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核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(二)

snoRNAs在癌症中的作用snoRNAs参与的癌症的分子病理学研究snoRNAs在癌症中的作用起始于一项研究:在脑膜瘤中,与正常脑组织相比snoRNAs的表达大幅下调[20]。最近研究发现,在非小细胞肺癌中多种snoRNAs呈现出不同的表达状态[21]。其它的研究证明snoRNAs U50 2bp纯合缺失突变与前列腺癌的发生发展有关[22]并且在乳腺癌中U50具有杂合缺失以及转录下调的特点[23]。另有研究发现snoRNAs以及lncRNA的hostgene-GAS5能够调控细胞的生存通过诱导或者感受细胞的凋亡。GAS-5在乳腺癌中大幅下调的暗示其可能作为抑癌基因存在[24]。snoRNAs与肿瘤的关系也能够延伸到与它们相互作用的蛋白分子上。根据它们结构与功能的不同,snoRNP复合物能够分为两类C/D box snoRNP和H/ACA box snoRNP。C/D box snoRNP 包含四种进化上保守的,必需......阅读全文

小分子RNA——microRNA综述(2)

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序

micro RNA(miRNA)综述-3

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR

核仁小RNA(snoRNAs)的功能及其在癌症研究中的作用介绍

  核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加工处理形成成熟的核仁小RNA[2]

RNA实验方案和应用(一)

RNA是具有多种不同的功能的生物大分子。信使RNA(mRNA)是DNA转录得到的,用做蛋白质合成的模板。蛋白质的合成是由核糖体完成的,核糖体由核糖体RNA(rRNA)和蛋白质组成。用于蛋白合成的氨基酸,是通过转运RNA(tRNA)输送到核糖体上的。RNA分子也是参与RNA转运过程的核糖蛋白的一部分。

核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(一)

为什么研究snoRNAs?引言核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制

  10月1日,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文,系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。  真核基

IVD行业常见的核酸提取方法及原理

  核酸是分子生物学的基础,而核酸提取是整个分子行业绕不过去的门槛,很多时候一份样本的核酸提取的好坏直接决定了检测结果的有效性。   核酸的基础知识   核酸分为脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),其中RNA又可以根据功能的不同分为核糖体RNA(rRNA),信使RNA(mRNA)和转移R

IVD行业常见的核酸提取方法及原理

  核酸是分子生物学的基础,而核酸提取是整个分子行业绕不过去的门槛,很多时候一份样本的核酸提取的好坏直接决定了检测结果的有效性。   核酸的基础知识   核酸分为脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),其中RNA又可以根据功能的不同分为核糖体RNA(rRNA),信使RNA(m

潘滔教授Nature Methods发布RNA测序重大突破

  来自芝加哥大学、德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员报告称,他们开发出了一种新方法实现高效定量高通量tRNA测序。这种叫做DM-tRNA-seq的技术适用于在所有生物体中开展tRNA研究。这一重要的研究成果发布在7月27日的《自然方法》(Nature Methods)杂志上。  芝加哥大学生物化学和

RNA分析的几个热点领域及主要技术路线

DNA,RNA和蛋白质是三种重要的生物大分子,是生命现象的分子基础。基因组DNA中的基因通过转录为mRNA并进一步翻译为蛋白质,很多种类的蛋白质在最终发挥功能时又经历磷酸化、糖基化、酶原激活等翻译后修饰。DNA的遗传信息决定生命的主要性状,而mRNA在信息传递中起很重要的作用。其它两大类RNA,rR

Science:Pax3 mRNA如何控制肌肉干细胞命运?

  组织保持稳态和再生取决于组织特异性的干细胞群体,其中的一些干细胞群体长时间处于静止状态。在脊椎动物中,肌肉干细胞(MuSC)是骨骼肌再生所必需的。近期的研究已表明,久坐不动小鼠中的MuSC对成年肌纤维的维持起着重要的作用,它们对隔膜肌(diaphragm muscle)的贡献较大,而对下后肢肌(

Cell:发现长非编码RNA对细胞核仁功能的重要调控机制

  5月5日,国际学术期刊《细胞》(Cell)杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果:SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription,该成果揭示了长非

上海生科院发现长非编码RNA对细胞核仁功能重要调控机制

  5月5日,国际学术期刊《细胞》(Cell)杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果:SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription,该成果揭示了长非

我国科学家发现长非编码RNA对细胞核仁功能的调控机制

图. SLERT的加工产生以及其与DDX21环、RNA聚合酶Pol I的相互作用机制  在国家自然科学基金重大研究计划项目(项目编号:91440202,91540115)等资助下,中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组取得重要研究进展,揭示了长非编码RNA SLERT 在细胞核仁功能和RN

Nature子刊惊人发现:抑癌的snoRNA分子

  根据斯坦福大学医学院的研究人员所说,一对原以为只是充当细胞管家的RNA分子,在超过四分之一的常见人类癌症中缺失。肿瘤中丧失这些RNA分子的乳腺癌患者相比于其他的乳腺癌患者生存率要低。  研究人员发现,这些RNA分子直接结合并抑制了一个众所周知的癌症相关蛋白KRAS。在缺失这些分子的情况下,KRA

特殊RNA或是小胖威利症元凶沪科学家找出可能病因

  婴儿期容易发烧、进食无节制,长大后智力低下、不育――每1.5万人中就可能出现1个患者的染色体疾病小胖威利症,病因何在?这个困扰了医学界多年的问题,最近有了新进展。   中科院上海生科院生化与细胞所的陈玲玲研究员带领课题组,发现了一种新型长非编码RNA,并通过实验证明,这种RNA的缺失,很可能就

中国科大在小干扰RNA领域获进展

  近日,中国科学技术大学生命科学学院及中国科学院分子细胞科学卓越创新中心教授光寿红课题组在小干扰RNA领域取得突破性进展,研究成果以RdRP-synthesized antisense ribosomal siRNAs silence pre-rRNA via the nuclear RNAi p

核糖体的离心分离

1)概述生物体细胞中除极少数细胞(如精子细胞)外,几乎所有细胞都含有核糖体(ribosome)。核糖体或成群或单个地分布在胞质中或附着在某些膜上(如内质网膜)。电镜观察到核糖体是没有包膜的电子致密颗粒,呈圆或椭圆形,平均直径200A,哺乳动物的真核细胞中核糖体沉降系数为80S,分子量为500万。在原

斑马鱼基础研究

近期,我们收到了很多小伙伴提交的文献奖励申请,其中,有2篇成功吸引了小编的注意,这2篇文章的内容都是斑马鱼研究相关的。我们都知道,斑马鱼是一种常见的模式生物,但是市面上针对斑马鱼的抗体却非常少,我们不仅有一百多种斑马鱼抗体,而且还可以根据客户需求来进行定制生产。下面来看看这2篇文章吧。01标题:Sa

DNA显示和细胞有丝分裂相的观察

核酸是生物最重要的组成成分,核酸分为两大类,即脱氧河塘核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。它们在细胞内的分布及化学性质均有所不同。DNA主要分布在核的染色质或有丝分裂过程中出现的染色体内。RNA分布在细胞质和核仁内。但在染色质及染色体中也含有少量的RNA,核仁中也有少量的DNA。在线粒体,叶绿体等细

Nature新文章阐析异病同源

  来自约翰霍普金斯大学的研究人员称,他们发现了近期揭露的一种遗传突变有可能引起两种棘手的神经系统疾病的一条途径。受累基因有可能是促进了有毒RNA累积而非生成很多的蛋白质,问题的根源似乎在于突变位点生成的缺陷遗传物质混乱。   领导这一研究小组的是约翰霍普金斯大学医学院生物化学、分子生物学和神经科

我科学家发现一类新型长非编码RNA

  国际著名学术期刊《分子细胞》近日以封面故事发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文,揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制,及其参与剪接调控的重要功能。这将为进一步了解PWS综合征的病理机制提供新的研究思路。   几乎所有哺乳动物细胞的基因

科学家发现哺乳动物细胞存在新型长非编码RNA

  中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究,揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制,及其参与剪接调控的重要功能。今天,国际学术期刊《分子细胞》以封面故事发表了他们的相关研究论文。   据介绍,几乎所有哺乳动物细胞的基因都由外显子和内含子组成。一般认

深入研究非编码RNA的新工具

  最近,加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组,开发出了一种方法,可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。  这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志,同一天,来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang

利用大肠杆菌系统检测RNA与RNA结合蛋白的相互作用实验

实验方法原理 大肠杆菌中异源性的 RNA-BP 与靶 RNA 的结合会抑制靶基因的翻译。此方法已成功地应用于包括 HIV Rcv 蛋白和核仁素(nucleolin)在内的多种 RNA-BP 的研究中。实验材料 质粒菌株试剂、试剂盒 X-Gal 储液IPTG 储存液lacZ 缓冲液ONPG 溶液碳酸钠

利用大肠杆菌系统检测RNA与RNA结合蛋白的相互作用实验

            实验方法原理 大肠杆菌中异源性的 RNA-BP 与靶 RNA 的结合会抑制靶基因的翻译。此方法已成功地应用于包括 HIV Rcv 蛋白和核仁素(nucleolin)在内的多种 RNA

利用大肠杆菌系统检测RNA与RNA结合蛋白的相互作用实验

实验方法原理大肠杆菌中异源性的 RNA-BP 与靶 RNA 的结合会抑制靶基因的翻译。此方法已成功地应用于包括 HIV Rcv 蛋白和核仁素(nucleolin)在内的多种 RNA-BP 的研究中。实验材料质粒菌株试剂、试剂盒X-Gal 储液IPTG 储存液lacZ 缓冲液ONPG 溶液碳酸钠溶液β

57人入选! 2018年度上海市“曙光计划”项目拟入选名单公示

  根据《上海市教育委员会 上海市教育发展基金会关于做好2018年度“曙光计划”项目申报工作的通知》(沪教委科[2018] 32号),上海市2018年度“曙光计划”项目拟入选名单已在网上进行公示。公示时间为2018年9月5日至2018年9月18日。  以下是公示具体名单:编号单  位项目名

实时荧光定量PCR技术-2

qRT-PCR基因表达分析在384孔板上11ul/孔的总反应体积中,使用荧光Universal ProbeLibrary(UPL)探针(罗氏公司)和ABI 7900HT 实时仪器(美国应用生物系统公司)以及2X FastStart Universal Probe Master (Rox)PCR试剂(