Antpedia LOGO WIKI资讯

利用实时定量PCR和2-△△CT法分析基因相对表达量

利用实时定量PCR和2-△△CT法分析基因相对表达量 METHODS 25, 402–408 (2001)Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 2-△△CT MethodKenneth J. Livak* and Thomas D. Schmittgen¶,1*Applied Biosystems, Foster City, California 94404; and ¶ Department of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy,Washington State University, Pullman, Washington 99164-6534&nbs......阅读全文

实时荧光定量PCR

聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析。无论定性还是定量分析,分析的都是PCR终产物。但是在许多

PCR Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(一)

以前只要提到基因表达分析,人们就会想到荧光定量PCR;只要提到高通量基因表达分析,人们会首先想到基因芯片。虽然荧光定量PCR仪几乎每个实验室都有,但是做芯片就不一定每个实验室都具备这个条件了。那么只有一台荧光定量PCR仪是否也能进行高通量的基因表达谱分析呢?QIAGEN 推出的RT2 Profile

实时荧光定量PCR技术在分子生物学和医学研究等领域的...

  定量PCR是在定性PCR技术基础上发展起来的核酸定量技术。实时荧光定量PCR技术于1996年由美国Applied biosystems公司推出,它是一种在PCR反应体系中加入荧光基团,利用对荧光信号积累的实时检测来监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。该

实时荧光定量PCR(Real-TimePCR)实验流程

   一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)   不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-TimePCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。   在总rna的提取过程中,注意避免m

通过2 -△△CT 方法,利用实时定量PCR技术分析相对基...(三)

2 - △ CT ’ 方法的推导通过内标 RNA 可以对加入 RNA 的量的差异进行校正。2-△△ CT方法的数据分析的一个特点就是能够利用实时 PCR 实验的一部分数据来完成这种校正。在其它的方法不能定量初始 RNA 量的时候:例如,在能得到的 RNA 量非常有限的时候或者需要处理高通

实时荧光定量PCR(Real-TimePCR)实验流程(二)

五、cDNA与引物质量检测    取0.2ml薄壁PCR管,编号。向各管中加入含染料2×PCRTaqMix10ul;加入正反向引物各0.5ul(引物浓度10uM),向管中加入混合的cDNA各1ul。各管补加水至20ul。    组份加量    2×PCRTaqMix10ul    10uMPrime

实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)实验流程

一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总rna的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2u

实时荧光定量PCR原理、特点和应用领域(三)

1、Ct值的定义在荧光定量PCR技术中,有一个很重要的概念--Ct值。C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。2、荧光域值(threshold)的设定PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号,荧光域值的缺省设置是3-

实时荧光定量PCR原理、特点和应用领域(一)

聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析。无论定性还是定量分析,分析的都是PCR终产物。但是在

QPCR常见问题及其分析

一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为10

QPCR常见问题及其分析

一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为10

如何确定转基因拷贝数

鉴定转基因植物的第一步就是要确定被转基因已经稳定的整合到了染色体上。第二步任务就是评估有多少个转基因拷贝,以及每个转基因的表达水平如何。一般经过上游表达载体的设计构建以及下游转化体系的建立、转化品系的筛选鉴定等一系列步骤后,即获得 T 0 代转基因植物。在转化过程中,外源 DNA 随机插入植物

数字PCR的前世今生:特点、优势和局限性

数字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一种核酸分子绝对定量技术。相较于qPCR,数字PCR可让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的绝对定量。数字PCR是近年来迅速发展起来的一种定量分析技术。该技术结果判定不依赖于扩增曲线的循环阈值(Ct),不受扩增效率的影响,具有很好的准确度

普通 PCR、实时荧光定量 PCR 和数字 PCR 对比分析

  提起 PCR,在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳,无人不知无人不晓,其影响之深,应用之广可见一斑。    1985 年,美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应(PCR),实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而,采用 E-

普通 PCR、实时荧光定量 PCR 和数字 PCR 对比分析

 提起 PCR,在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳,无人不知无人不晓,其影响之深,应用之广可见一斑。    1985 年,美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应(PCR),实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而,采用 E-coli D

QPCR常见问题及其分析

一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为100-400

荧光定量PCR:简介,原理,应用

荧光定量PCR简介 荧光定量PCR检测技术诞生至今已10多年的时间,而其应用一直都没广泛展开,究其原因,无外乎受制于相关仪器、试剂和技术的发展。近期,尤其是08年以来,仪器和试剂是遍地开花,这也使科研人员均跃跃欲试,都想借此技术使自己的研究能突飞猛进,发展势头通过查找每年所发表的文章数可一目了然。据

感染性疾病基因诊断进展

感染性疾病有病原微生物引起,致病的病原微生物主要有病毒、细菌、衣原体、支原体和螺旋体等。这些病原体的传统检测方法通常采用形态学检查,体外培养和免疫学试验。但对某些难以培养的病原体,抗原抗体检测不能判断体内病原体 DNA 或 RNAde 复制情况,或存在检测灵敏度低等问题。自聚合酶链反应( PCR )

荧光定量PCR:简介、原理、应用

荧光定量PCR的应用分子生物学研究1、核酸定量分析。 对传染性疾病进行定量定性分析,病原微生物或病毒含量的检测 , 比如近期流行的甲型H1N1流感, 转基因动植物基因拷贝数的检测,RNAi 基因失活率的检测等。2 、基因表达差异分析。 比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异 ( 如药物处理、物理

实时荧光定量PCR

Real Time PCR实时荧光定量PCR   其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料(如: SYBR GREEN I )或特异性的荧光探针(如: Taqman 探针),实时检测荧光量的变化,获得不同样品达到一定的荧光信号(阈值)时所

盘点:31项与免疫学有关的分子生物学实验技术

  现代分子生物学和免疫学的进展加深了我们对许多疾病的了解,并且导致了免疫新策略的产生,免疫学检测方法可分为体液免疫和细胞免疫测定。本文盘点了与免疫学有关的分子生物学实验技术汇总。  一、GST pull-down实验  GST是指谷胱甘肽巯基转移酶,GST pull-down实验是一个行之有效的验

如何做好荧光定量PCR实验

荧光定量PCR实验指南一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备;二、技术关键:1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比

盘点:分子诊断常用技术50年的沿革与进步

  一、基于分子杂交的分子诊断技术  上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年,由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增,人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现,为基于分子杂交的体外诊断方法进行了

一文读懂分子诊断常用技术

  基于分子构象的分子诊断技术  (一)变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)与单链构象多态性(single strand conformation polymorphism,SSCP)  1970~1980年间,Fischer等

一文读懂分子诊断技术、PCR技术、基因测序技术

  四、定量PCR(quantitative PCR,qPCR)  相比于其他分子诊断检测技术,qPCR具有2项优势,即核酸扩增和检测在同一个封闭体系中通过荧光信号进行,杜绝了PCR后开盖处理所带来扩增产物的污染;同时通过动态监测荧光信号,可对低拷贝模板进行定量。正是由于上述技术优势,qPCR已经成

ABI实时定量PCR常见问题

1.      定量PCR仪的开关机顺序是怎样的?    按照正确的开关机顺序操作,有助于延长仪器的使用寿命,减少仪器出故障的频率。开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启定量PCR仪主机,等主机面

高质量RNA的标准

real time RT-qPCR 是检测样本中特定基因表达量的有效方法,包含逆转录步骤和定量PCR步骤。好的开始是成功的一半,获得高质量的、能正确反应样品中转录情况的RNA,对于其后的定量结果,自然是非常重要的。Mikael Kubista,教授, R&D TATAA Biocenter主

预防癌症新手段:微滴式数字PCR(ddPCR)技术

  “预防就是治疗”--《众病之王:癌症传》  战胜癌症,早期预防、早期发现是关键。癌症患者如果在晚期被发现,90%的患者都会死亡,而肿瘤在早期发现,5年的存活率是90%。早期发现恶变细胞踪迹,可以通过干预手段,提高自身免疫力,也可以完整切除,结合化疗,治疗疾病。  微滴式数字PCR(Droplet

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

  HRM介绍    HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

HRM介绍     HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探