免疫学技术专题:染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定量分析。(3)组蛋白修饰的功能研究。通过用酰基化或甲基化的组蛋白的特异抗体和没有进行修饰的组蛋白的特异抗体,可以确定与组蛋白修饰有关的结合模式的变化。(4)聚合酶活性的定量分析。(5)精炼生物信息方法,用功能数据来确定启动子的位置。二、具体实验原理和实验步骤 染色质免疫沉淀芯片流程图三、GeneChip-TilingArray技术简介Affymetrix公司于2006年1月24日宣布推出GeneChip(R)人类和鼠源嵌合芯片(TilingA,ray)系列产品。该系列芯片研究范围大大超出已知编码蛋白序列,可以对整个人类和小鼠基因组进行......阅读全文

免疫学技术专题:染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

染色质免疫沉淀技术的应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域,要想提供蛋白因子直接调控的证据,需要直接检测蛋白质-DNA的相互作用,而染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一种研

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用2

3. 染色质免疫沉淀Input对照:在进行免疫沉淀前,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照。Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联,DNA 纯化,以及最后的PCR或其他方法检测。Input对照不仅可以验证染色质断裂的效果,还可以根据Input中的靶序

技术和方案18-染色质免疫沉淀

试剂、试剂盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制剂裂解缓冲液免疫共沉淀洗脱液TESTE仪器、耗材超声波粉碎仪实验步骤1.培养要分析的细胞。每一个样品,需要在三角瓶中培养 50~100ml 细胞至 OD600 大约为 1。2.甲醛处理细胞交联蛋白质和 DNA。加甲醛到细胞中至终浓度为 1%(37% 的甲醛按 1

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点

染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体的特异性反应,可以真实地反映体内蛋白分子与基因组DNA结合的状况。下面我们就最基本的实验步骤,实验中的小技巧以及需要注意的问题简单介绍一下。1.

Cell特辑:免疫沉淀

  “Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册,主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文,评论性文章以及snapshots,涉及了同一领域的方方面面,更为重要的是这些文章由赞助商赞助,可以免费获取。  蛋白与DNA之间

ChIPChip技术的介绍与应用

人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临,与基因信息相比较,人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白

染色质免疫沉淀分析

真核生物细胞状态是由内源和外源因素共同影响的,所有信号传递途径的终点都是DNA 。DNA 通过核蛋白复合物组成染色质,染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制--" 组蛋白密码" ,其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋白磷酸

染色质免疫沉淀DNA分析

实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法,来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性  DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布(用芯片或 DNA 测序)。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀  (X-ChIP) 实验的具

染色质免疫沉淀DNA分析

实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法,来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性  DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布(用芯片或 DNA 测序)。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀  (X-ChIP) 实验的具

免疫学技术专题:组织病理实验(二)

(7)切成的蜡带到20~30 cm 长时,右手用另一支毛笔轻轻将蜡带挑起,以免卷曲,并牵引成带,平放在蜡带盒上,靠刀面的一面较光滑,朝下,较皱的一面朝上。(8)用单面刀片切取蜡片一小段,放在载玻上加水一滴,置于放大镜或显微镜下观察切片是否良好。(9)切片工作结束后,应将切片刀取下用氯仿擦去刀上沾着的

免疫学技术专题:组织病理实验(一)

标签: 组织病理组织学技术包括、组织学制片技术、胚胎学制片技术、组织化学技术、荧光组化及免疫组化技术、组织培养技术、各种特殊显微技术、电镜组织学技术。组织学技术不但应用于组织学本学科,并且广泛应用于其他多学科,如生物学、解剖学、病理学、肿瘤学、法医学、临床诊断学等。实验方法石蜡切片法冰冻切片实验方法

免疫学技术专题:非标记抗体免疫电镜技术

一、原理标记抗体法虽然具有许多优点,但也存在一些难以克服的问题,如标记抗体的分子增大,对细胞膜和组织的穿透力减弱;化学交联反应对抗体和酶的活性有所影响;结合物中未标记的抗体可与抗原竞争结合,影响检测方法的敏感性等。不标记抗体法可以避免上述的不利影响因素,通过一系统的非标记抗体的免疫学反应,对组织中的

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用1

序言随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学的研究逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域。研究某个蛋白因子的调控功能,可以通过对蛋白活性(激活或抑制其活性),蛋白数量(过表达Overexpression或基因缺陷型Knockout), 以及蛋白功能(功能缺陷

组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同

组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同

自然染色质免疫沉淀实验设计

1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima

ChIPSeq分析常见问题集锦

染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)是指对染色质免疫共沉淀(ChIP)获得的DNA片段进行大规模测序,并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Hiseq2000和AB SOLID 4 这3种测序技术均可以用于ChIP-

北京大学Cell-Res获染色质免疫沉淀测序技术突破

  生物动态光学成像中心黄岩谊课题组与汤富酬课题组合作,发展了一种基于微流控芯片的微量细胞样品处理与核酸俘获方法,成功实现了针对1000个细胞的染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq),大幅减少了这类实验中对样品起始量的要求,并利用这一方法研究了组蛋白H3第4位赖氨酸的3甲基化修饰(H3K4me3)在

染色质免疫沉淀法(Chromatin-immunoprecitation,ChIP)

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些

高通量测序的应用及前景

一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤,避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力,对照一个参比基因组(reference genome)高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence),2007年van Orsouw

染色质免疫共沉淀(ChIP)

染色质免疫共沉淀实验方法原理在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prore

免疫学技术专题:斑点金免疫渗滤测定法(DIGFA)

基本原理斑点金免疫渗滤测定法是在斑点免疫渗滤测定法基础上,改用胶体金标记物代替酶,省去底物显色的步骤。试验方法是以硝酸纤维素膜(NC膜)为载体,将试剂及标本滴加在膜上,通过渗滤而逐步反应。全过程可于数分钟内完成,阳性结果在膜上呈红色斑点。试剂及材料1. 渗滤装置:为一塑料小盒(4x3x0.6cm

免疫学技术专题:中性粒细胞吞噬功能的测定

中性粒细胞(polymorphonuclear leukocyte,PMN)的功能包括粘附、移动、吞噬杀菌等,是机体天然免疫力的重要组成部分。试剂及材料1. 白色葡萄球菌2. 肉汤培养基3. 硷性美蓝液操作方法1. 菌液的制备  将白色葡萄球菌接种于中,放37℃温箱内培养12h左右;置水浴中加热10

染色质免疫共沉淀(ChIP)

实验方法原理在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prorein A预先结合

染色质免疫共沉淀(ChIP)

            实验方法原理 在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象

染色质免疫共沉淀(ChIP)

实验方法原理 在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prorein A预先结

染色质免疫共沉淀(CHIP)的原理是怎样的?

  真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。   染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, CHIP )是目前研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。   染

Active-Motif的染色质免疫沉淀试剂盒(ChIP)

ChIP(染色质免疫沉淀)方法是研究活体“蛋白质-DNA”相互反应的一种非常强大的工具。目前,这种方法用于染色质结构的动力学研究、转录因子的调节和辅助调节因子及其他表观遗传变化的研究。ChIP的使用过程分为三个主要步骤:第一步,在甲醛固定后分离和破碎染色质;第二步,使用感兴趣的蛋白的抗体完成特定染色