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盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验(四)

( 5 ) Arndt 等设计了一个多肽库。此库的设计基于 Jim-Fos 杂二聚,库中 b、c 和 f 残基来自于各自的野生型蛋白,a 位和 d 位为 Val 和 Leu ( 带有 a3Asn 在核心的插入例外,此插入引导期望的螺旋取向和寡聚态),e 和 g 残基则用三核苷酸作改变以得到等摩尔的 Arg、Lys、Gin 和 Glu 混合物(见注 7;参考文献 [8])。出人预料的是,最好地选择出来的成功者-Winzip-A2B1 杂二聚体(见注 18),在 g/e' 位缺少完全互补的带电残基,尽管选择过程是很彻底的。更确切些说,6 个 g/e' 对的两个预测为排斥的,提示得到的序列偏离简单的电荷互补规则( PV 假设)。可以假定,整体静电势(包括分子内和分子间相互作用)起主要的作用,并且与核心残基的作用,如像有利的堆积或立体冲撞,也可以调节这些 g/e' 作用(见参考文献 [......阅读全文

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧             实验步骤 本节讨论盘

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验

虽然表观上简单,盘绕螺旋(coiled coil ) 模体是高度专一的,并在理解三级结构及其形成方面具有重要意义。最常观察到的盘绕螺旋形态——平行二聚态,其一般的结构类型仍有待全面的描述。尽管如此,其结构已呈现出在某些特定位置需要某些特定类型氨基酸的严格规则。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德