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Science:跳跃基因如何找到目标?

为了了解转座子如何形成基因组,极其重要的是,要发现它们定向整合(targeted integration)背后的机制。最近,来自法国国家健康与医学研究院病理学实验室的研究人员,与法国CEA-Saclay和美国一个实验室合作,确定了两种蛋白质之间的相互作用,是一个转座子整合到酵母基因组中一个特定区域所必不可少的。这些研究结果发表在五月一日的《科学》(Science)杂志,强调了这些可移动DNA序列在生物进化与适用中的作用,及其对于基因治疗的潜在价值。 转座子是基因组内能够移动的DNA序列,也称作跳跃基因,因为它们能够在基因组范围内移动而给有机体遗传完整性和稳定性造成一种巨大的危险,这些转座子曾经被认为是基因寄生序列。它们代表了相当一部分基因组,在进化中扮演重要的角色。通过整合到DNA中,这些转座子可能有助于基因组的可塑性,有可能引发新的细胞功能。相反,它们也可能导致危及细胞生存的基因突变。它们的整合通常发生在特定的基因较少区......阅读全文

中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症

  LINE-1是现今人体内存在的唯一具有自主转座活性的转座子,约有 500 000个拷贝,占人类基因组总量的17%。LINE-1是通过转录和逆转录在内的转座过程产生新的DNA拷贝,并使新产生的DNA拷贝插入基因组的不同位 置。LINE-1转座会影响基因组中其他基因的表达或调控,因而会对基因组的稳定

中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症

  “核心刊物”栏目创办于2002年,主旨在于向国内专业人士展示科研核心刊物,以及生命科学领域杂志每期重点内容,为读者呈现精彩纷呈的国内科研动向,和重大科研进展。目前包括《遗传》、《中国生物工程杂志》、《科学通报》等重点期刊,也欢迎生物类期刊联系合作(联系邮箱:journal@ebiotrade.c

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

不敢吃转基因食品?天然“转基因作物”已经吃几千年

  世界上第一棵转基因作物是什么?早在数千年前,它已在自然条件下诞生。我们常吃的圣女果、血橙,其实都归功于不安分的“转座子”。  世界上的第一棵转基因作物是什么?它是出身于实验室里,由科学家培育出来的吗?你可能想象不到,早在数千年前,第一棵转基因作物就已经在自然条件下诞生了。  自然界外源“转基因”

转座子 Tol2 的转座机制与转座优势详述

  转基因,岂能不知Tol2 ?   Tol2转座子    提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。    所谓转

转座子 Tol2 的转座机制与转座优势详述

  转基因,岂能不知Tol2 ?   Tol2转座子    提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。    所谓转

中国农业大学最新报道可抑制口蹄疫病毒的转基因山羊

  科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献

作物基因组学研究进展(二)

⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一,小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响,小麦生产面临严峻的挑战,对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦(Triticum aestivum L.)是3个不同亚基因组形成的异源

天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制

  来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。   文章的通

天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制

  来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。   文章的通

BMC Biology:含Cas酶的新型转座子

  转座子是一种可移动的遗传元件,能够在基因组的不同位点之间跳跃,这种DNA片段广泛存在于自然界的各种生物中。近日,科学家们在细菌和古生菌中发现了一类新型的转座子,这种转座子不仅含有Cas内切酶的编码基因,还依赖这种酶整合到新的基因组区域。  细菌一直在与病毒或入侵核酸(质粒)进行斗争,为此它们演化

杰出女科学家再发Cell解析调控机制

  来自美国麻省大学医学院,英国牛津大学等处的研究人员发现DEAD-box家族蛋白中两个成员:UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使过程中扮演了重要角色,并指出了一种新型核周转录沉默机制。相关成果公布在Cell杂志上。   文章的通讯作者分别是麻省大学医学院生物信息学和整合生物学部的翁志萍

Cell新发现:意料不到的保护“裸露”基因组的RNA

  2015年,来自冷泉港实验室的Andrea Schorn和Rob Martienssen等人发现了Piwi系统的一个重要奥秘:它们能利用一种蛋白质将细胞的基因沉默机器引导到了基因组中的正确位点,使得它能够让转座子失活,且不会干扰生物体自身的基因。从中他们指出,胚胎基因组之所以不会受到攻击是因为小

转基因小鼠的“三段进阶”

小鼠转基因的“三段进阶”。这里我们说的转基因小鼠是指:将一段外源基因随机插入到小鼠基因组中,获得过量表达目的基因的小鼠模型。转基因1.0 显微注射法构建完全随机插入转基因小鼠用显微注射针将线性化的外源DNA片段直接注入小鼠受精卵的原核中,使外源基因整合到小鼠基因组中,从而获得转基因小鼠。优点:过程较

PNAS:肝癌早诊率提高100%!基因筛查再发力!

   人类基因组中大约有20000蛋白质编码基因,要精确定位出导致某种疾病的特定基因或途径,就好比大海捞针一样。肝细胞癌(HCC)的情况也是如此,研究发现HCC患者的癌症基因组中有超过10000个突变,因此开发有针对性的治疗方法极其困难。日前,由大阪大学的Tetsuo Takehara教授领导的研究

转座子 Tol2 的转座机制与转座优势详述(一)

Tol2转座子提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。所谓转基因,顾名思义,就是外源基因整合进入宿主基因组,目前哺乳动物系统最常

科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理

   11月21日,肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题,解析了组蛋白去甲基化酶(KDM4B)在肿瘤中所扮演的新角色,从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细

CRISPR-Cas系统无需断链编辑基因

  英国《自然》杂志6月12日在线发表的论文称,美国科学家团队开发出一种完全可编辑的CRISPR-Cas基因组编辑系统,其可以介导DNA精准插入基因组。该方法无需在靶DNA中产生双链断裂,避免了由此导致的遗传编码的非预期改变。  CRISPR-Cas系统又称“基因魔剪”,自问世以来迅速成为生物科学领

新一代高性能基因编码的钙离子探针jGCaMP7系列

  CRISPR被称为“生物科学范畴的游戏规则改动者”,现已开展成为该范畴最炙手可热的研讨工具之一。不过,传统的CRISPR-Cas基因组编辑系统,要应用一个导游RNA将细菌蛋白质靶向定位到需求改动的特定基因组位点。6月12日,英国《自然》杂志在线发表的论文称,美国科学家团队开发出一种完整可编辑的C

中国农科院作科所牵头绘制出小麦D基因组精细图

   近日,中国农业科学院作物科学研究所研究员贾继增主导的研究团队在小麦D基因组测序研究中又取得新进展,该研究揭示了转座子(TE)在小麦基因组中的重要功能,研究成果将极大加速小麦重要基因克隆和分子育种研究。相关研究论文于2017年11月20日在线发表在《自然—植物》上。  小麦是世界上重要的农作物之

同济大学翁志萍等揭示机体对于piRNA入侵的应答机理

  反义Piwi相互作用RNA(piRNA)指导生殖细胞发育过程中已建立的转座子的沉默,正义piRNA驱动反义Piwi池的乒乓扩增,但生殖细胞如何响应基因组入侵尚不清楚。  2019年10月10日,同济大学翁志萍,麻省大学医学院William E. Theurkauf及昆士兰大学Keith Chap

遗传发育所等在表观遗传调控水稻转座子活性方面获进展

  转座元件是指在基因组中能够移动或复制并重新整合到基因组新位点的DNA片段,它们对动植物基因组的组成、进化和基因表达具有重要影响。而在宿主基因组中,如果失去对转座元件的有效抑制,这些元件将对基因表达和基因组的稳定性构成影响。水稻是主要的粮食作物同时也是重要的单子叶模式植物,其中

哥伦比亚大学新技术INTEGRATE精准基因编辑

  在最近一项研究中,哥伦比亚大学的一项新发现可以解决当前基因编辑工具(包括CRISPR)的一个主要缺点,并为基因工程和基因治疗提供了一种强有力的新方法。  他们的新技术称为INTEGRATE,即利用细菌跳跃基因将任何DNA序列准确地插入基因组而不切割DNA。目前的基因编辑工具依赖于切割DNA,但这

转座子 Tol2 的转座机制与转座优势详述(二)

当然,实践是检验真理的唯一标准,2009年,Zoltán Ivics等[3]就为大家详细阐述了Tol2转座机制在鼠中的应用,具体流程如图3,通过不断地表型筛选,Tol2系统可以用于构建转基因鼠和稳定的基因表达细胞系。 图3 利用Tol2构建转基因鼠和基因表达细胞系[3]3、Tol2转座优势

卡耐基科学研究所张钊:成功追踪到跳跃基因的移动

  卡耐基科学研究所张钊(ZZ Zhao Zhang)课题组7月26日在《Cell》发文,利用他们最新开发的方法追踪到了果蝇模型中跳跃基因的移动。  我们的DNA序列大约一半都是“跳跃基因”,它们也被称为“转座子”,在发育中的精子和卵子中,转座子在整个基因组的“移动”事关进化。但是,因为不稳定性,它

PNAS重要成果:可移动遗传元件

  在一位使用了隐形眼镜液的法国女性的红肿眼睛中,科学家们发现了几个新型寄生虫,这些寄生虫能像俄罗斯套娃一样相互嵌套。   来自法国国家科学研究中心等处的Bernard La Scola 和Christelle Desnues发现这一护理液被一种新型巨型病毒污染了,他们将这种病毒命名为Lent

狙击艾滋病毒――“引蛇出洞”还是“关门打狗”?

  曾庆平   有很多非专业或跨专业人士对于人类为何数十年攻克不了艾滋病难题感到迷惑不解,那是因为他们不太了解艾滋病毒致病的“特洛伊木马”机制。   艾滋病毒之所以能“摧毁”人类的免疫系统,是因为它们专门感染并杀死免疫细胞。不过,只要它们在免疫细胞内复制并产生新的病毒,人体都能立即识别它们并设法

2017单细胞扩增测序技术的最新进展

  细胞是构成生命体的结构和功能的基本单位,不同类型的细胞形态迥异,功能也各不相同。即使是同类细胞间看似相同,相互间也存在着广泛的细胞异质性。传统的群体细胞分析检测能更快速方便的获得大量数据并利于进行有效的统计学分析,但是随着研究的深入,这种基于群体细胞分析所获得的平均性数据,往往忽略了细胞个体间的

PNAS热点文章:表观基因组可因环境而改变

  长期以来,人们普遍认为作为有机体发育关键步骤的甲基化只是静态地DNA修饰,不会随环境条件变化而改变。Salk生物研究所的研究人员发现,处于逆境下植物的DNA甲基化模式会发生变化,从而改变对基因的调控。 科学家发现植物遭遇致病菌后,其表观遗传学密码会发生广泛的大量改

Nature发布轮虫基因组研究新成果

  有一群动物放弃了性,但却在进化过程中生成了460多种物种。本周的《自然》(Nature)杂志上发表了一篇关于蛭形轮虫(bdelloid rotifer)全基因组的研究论文,为揭示这一进化机制减少了些许神秘。   Woods Hole海洋生物学实验室(MBL)David Mark Wel