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华人学者NatureMethods发表超强测序分析工具

拷贝数变异在癌症中起到了重要的作用,但要把它们一一找出来并不是一件容易的事。St. Jude儿童研究医院的科学家们在五月四日的Nature Methods杂志上介绍了一种强大的测序分析工具,CONSERTING。该软件能在二代全基因组测序时非常准确的鉴定拷贝数变异,而且已经免费对全世界的研究者们开放。 研究显示,CONSERTING鉴定拷贝数变异的精确性和灵敏度比其他技术高得多,包括已发表的四种分析方法。“CONSERTING可以帮助我们更好的驾驭二代全基因组测序,深入理解癌症基因组,为下一代癌症治疗奠定基础,”文章的通讯作者张景惠(Jinghui Zhang,音译)博士介绍道。“在这项研究中,CONSERTING检测儿童肿瘤拷贝数变异的精确性比其他方法高100倍。”Zhang博士早年毕业于复旦大学,后来在Connecticut大学获得硕士和博士学位,现在是St. Jude儿童研究医院的计算生物学家。 二代测序需要将人类......阅读全文

数字PCR和基因组拷贝数变异研究

概述什么是拷贝数变异?为什么要对拷贝数变异进行研究?复旦大学杜仁骞、金力和张锋三位老师发表于2011年8月《遗传》的综述,给出了简明扼要的说明与回答,特引述如下:“拷贝数变异(Copy number variation, CNV)是由基因组发生重排而导至的,一般指长度为1 Kb以上的基因组大

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位...

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位杂交(FISH)实验材料 SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺试剂、试剂盒 固定液乙醇杂交缓冲液标记探针橡胶乳黏剂封固剂实验步骤 含有重复序列探针的沉淀:大分子量黏粒探针往往含有重复序列,如果在杂交前不能封闭这些序列,将导致严重的非特异性杂交

《基因组研究》:特定基因拷贝数的不同造就人类特殊性

人类为何如此特殊?美国科学家近日对比研究了人类和其它灵长类动物的基因组,发现这可能是因为人类某些基因的拷贝数与其它动物有很大不同。这一发现将有助于人们对疾病、寿命等展开更深入的研究。相关论文在线发表于7月31日的《基因组研究》(Genome Research)上。 美国科罗拉多大学的James Si

基因拷贝的概念

中文名称基因拷贝英文名称gene copy定  义编码一个基因的DNA序列在基因组内完整出现一次,称为该基因的一个拷贝。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

基因拷贝的定义

中文名称基因拷贝英文名称gene copy定  义编码一个基因的DNA序列在基因组内完整出现一次,称为该基因的一个拷贝。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

什么是基因拷贝?

中文名称基因拷贝英文名称gene copy定  义编码一个基因的DNA序列在基因组内完整出现一次,称为该基因的一个拷贝。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻

   基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。  在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘进行荧光原位杂交

实验材料 SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺 试剂、试剂盒 固定液乙醇杂交缓冲液标记探针橡胶乳黏剂封固剂 实验步骤 含有重复序列探针的沉淀: 大分子量黏粒探针往往含有重复序列,如果在杂交前不能封闭这些序列,将导致严重的非特异性杂交背景。人 Cot1

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘进行荧光原位杂交

            实验材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 试剂、试剂

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法荧光原位杂交

            实验材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 试剂、试剂