12对旁系同源基因。利用非同义替换率与同义替换率(KalKs)分析了同源基因分离之后所
Xevo－G2S－QTof和TransOmics:LC/MS差异组学分析系统（二）
此外，TOIML还便于科学家将分析结果与其它组学数据关联，或为诸如EZinfo的独立统计软件包提供输入数据。下游生物信息学(即Umetrics软件)的结果可重新导入分析实验中，以将所有化合物数据合并为单个表格以供审查或分享。 图2. TOIML化合物鉴定页面。 图3. 镇痛标准品的归一化丰度分析。在
新疆珍稀濒危特有高等植物数据库软件获登记证书
7月17日，中国科学院新疆生态与地理研究所“新疆珍稀濒危特有高等植物数据库软件”荣获登记证书，登记号2011SR048753。 本软件录入了新疆珍稀濒危特有高等植物的基本信息，记录有中文名、学名、所划类别、生态型、各构件特征、资源状况、保护级别、分布、生境特点和照片等18条信
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能 GeneSpring 现可实现通路水平的多组学及新一代测序数据分析 2012 年 3 月 27 日，加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)今日发布了其广受欢迎的生物信息学软件的重要扩展版本
华人学者Nature子刊：人类转录组跨平台靶向分析
来自普林斯顿大学等处的研究人员发表了题为“Targeted exploration and analysis of large cross-platform human transcriptomic compendia”的文章，公布了一种新研发的针对转录组数据的搜索引擎，利用这一平台，研究人员可
百度、360搜索大战升级－搜索引擎市场或变局
8月中旬，周鸿祎宣布推出综合搜索业务后，搜索引擎市场领头羊百度的“太平”日子即将终结。 28日晚，百度低调反击360，趁夜“围堵”其搜索业务。昨天下午4点多，奇虎360发声明称要建设一个安全、干净、有效竞争的互联网搜索市场。百度有关负责人接