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TLP基因的表达模式分析

实验概要本实验对水稻、拟南芥及杨树的TLP基因表达模式进行了分析,为进一步研明植物中TLP基因的功能奠定基础。实验步骤1. 水稻TLP基因的RT-PCR分析 1) 植物材料选取水稻的根、茎、叶、花和种子的新鲜组织用于RNA的提取。水稻材料采集后,用液氮速冻,以保证RNA不被降解,然后冻存于-70℃超低温冰箱,以备提取组织RNA时使用。 2) 植物组织提取RNA试剂和器皿:所有试剂都用DEPC水配置,所有器皿都在180℃烘8hr或者在双氧水中泡0.5hr以上。试剂:RNA抽提缓冲液:0.2mo1/L Tris-Cl (pH=0.8),0.4mo1/L LiC1,25mmol/LEDTA,1% SDS;3mol/L NaAc (pH=5.2);2mol/L LiCl;RNase free的水饱和酚;氯仿;无水乙醇;70%乙醇;Dnase(RNase free)等。步骤:新鲜的植......阅读全文

TLP基因家族的系统发生分析

实验概要本实验分别从拟南芥、水稻和杨树基因组中鉴定出了11, 14和11个TLP基因。通过系统进化树分析了这三个植物物种中TLP基因的进化关系。通过分析TLP基因的染色体位置分析了在三个物种中的基因重复扩张的模式。利用针对进化距离的相关分析对F-box和TUB结构域的协同进化规律进行了分析。