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引物的设计原则

引物设计原则1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,其Tm恒等于4×(G十C)十2×(A十T)。3、碱基分布的随机性:应避免连续出现4个以上的单一碱基。尤其是不应在其3’端出现超过3个的连续G或C,否则会使引物在G十C富集序列区错误引发。4、引物自身:不能含有自身互补序列,否则会形成发夹样二级结构。5、引物之间:两个引物之间不应有多于4个的互补或同源碱基,不然会形成引物二聚体,尤应避免3’端的互补重叠。6、上下游引物的互补性:一个引物的3‘末端序列不允许结合到另一个引物的任何位点上。7、3’末端:如果可能的话,每个引物的3‘末端碱基应为G或C。8、引物应当超出限制性内切酶识别......阅读全文

引物溶解引物保存

1.  如何测定引物的OD值? 用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其

引物溶解引物保存

1. 如何测定引物的OD值?用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其吸光度

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

快速了解反转录引物随机引物

  随机引物是指当特定mRNA由于含有使逆转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体这一非特异的引物来拷贝全长mRNA。  1.特异性引物一般在增低丰度目的基因才选择使用,用得比较少。一般都推荐用Oligo(dT)或随机引物代替基因特异性引物。由于rna的二级结构破坏不完全,导致特异性

设计引物遵循原则、引物保存和各种PCR的引物设计

一 设计引物应遵循以下原则1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上

PCR引物

PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual)    PCR Primer Design (Newman Lab)    PCR Primer Design (Epp

PCR引物

PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual)  PCR Primer Design (Newman Lab)  PCR Primer Design (Eppendorf)Detail

引物篇:普通PCR 和 QPCR 引物异同点

Q问题: 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一样? A 回答: 二者的设计原则有相同也有不同; 相同处: • 序列的查找是一致的; • 序列选取应在基因的保守区段; • 选取合适的扩增片段大小 •

引物篇:普通PCR 和 QPCR 引物异同点

Q问题: 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一样? A 回答:     二者的设计原则有相同也有不同;相同处:•         序列的查找是一致的;•         序列选取应在基因的保守区段;•         选取合适的扩增片段大小•         避免引物自身或与引物之间形成4个或4个

通用引物和特异性引物的区别

通用引物,含义为克隆位点两旁的序列匹配,目的是引扩出DNA片段,主要用来测序。而序列特异性引物指一种测定基因突变的方法。通用引物是一般和载体多克隆位点两旁的序列匹配,或者是与载体里面的一些启动、终止元件匹配。这样不管载体插入什么DNA片段,都可以用通用引物扩出来。通用引物可以用来测序,但是只是“通用