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中国BIGD跻身国际生物组学数据库

测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及共享,成为一项重要任务。 目前,在国际上被认可的生物组学数据中心主要有美国的NCBI、欧洲的EBI及日本的DDBJ。要想在国际期刊发表论文,需要先将自己的原始数据提交到这三个官方指定的数据库中。这种情况表面上有利于国际科学数据的资源整合与共享,实际上却对中国的科学研究发展带来了很大的影响:这不仅影响了数据提交时的效率,更重要的是在数据下载时还会遇到各种限制,中国的科学家始终不能做自己数据的主人。 中国的生物组学数据产量约占全球的40%,是数据产出大国,却没有一个能够被国际认可的数据库系统,不得不将自己宝贵的数据资源交给他人代管。 ......阅读全文

5分钟了解:啥仪器让蛋白质组学界诞生如此多牛人大咖

  蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。” 1994年澳大利亚的Marc Wikins首次提出蛋白质组(Proteome)的概念,1997年

沃特世:同中国科学家深度合作共促糖组学创新

  分析测试百科网讯 如果说基因是生命的起点,那么糖蛋白的表现很大程度上就是研究生命功能的终点。人类蛋白中有50%以上都发生了糖基化的修饰,在病理和生理过程中糖蛋白发挥了至关重要的作用,在生物制药中最亮眼的单抗药100%都是糖蛋白药物。对糖蛋白和糖蛋白质组学的研究是贯穿生物制药、疾病与临床研究生生不

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

为什么代谢组学会成为最炙手可热的课题之一?

  代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”,自1999年以来,每年发表的代谢组学研究的文章数量都在不断增加。代谢组学在新药的安全性评价,毒理学,生理学,重大疾病的早期诊断,个性化治疗,功能基因组学,中医药现代化,环境评价,营养学等科学领域中都有着极其广泛和重要的应用前景,是一

向50年创新致敬, 一览质谱领军者的风采

  -访赛默飞中国区色谱和质谱业务高级商务运营总监李剑峰赛默飞中国区色谱和质谱业务高级商务运营总监李剑峰(左)和分析测试百科网总经理卞利萍女士(右)  今年是赛默飞质谱业务成立50周年,在第三届全国质谱分析学术报告会上赛默飞展出了向创新历史致敬的一系列内容,参会者随处可感受到红色庆典的浓郁和热烈。分

中科生信云平台发布 全国多组学技术应用高端论坛召开

  分析测试百科网讯 2019年8月8日,由上海中科新生命生物科技有限公司主办的“第一届全国多组学技术及应用高端论坛暨中科新生命生信培训班”在上海举行。本次论坛展示了蛋白质组和代谢组在多组学和生命大数据背景下的最新研究进展,促进行业内各研究领域的交流与合作,加强行业信息资源的共享与成果转化,邀请了各

赛默飞世尔科技“蛋白质组学解决方案”网络视频讲座

  3月30日下午,赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳向大家作了题为《蛋白质组学研究方法和Thermo蛋白质组学解决方案》的报告

布鲁克发布timsTOF fleX™ 为空间定位组学配置ESI/MALDI双源

——timsTOF Pro™系统进一步增强用于4D蛋白质组学的MBR-ddaPASEF和diaPASEF性能——timsTOF Pro超高灵敏度的4D蛋白质组学和4D脂质组学性能推进单细胞生物学研究——在ASMS 2019上还发布了用于4D蛋白质组学的新消耗品、软件合作伙伴及软件产品  分析测试百科

蛋白质组学的标准化(下)

  蛋白质组学信息学研究组   蛋白质组学信息学研究组的任务是教育蛋白质组学研究实验室最大程度地应用和实践生物信息学方法,向精确和复杂的蛋白质组学数据分析方向发展。iPRG积极地支持和参与开发和提高新的算法、软件工具以及蛋白质组信息学战略,目标是向全体会员教育和介绍这些新技术。iPRG已经发起了两

布鲁克推出用于生命科学等领域的最新质谱技术及解决方案

  2014年6月16日,巴尔的摩,马里兰州——今天,在第62届美国ASMS质谱年会上,布鲁克公司(NASDAQ: BRKR)宣布推出多款质谱产品,这些产品除了能在应用市场和工业化市场发挥作用外,还可应用于生命科学研究、蛋白质组学研究、临床研究等领域,另外,它还能为制药/生物制药/ CRO的客户提供

需求推动进步,质谱让人类生活更美好

  ——访安捷伦质谱事业部高级市场总监David Edwards、浙江大学潘远江教授  分析测试百科网讯 生命与健康研究是近些年诸多方向的关注热点,与个人基因、环境与生活习惯差异密切相关。随着分析技术发展的带动,生命与健康研究的深度亦不断被拓展:暴露组学、代谢组学、代谢流、多组学整合及结合分子生物学

“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁

  分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大

贺福初:中国蛋白质组学面临的机遇和挑战

  蛋白质组学是一门新兴但发展迅速的学科。近年来,国际上主要发达国家和地区纷纷加大了对蛋白质组学的支持力度,这一研究领域也由此成为各强国科技角力的新战场。10月12~13日,以“蛋白质组学:前沿与挑战”为主题的第381次香山科学会议在北京举行,与会的59名海内外科学家围绕蛋白质组学发

首届中国计算蛋白质组学研讨会在计算所召开

会议现场  11月10日,中科院计算技术研究所前瞻研究实验室生物信息学研究组主办的“首届中国计算蛋白质组学研讨会”在计算所开幕。   “计算蛋白质组学”是生物信息学中一个新的研究方向,其最基本的内容是蛋白质序列、结构和功能的规模化研究,一个简明的定义是“系统生物学的高通量分析”。美国

Xevo G2-S QTof和TransOmics:LC/MS差异组学分析系统(一)

Xevo G2-S QTof和TransOmics:用于蛋白质组学、代谢组学和脂质组学的LC/MS差异组学分析系统 Ian Edwards、Jayne Kirk和Joanne Williams 沃特世公司(英国曼彻斯特)应用优势■简化了工作流程、验证和数据解析 ■设计用于大规模代谢组学和蛋白质组学数

郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

  分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并

布鲁克总裁专访:科学大咖灵感加磅 timsTOF创新广泛开花

  分析测试百科网讯 东方人的思维更偏向于实用主义,比如大家常认为创新来自于应用驱动;世界上还有一种创新首先来自于技术或理论的突破,然后再去寻找应用的方向,布鲁克的timsTOF便是后者。2016年发布Trapped Ion Mobility捕集离子淌度质谱后,引起了组学和临床领域科学大咖们的广泛兴

第四届质谱论坛 MS助力生命与健康研究应用

  分析测试百科网讯 2019年10月22日,第四届质谱论坛在北京师范大学英东学术讲堂成功举办,由北京师范大学质谱中心与中国质谱学会主办,安捷伦科技(中国)有限公司、安特百科(北京)技术发展有限公司及首都科技条件平台-北京师范大学研发实验服务基地协办,本届论坛是庆祝中国质谱学会成立四十周年系列学术交

代谢组学:未来新方向

   加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说,我们自身其实就是一大组生化反应,“因此,基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组,而不是相反的路径。” Wishart说,有别于其他组学方法,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转

脂质组学:全新角度探索生命奥秘

  血浆中约70%的代谢物是脂类,脂类代谢是动植物的第一大类代谢。加上质谱法的广泛应用,大大加速了脂质组学的发展,脂质组学已成为代谢组学中最为活跃的研究领域之一。  万事万物都存在着辩证,尽管我们对高血脂深恶痛绝,心痛它对我们身体的摧残。但脂质却又是人体无法舍弃的重要组成,少了它,生命将一团乱麻以至

全新角度探索生命奥秘:脂质组学

  血浆中约70%的代谢物是脂类,脂类代谢是动植物的第一大类代谢。加上质谱法的广泛应用,大大加速了脂质组学的发展,脂质组学已成为代谢组学中最为活跃的研究领域之一。  万事万物都存在着辩证,尽管我们对高血脂深恶痛绝,心痛它对我们身体的摧残。但脂质却又是人体无法舍弃的重要组成,少了它,生命将一团乱麻以至

组学期刊三巨头:《基因组、蛋白质组与生物信息学报》

近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄  从编委到现任执行副主编,美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,以下简称GPB)期刊结缘已近10年。前些年,该刊编辑部不时找他约稿子,以解“缺

质谱沙龙第十五期活动报道

    2008年12月21日下午,质谱沙龙第十五期活动在第二炮兵总医院远程会诊中心会议室举行。来自发酵研究院、清华大学、二炮总医院、朝阳医院、北大医学院、北医三院、安贞医院、解放军307医院、中科院植物所、AB公司的各位专家、老师、学生20余人。  

赛默飞世尔举办“蛋白质组学及质谱基础知识”网络讲座

  2011年3月23日,赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了本月第三场网络视频讲座——蛋白质组学及质谱基础知识。赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳工程师为大家介绍了蛋白质组学、生物质谱的发展历史、基本原理、最新进展以及The

2020CMSS揭开帷幕,10大领域看质谱发展潮流

  分析测试百科网讯 2020年9月14日,由中国质谱学会(中国物理学会质谱分会)主办,分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020 CMSS)正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年,按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素

代谢组学:一项艰巨的任务

  学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢,一系列代谢通路,一大堆代谢产物,简直让人头晕眼花。然而,这又不能跳过。毕竟,DNA编码蛋白质,而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候,科学界对这些分子一无所知。  “如果你测定一滴血中的小分子,大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配,

聚焦科研市场 Agilent 6546 Q-TOF助力代谢组学新发展

  分析测试百科网讯 2019年4月18日,安捷伦科技有限公司在上海开元名都酒店隆重举行了质谱新产品6546 Q-TOF及新一代代谢组学/脂质组学解决方案发布会(Agilent新液质6546 Q-TOF实现宽动态范围下高分辨数据采集)。分析测试百科网采访了安捷伦科技学术与政府机构市场总监Steve

第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)

  北京蛋白质组研究中心  第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)  蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物

第二届质谱论坛:质谱在生物医药中的应用

清华大学 邓海腾教授   来自清华大学生命学院的邓海腾教授做了题为《Application of mass spectrometry beyond Proteomics》的报告,主要内容是关于质谱在代谢组学方面的应用。   回顾质谱百年发展历史,从