Nature破解百年争论:基因抵抗沉默新机制

来自哈佛干细胞研究所(HSCI)的研究人员破解了一个百年以来的争论:DNA甲基化作用的出现是用于沉默基因表达,还是在甲基化出现前,基因就已经能通过其他方式被关闭了。 这一研究成果公布在10月9日的Nature杂志上。研究人员指出,甲基化实际上能强制关闭基因表达,而最新发现的一种新型非编码RNA能特异性抑制DNA甲基化,从而启动某些肿瘤抑制因子的表达,因此这项研究将有助于治疗癌症等疾病。 领导这一研究的是哈佛干细胞研究所资深研究员Daniel Tenen,其研究组今年还曾发表文章,在最具侵袭性的肝癌中鉴别出了一个已知调控胚胎干细胞自我更新的基因,由此开始积极地寻找能够阻断其活性的药物。 促成细胞记忆的主要机制之一是将一种化学基团——甲基团添加到DNA序列上,这一过程就称之为甲基化作用。DNA甲基化会导致基因关闭。基因表达中的这些可以遗传,但却并不直接书写在DNA序列上的改变就称之为表观遗传。 在这篇......阅读全文

核移植胚胎干细胞的印迹基因甲基化研究

核移植来源的胚胎干细胞(NTES  cells)在以干细胞为基础的细胞治疗中扮演着非常重要的角色,得到全能性良好且表观遗传修饰正常的核移植胚胎干细胞是解决治疗性克隆安全问题的重要前提。DNA甲基化修饰在基因表达和印迹基因的表达中起非常重要的作用,两步法克隆可能存在的不完全重编程问题很可能存在于印

细胞化学词汇DNA甲基化

中文名称:DNA甲基化外文名称:DNA methylation影    响:控制基因表达甲基酶分类:DNM T1、DNM T3a、DNM T3b作    用:修饰DNA序列

Nature-Genetics:单细胞全基因组DNA甲基化组新发现

  北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心,北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法,首次在单细胞分辨

基因甲基化缺失是致癌重要成因

人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。 人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人

基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。   人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不

棉花“甲基化基因图谱”首次绘成

  30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果:他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异,为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。  几十年来,科学家们发现,许多动植物的表观特征,既可用基

基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。  人体每个组织由特定属性的组织特异细胞构成。基因选择

基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。   人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有

基因组DNA甲基化分析方法

早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基

科学家实现单细胞水平甲基化和去甲基化调控

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507595.shtm

甲基化的基因组直接测序法

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

揭示DNA甲基化与基因沉默的关系

  DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关,但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。  2021年6月3日,加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s

精氨酸甲基化调控细胞凋亡研究

遗传与发育生物学研究所杨崇林实验室以秀丽线虫为模式,探索蛋白质精氨酸甲基化这一重要的蛋白质翻译后修饰方式在调控DNA损伤诱导的细胞凋亡方面的作用机制。 通过研究发现哺乳动物II型蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT5在线虫中的同源物,即线虫的PRMT-5,参与调控DNA损伤引起的细胞凋亡。在prmt-5基

家蚕基因组甲基化谱研究获突破

我国科学家利用新一代测序技术构建家蚕丝腺甲基化谱  由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、西南大学、上海肿瘤所等合作的研究成果“家蚕基因组甲基化谱”,5月2日在国际著名学术杂志《自然—生物技术》(Nature Biotechnology)上发表,这是中国科学家

RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-

DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便

全基因组测序解读重要甲基化机制

  DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列,可一旦它与组蛋白包装形成染色质,情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种,分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默,要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化),能够影响它对基因的控制。   H3K4me3是

线虫基因组中存在DNA甲基化现象

  2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

LUMA介绍基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methylat

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

  LUMA介绍   基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methyl

北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016

DNA甲基化:在衰老细胞中的作用

   近日,科学家们在45万个基因组位点中发现了8%的与衰老有关的DNA甲基化的改变。这项研究成果题为“Age-related variations in the methylome associated with gene expression in human monocytes and T c

揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法

  5月31日,中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl

甲基化的甲基化的功能

甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D

基因组直接测序法检测DNA的甲基化

基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应

基因组直接测序法检测甲基化的介绍

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

Pyrosequencing-DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便与结肠癌患

《自然》首次证实:基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。  人体每个组织由特定属性的组织特异细胞构成。基因选择

人类基因组DNA甲基化数据分析

  近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。  DNA甲基化是表观