组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同组织类型确定具体的染色质需要量。应先按照下述方法制备染色质溶液,再进行交联免疫沉淀反应。所有溶液中均应添加蛋白酶抑制剂(10 μl/ml 的 PMSF,1 μl/ml 的抑肽酶和 1 μl/ml 的亮肽素,溶于 PBS 中)。实验步骤1. 交联1) 用刀片将冰冻或新鲜组织切成小块 (1-3 mm3)。2) 取一个空的 15 ml 锥形离心管,称重,放入组织后再次称重,计算组织重量。3) 在通风橱中配制交联所用溶液。每克组织加 1......阅读全文

组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同

组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同

染色质免疫沉淀分析

真核生物细胞状态是由内源和外源因素共同影响的,所有信号传递途径的终点都是DNA 。DNA 通过核蛋白复合物组成染色质,染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制--" 组蛋白密码" ,其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋白磷酸

染色质免疫沉淀DNA分析

实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法,来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性  DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布(用芯片或 DNA 测序)。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀  (X-ChIP) 实验的具

染色质免疫沉淀DNA分析

实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法,来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性  DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布(用芯片或 DNA 测序)。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀  (X-ChIP) 实验的具

染色质免疫沉淀技术的应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域,要想提供蛋白因子直接调控的证据,需要直接检测蛋白质-DNA的相互作用,而染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一种研

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点

染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体的特异性反应,可以真实地反映体内蛋白分子与基因组DNA结合的状况。下面我们就最基本的实验步骤,实验中的小技巧以及需要注意的问题简单介绍一下。1.

动物组织中DNA的制备

(一)原 理DNA是所有生物体的基本组成物质。真核生物DNA主要存在于细胞核中。制备DNA时应将细胞核膜打破方能释放出来。细胞中的DNA和RNA分别与蛋白质相结合,形成脱氧核糖核蛋白及核糖核蛋白。在细胞破碎后,这两种核蛋白将混杂在一起。因此,要制备DNA首先要将这两种核蛋白分开。已知这两种核蛋白在不

自然染色质免疫沉淀实验设计

1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima

染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

技术和方案18-染色质免疫沉淀

试剂、试剂盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制剂裂解缓冲液免疫共沉淀洗脱液TESTE仪器、耗材超声波粉碎仪实验步骤1.培养要分析的细胞。每一个样品,需要在三角瓶中培养 50~100ml 细胞至 OD600 大约为 1。2.甲醛处理细胞交联蛋白质和 DNA。加甲醛到细胞中至终浓度为 1%(37% 的甲醛按 1

染色质免疫沉淀法(Chromatin-immunoprecitation,ChIP)

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用1

序言随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学的研究逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域。研究某个蛋白因子的调控功能,可以通过对蛋白活性(激活或抑制其活性),蛋白数量(过表达Overexpression或基因缺陷型Knockout), 以及蛋白功能(功能缺陷

Active-Motif的染色质免疫沉淀试剂盒(ChIP)

ChIP(染色质免疫沉淀)方法是研究活体“蛋白质-DNA”相互反应的一种非常强大的工具。目前,这种方法用于染色质结构的动力学研究、转录因子的调节和辅助调节因子及其他表观遗传变化的研究。ChIP的使用过程分为三个主要步骤:第一步,在甲醛固定后分离和破碎染色质;第二步,使用感兴趣的蛋白的抗体完成特定染色

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用2

3. 染色质免疫沉淀Input对照:在进行免疫沉淀前,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照。Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联,DNA 纯化,以及最后的PCR或其他方法检测。Input对照不仅可以验证染色质断裂的效果,还可以根据Input中的靶序

不同植物组织中多糖的提取中AIR的制备

实验概要本人总结的多糖提取前AIR制备过程实验步骤AIR (alcohol insoluble residue)提取1)新鲜收取的植物在蒸馏水中清洗以除去培养基等物质,后冻干。2)将冻干的样品在液氮中研磨成粉末。3)AIR (alcohol insoluble residue)制备浮萍、拟南芥叶及根

植物染色质免疫沉淀试剂盒的使用说明

EpiQuik™植物染色质免疫沉淀试剂盒包括全套的试剂,允许试验者有效地在体内研究蛋白-DNA相互关系。整个过程可以在6小时内完成,产品效果远远优于任何竞争对手的试剂盒。EpiQuik™植物染色质免疫沉淀试剂盒适用于将特异性免疫沉淀与定性和定量PCR、ChIP-Seq、ChIP-on-chip结合使

免疫沉淀实验——制备抗体Sepharose-偶联物

实验材料蛋白质试剂、试剂盒NaClNa2CO3乙腈溴化腈甘氨酸仪器、耗材透析管滤纸实验步骤1.  1 ~30 mg/ml 的抗体在 4℃对 0.1 mol/l NaHCO3 / 0.5 mol/l NaCl透析 24 h,期间换液3次。透析液的体积应500倍于抗体溶液。2.  于4℃10 000 g

植物染色质免疫沉淀试剂盒(CHIP)的使用说明

蛋白质和DNA的相互作用是调控细胞反应过程的要素之一。染色质免疫沉淀分析方法(chromatin immunoprecipitation, CHIP)是研究活体内DNA和蛋白质的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技术通过三大步骤实现:第一,甲醛固定后染色质分离和断片;第二,运用特异蛋白

组织学——组织制备

·         Histological techniques (William H. Heidcamp)Very detailed guide to histological techniques, like  fixation, dehydration, embedment and subs

从石蜡包埋固定的组织中制备-RNA-实验

实验材料 石蜡包埋的组织样品试剂、试剂盒 甲酰胺消化缓冲液乙醇肝糖异丙醇苯酚 氯仿蛋白酶 KTrizol二甲苯仪器、耗材 微量离心管恒温箱实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去离子化的甲酰胺焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水消化缓冲液(lmol/L 异硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巯基乙醇

从石蜡包埋固定的组织中制备-RNA-实验

            实验材料 石蜡包埋的组织样品 试剂、试剂盒 甲酰胺 消化缓冲液 乙醇 肝糖

从石蜡包埋固定的组织中制备-RNA-实验

该方案是由 Godfrey 等改进 Fisher 的方案发表的。此前已有从固定组织中纯化 RNA 的方案发表。Ambion 和 Roche 发明了从石蜡包埋的组织中纯化 RNA 的商品化试剂盒。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验材料石蜡包埋的组织样品试剂、试剂盒甲酰胺

组织芯片的制备

实验方法原理 首先制作模具蜡块(受体,recipient)。从供体蜡块(donor)上取样,取样针分别有 0.6 mm、1.0 mm、1.5 mm 和 2.0 mm 几种,在 1 个大小 45 mm×20 mm 的模具蜡块上,以 0.6 mm 取样针间隔 0.1 mm,可排列 1000 余个

组织芯片的制备——冰冻组织芯片

实验材料新鲜组织试剂、试剂盒OCT 包埋剂切片黏合剂仪器、耗材1 mm 孔径针载玻片实验步骤将每个需要制备 TMA 的新鲜组织,不经固定包埋在 OCT 包埋剂中, -20℃ 中冻成块。另外,再将 OCT 包埋剂倒在长 3 cm×宽 1.5 cm×高 lcm 的模具中, -20℃ 中冻成块。用特制的

从实体组织中制备粗微体实验

从大鼠肝脏制备微体 从狗的胰脏中制备粗微体             实验材料 雄大鼠

从实体组织中制备粗微体实验

实验材料 雄大鼠试剂、试剂盒 蔗糖蔗糖HM仪器、耗材 玻璃板实验步骤 1. 用断颈法杀死约 150 g 重的雄大鼠,大鼠的数量取决于要制备的粗微体的数量。由于一个 150 g 重的大鼠肝(6 g)大约每克肝蛋白含有 10 mg 粗微体,所以大鼠的数量可以以回收率为 50% 来进行估计。2. 流干血液

从实体组织中制备粗微体实验

从大鼠肝脏制备微体从狗的胰脏中制备粗微体实验材料雄大鼠                                                          试剂、试剂盒蔗糖                                                        

利用-Trizol-从植物组织中制备-RNA-实验

实验材料 植物组织试剂、试剂盒 Trizol氯仿异丙醇乙醇DEPC处理过的水液态N2NaCl柠檬酸钠仪器、耗材 转子-定子均化器研钵和杵圆锥形管实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂Trizol(Invitrogen)氯仿异丙醇乙醇,70%,用焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水配制DEPC 处

利用-Trizol-从植物组织中制备-RNA-实验

下述方案是经修改过的 Trizol 方案,用于从植物组织中分离 RNA,其中增加了一个高盐异丙酵沉淀步骤,以选择性地沉淀 RNA,而将多聚糖和蛋白多糖留在溶液里。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验材料植物组织试剂、试剂盒Trizol氯仿异丙醇乙醇DEPC处理过的水液态