DNA酶I足迹探针的制备实验

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验 试剂、试剂盒 TE 牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷酸激酶缓冲液 TBE 加样缓冲液 TBE 质粒 DNA 合适的限制酶 粉 氯仿 氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇) 乙醇 牛肠碱性磷酸酶 [γ-32P]ATP T4 多核苷酸激酶 乙酸铵 乙酸钠 丙烯酰胺 双丙烯酰胺 ......阅读全文

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验             试剂、试剂盒 TE 牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒 TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵 乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩器

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩器实验步骤

DNA-酶-I-足迹分析实验

试剂、试剂盒32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚/

DNA-酶-I-足迹分析实验

DNA 酶 I 足迹分析实验             试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针 酚 氯仿

DNA-酶-I-足迹分析实验

试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液 Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤 材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探

DNA酶足迹法的原理介绍

DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后,又可测出被结合处DNA的序列。

DNA酶足迹法的功能介绍

DNA酶足迹法是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。

DNA酶I足迹分析法

实验方法原理 实验材料 含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒 适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol

DNA酶I足迹分析法实验——粗制品的DNA酶足迹分析法

实验方法原理DNA酶足迹分析常用来寻找粗制品中的蛋白质,因而提供了一种在纯化过程中采用的分析方法。通过改变条件,如在反应体系中加入大量的竞争性DNA,或增加反应中盐的浓度,可抑制非特异性的DNA结合蛋白结合到标记的DNA上。实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶10

DNA酶I足迹分析法实验——NA酶I足迹分析法

本分析方法用来检测DNA上特异的蛋白质结合位点。位点上结合的蛋白质可保护 D N A 的 磷 酸 二 酯 键 骨 架 免 于 受 D N A 酶 I 催 化 的 水 解 。 水 解 后 D N A 片 段 在 变 性DNA测序胶上分离,通过放射自显影可使结合位点显示出来。足迹法已进一步发展成为确定D

DNA酶I足迹分析法实验

DNA酶I足迹分析法 用光密度及数值分析法决定蛋白质结合的平衡常数 粗制品的DNA酶足迹分析法             实验方法原理

DNA酶足迹法的原理和应用

DNA酶足迹法是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。其原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移

DNA酶I足迹分析法实验2

实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脱氧

DNA酶足迹法的基本原理

原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后,又可测出被结合处DNA的序列。

DNA足迹法介绍

DNA足迹法,中文名称:DNA足迹法英文名称:DNA footprinting定义:检测DNA序列中DNA结合蛋白识别部位的一种方法。

DNA足迹法的原理介绍

DNA被蛋白质结合后,由于蛋白质的构象保护,DNaseI不能降解这一结合位点,如果对该DNA进行一端的末端标记,并控制好DNaseI的酶量和作用时间,可将该DNA切割成大小不等的DNA片断而蛋白质保护区域不被酶解,这段区域到标记末端的片断是缺失的,对其电泳,可找出蛋白质结合位点的精确位置。

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分试剂、试剂盒 细胞匀浆缓冲液细胞重悬缓冲液细胞淋洗缓冲液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸盐缓冲液聚乙烯醇终止液组织匀浆液组织重悬缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

本方案介绍在放射性标记的 DNA 片段上确定蛋白质结合位点的作图方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羟自由基断裂 DNA。如果希望得到优化足迹法反应的建议,请参见本方案最后部分的疑难解析以及优化 DNA 酶 I 足迹法反应的栏目。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验             实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分

DNA足迹法的基本原理

原理:DNA被蛋白质结合后,由于蛋白质的构象保护,DNaseI不能降解这一结合位点,如果对该DNA进行一端的末端标记,并控制好DNaseI的酶量和作用时间,可将该DNA切割成大小不等的DNA片断而蛋白质保护区域不被酶解,这段区域到标记末端的片断是缺失的,对其电泳,可找出蛋白质结合位点的精确位置。

什么是“DNA探针”?

DNA探针(DNA probe)是最常用的核酸探针,为长度在几十到几百甚至上千碱基对的单链或双链DNA,用特殊示踪剂(如同位素、酶或有色基团)进行标记;在适当的pH值、温度和离子强度下,DNA探针利用分子的变性、复性以及碱基互补配对的高度精确性,能与待测样本中互补的非标记单链DNA或RNA以氢键结合

“DNA探针”的性能优势

①DNA探针多克隆在质粒载体中,制备方法简便;②DNA探针相对RNA探针(RNA probe)而言不易降解,一般能有效抑制DNA酶活性;③DNA探针的标记方法较成熟,可用同位素或非同位素标记,有多种方法可供选择。

“DNA探针”的技术依据

DNA探针根据其来源分为3种:一种来源于基因组中的基因本身,称为基因组探针(genomic probe),可以是基因的全序列,或者基因上的一段序列;另一种是从相应的基因经转录获得mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe);此外,还可在体外人工合成20~50个碱基的与基

“DNA探针”的性能优势

①DNA探针多克隆在质粒载体中,制备方法简便;②DNA探针相对RNA探针(RNA probe)而言不易降解,一般能有效抑制DNA酶活性;③DNA探针的标记方法较成熟,可用同位素或非同位素标记,有多种方法可供选择。

DNA探针原位杂交

  1、4—6微米切片,用防脱片胶(多聚赖氨酸)处理过的玻片贴附  2、56—60℃烤片2—16h  3、新鲜二甲苯脱蜡,10minX2(趁热脱蜡)  4、100%乙醇5minX2次,不用浸水,直接空气干燥  5、加入50μl蛋白酶K工作液(蛋白酶K用蒸馏水稀释,浓度为25μg/ml),37℃消化1

DNA探针的来源介绍

  DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不

DNA探针的功能特性

  DNA探针是以病原微生物DNA或RNA的特异性片段为模板,人工合成的带有放射性或生物素标记的单链DNA片段,可用来快速检测病原体。DNA探针将一段已知序列的多聚核苷酸用同位素、生物素或荧光染料等标记后制成的探针。可与固定在硝酸纤维素膜的DNA或RNA进行互补结合,经放射自显影或其他检测手段就可以

“DNA探针”的制备过程

基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法,即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别

DNA探针的制备方法

基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法,即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别