Cell、Nature共绘遗传互作图谱

在遗传学中,总体并不总是组成部分的总和。有时,两个基因共同作用所产生的一种表型,会不同于预期的简单地将两个基因的效应相加。近期来自加州大学旧金山分校的 Jonathan Weissman和Nevan Krogan研究小组在独立研究中首次系统地探索了酵母中的遗传互作。相关论文分别发表在《细胞》(Cell)和《自然方法》(Nature Methods)杂志上。 通过绘制酵母的遗传互作图谱,可以鉴别基因间的正负向相互作用,以及在同一蛋白质复合物或信号通路中发挥功能的分组基因。Weissman 实验室博士后Michael Bassik 说:“从酵母遗传互作图谱中取得的重要信息,使得我们和其他人均认为,它们在高等生物中可能也是有用的。我们希望能够在疾病模型中观测综合的致命性互作,广泛应用于鉴别癌症药物靶点。” 由于无法利用全基因组敲除菌株来绘制遗传互作图谱,因此研究人员采用了两种不同的RNAi策略进行成......阅读全文

细胞遗传学——比较基因组杂交(CGH)

·         Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are

著名遗传学家:用CRISPR重塑基因组

  美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项研究显示,用CRISPR/Cas9修饰垃圾DNA中的一个碱基,会改变基因组大量片段的折叠方式。这意味着CRISPR/Cas9有望用于治疗以基因组错误折叠为特征的疾病。  “实施靶向性手术可以重塑人类基因组,精确控制其折叠形式,”文章的通讯作者,Baylo

遗传学大牛Science发现基因组新奥秘

  来自斯坦福大学,霍德华休斯医学院的一组研究人员发现,当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候,通常这些基因会丢失,但如果能被留下来(也就成为了多余基因),就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论,而在哺乳动物中受到保护。  这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦

最热门基因组遗传学新闻一览

  本周包括苹果,IBM等在内的著名企业宣布了各自在生命科学领域研究的最新消息。  苹果推出ResearchKit  首先苹果Apple公司继新的数据共享平台 ResearchKit 首次亮相之后,将开始手机用户的遗传信息。据MIT Technology Review报道,“鼓励iPhone用户将其

草莓基因组研究取得成果-|《自然遗传学》

  《自然-遗传学》本周在线发表的一篇论文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该基因组为了解这一广受欢迎的水果的起源和演化历史提供了新见解。八倍体草莓的演化史。Edger et al.  八

遗传学大牛Science重磅成果:改写活体基因组

  遗传密码通常包含64个密码子, 但现在来自哈佛大学的研究人员和同事们设计出了只包含57个密码子的大肠杆菌基因组。在发表于8月18日《科学》(Science)杂志上的一篇论文中,该研究小组描述了这一计算机生成的基因组,并报告了在实验室中合成它的第一阶段。  论文的共同作者、哈佛大学George C

《AJHG》:孤独症基因组计划发表遗传学发现

  孤独症,又称自闭症,是儿童发育障碍中最为严重的疾病之一。据世界卫生组织估计,目前全世界“孤独症”儿童患者约3500万,中国约有60至180万患儿,也有学者认为目前中国可能有150万至780万患儿。   孤独症基因组计划(Autism Genome Project,AGP)是世界上最大的研究

北京基因组所实现对大样本全基因组数据的群体遗传学分析

  计算基因组学旨在发展理论和方法学,对基因组数据进行数据挖掘、提取信息。其中对遗传多态性,如基因频谱、单倍型结构等进行建模,利用群体基因组水平的遗传变异数据来推断群体的历史和变迁是群体遗传学的核心内容。传统的群体遗传学分析方法通常基于小样本数据,所推断的多为相对古老的历史事件,例如,被广泛应用的L

基因组“暗物质”挑战遗传学中心法则?

1953年,DNA双螺旋模型的提出标志着近代分子生物学的诞生。1957年,弗朗西斯·克里克进一步提出了经典的遗传学中心法则,开启了分子生物学时代。经过几十年的研究,科学家对于非编码RNA的认知极大丰富了人类对中心法则的理解。从广义上讲,非编码RNA在真核生物转录组中占据了非常大的部分,包括小RNA、

遗传学大牛Nature子刊发布基因组编辑新工具

生物医学研究和基因治疗需要非常精确的基因组编辑技术。哈佛医学院的研究人员为此开发了一种新的基因组编辑工具。这个重要成果十一月二日发表在Nature Communications杂志上,文章通讯作者是著名遗传学George Church和Luhan Yang。近年来基于核酸酶的基因组编辑工具特别火,比

遗传学大牛Nature子刊发布基因组编辑新工具

  生物医学研究和基因治疗需要非常精确的基因组编辑技术。哈佛医学院的研究人员为此开发了一种新的基因组编辑工具。这个重要成果十一月二日发表在Nature Communications杂志上,文章通讯作者是著名遗传学George Church和Luhan Yang。  近年来基于核酸酶的基因组编辑工具特

遗传学大牛将合成完整人类基因组?

  上周,哈佛医学院的著名遗传学家George Church和小伙伴们悄悄邀请了130名科学家、律师、企业家和政府官员,在波士顿召开了一次不对外公开的基因组会议。据说,他们在会议上探讨了体外合成完整大基因组的可行性,以及相关项目的实施。Church后来提供给STAT News的一份声明指出,这样的尝

高清3D基因组相互作用图生成

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500236.shtm

调控染色质相互作用的光遗传学工具被开发

  转录调控不仅仅是近端的启动子对基因表达的激活,远端的增强子也对基因的转录调控起到了重要的作用。增强子(enhancer)是一类基因组上的顺式元件。它通过与启动子发生相互作用,从而激活基因表达。这一过程的实质是DNA上不同的调控元件之间的相互作用。这种长距离的相互作用由染色质空间三维结构帮助建立和

牦牛基因组研究成果揭示高原适应的遗传学机制

  由兰州大学主导、深圳华大基因研究院以及中科院昆明动物所等多家单位联合完成的牦牛基因组研究成果于7月1日在国际著名杂志《自然-遗传学》(Nature Genetics)上在线发表(http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.23

孙方霖:表观遗传学-后基因组时代的领舞者

DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说:“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前,美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金,启动了表观基因组学研究计划,一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时,国家自然

最广泛的人类基因组相互作用图谱

  最近,英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员,开发并使用了一种新的技术,将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图,需要完成才能看到整幅图片,研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来,并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确

浙大教授Nature子刊:水稻基因组重测序及群体遗传学研究

  浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,中国水稻研究所的研究人员发表了题为“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章,以杂草稻群体为材料,通过基因组

定义癌症突变:破坏基因组3D相互作用的突变

  在细胞中,DNA紧密地包裹在蛋白质周围,并以一种复杂的3D结构包装,我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤,而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组:展开呈现给细胞基因表达机器,然后再将它们卷回去。  在3D染色质结构中,一些区域被称为“拓扑关联域(TADs)

北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组,在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展,该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计

两种南瓜基因组图谱绘制成功为育种改良提供遗传学参考

  南瓜不仅是西方万圣节用来点缀节日的装饰,对世界上多数人来说,更是一种必不可少的营养主食。最新出版的10月刊《分子植物学》杂志以封面文章形式介绍了中美科学家的合作成果:他们对两种重要南瓜品种进行了完整基因组测序,不仅揭示了南瓜与众不同的进化史,更可为南瓜育种改良提供遗传学方面的参考。  据物理学家

著名遗传学家表观遗传学新成果

  可卡因成瘾性的一个主要挑战在于,在戒断期之后的高复发率。但新的研究表明,在药物戒断过程中,我们DNA的变化可能为更有效的成瘾疗法开发,提供了有希望的方法。  加拿大麦吉尔大学和以色列巴尔依兰大学的研究人员,将这项研究结果发表在最近的《Journal of Neuroscience》。他们指出,戒

ChIPChip技术的介绍与应用

人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临,与基因信息相比较,人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白

癌遗传学

Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) SAGE is a powerful tool that allows the analysis of overall gene expression patterns with digital analysis. 

110个癌症相关基因!最新测序技术解析“DNA成环”

  在有史以来最全面的研究中,英国伦敦癌症研究所的科学家们发现了110个与乳腺癌风险增加有关的基因。  这项研究采用了一种先进的遗传学技术:Capture Hi-C分析与遗传性乳腺癌相关的DNA区域图谱,由此确定了增加女性患病风险的实际基因。  这一研究成果公布在Nature Communicati

双杂交系统的定义和应用

中文名称双杂交系统英文名称two-hybrid system定  义分别带有转录激活功能域与DNA结合功能域的两个杂合蛋白在酵母细胞内相互作用重组成转录因子,可报告基因转录表达,从而检测蛋白质之间相互作用的一种实验系统。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

遗传学控制分类

  遗传学控制分类是检验技师考试的内容,医学教育网搜集整理相关内容供大家参考。  1.近交系动物:近交系动物即一般称的纯系动物。此类动物是指采用兄妹交配(或亲子交配)繁殖20代以上的纯品系动物。  2.突变种纯系动物:是指实验动物正常染色体中某个基因发生了变异的具有各种遗传缺陷的突变品系动物。  3

酵母遗传学技术

Genome-wide Gene Expression Analysis (Richard Young Research Group,Whitehead Institute for Biomedical Research)A genoe-wide gene expression analysis u

药物遗传学概述

   药物遗传学(pharmacogenetics)是生化遗传学的一个分支学科,它研究遗传因素对药物代谢动力学的影响,尤其是在发生异常药物反应中的作用。  临床医生在使用某些药物时,必须遵循因人而异的用药原则。因为在群体中,不同个体对某一药物可能产生不同的反应,甚至可能出现严重的不良副作用,这种现象

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因