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青岛能源所提出“微生物组影响指数”

微生物组是微生物在自然界的存在形式,与人体、空气、土壤与海洋的健康息息相关。因此,微生物组科学与产业已经成为国际科技合作与竞争的“战略高地”。然而,大数据挖掘工具的匮乏,阻碍着微生物组研究从“数据分析”向“数据科学”的跨越。2010年,来自43个国家的500多名研究人员联合启动了“地球微生物组计划”(Earth Microbiome Project; EMP),对全球微生物组的多样性进行系统性调查,已经发表了第一阶段的成果(Thompson, et al., Nature, 2017)。而各国政府历年来陆续启动的“人体微生物组计划”(Human Microbiome Project; HMP)与“美国国家微生物组计划”(National Microbiome Initiative; NMI)等,也同样产出了海量的菌群数据。这些以元基因组为代表的微生物组数据类型多样、来源迥异、体量庞大,而且其数量正在以指数型增长。但是,大数据......阅读全文

口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析

  2015年7月28日,北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎(RA)口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节,并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。  RA是一种致

新生儿肠道微生物菌群研究

  肠道微生物菌群被认为与人类健康息息相关。但是微生物菌群是如何稳定建立的,还没有很好的定量研究。在近期的《Cell Host & Microbe》上,通过宏基因组测序分析,科学家们分析了新生儿和母亲肠道菌群,分析了新生儿出生第一年肠道微生物菌群的建立。他们发现,自然生成的婴儿和剖腹产婴儿的肠道菌群

What?肠道微生物菌群能够促进器官发育?

   肠道是一个复杂的生态系统,也是多种寄生微生物与动物宿主微生物之间相互共生的地点。动物的宿主微生物菌群能够促进动物胃肠道发育的作用已经不容置疑。 然而,动物体内的寄生微生物菌群对消化器官发育所产生的影响仍然难以捉摸。 在本文中,研究人员Hill 等人提出肠道微生物菌群在斑马鱼早期幼鱼发育过程中,

微生物所发表中国微生物组数据平台

  10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar

抗菌牙膏不会影响肠道菌群和口腔微生物

  根据小型随机试验测定,一些含有抗生素三氯生的个人卫生用品,如肥皂和牙膏,对微生物群落或内分泌功能没有重大影响。这项研究结果在线发表在mSphere上。  “有很多人害怕三氯生,但在我们的研究中我们没有发现任何相关的支持论点。“医学博士Julie Parsonnet说,“当大多数抗生素应用到人类中

研究开发基于菌群大数据搜索的新疾病检测方法

基于菌群大数据搜索引擎实现疾病检测的原理  微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力,但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢?中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法,为此共性问题提供了原创解决方案。该研究成果近日在线发表于《美国微

人体内的微生物菌群与出生方式有关?

  近年来,人体内微生物菌群的数量及它们的重要性逐渐引起人们的关注。  人体内生存着数以万亿计的细菌及其他单细胞微生物,例如古生菌和原生生物,其中大多数位于肠道内。据估计,它们的数量甚至超过了人体自身细胞的数量。  众所周知,人体内的微生物生态系统对我们的健康有深远的影响。  人体微生物研究工程(H

微生物检测方法--专有酶法测定大肠菌群

微生物专有酶法测定大肠菌群:大肠菌群哦看产生β-半乳糖苷酶,分解液体培养基中的酶底物——4-甲基伞形酮-β-D-半乳糖苷,使4-甲基伞形酮游离,因而在366nm的紫外光灯下呈现蓝色荧光。

从肠道菌群到肠道病毒群

  肠道菌群早以已经成为热点科技新闻概念,其核心要点是肠道内细菌是维持健康的重要因素。其实肠道菌群自己身体内也有另外一种生命,就是细菌病毒,又称为噬菌体。最近有研究发现,肠道内细菌感染的噬菌体对人体健康也具有重要价值,这些病毒无法裸露生活,都必须隐藏在细菌体内寄生。这里形成一个非常有趣的现象,人的肠

新冠病毒与儿童体内微生物菌群关系被揭开

  新冠病毒肆虐全球已有一年半的时间,随着人们对新冠病毒的深入了解,新冠病例的治愈康复率在不断提高,不过,其康复后的后遗症也应该受到重视。曾发表在 Nature 的一篇文献指出,多数COVID-19康复者面临着众多健康问题,新冠病毒不仅仅影响着呼吸道系统,还可能长期影响着神经系统、代谢系统、心血管系