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土壤水分条件是微生物呼吸活性及生态功能实现的重要因素，干旱或极端淹水均不利于土壤中多数微生物实现最佳能量生产与代谢。土壤从干旱向淹水的转变过程会在短时间内发生，微生物活动受到刺激并被抑制。目前，对该过程中潜在微生物的响应机制仍缺乏了解。 中国科学院城市环境研究所研究员姚槐应研究组通过土壤DNA与RNA的提取，在基因和转录水平上对细菌和真菌的rRNA基因片段进行高通量测序分析，比较水稻土在淹水过程中当前所有（the total/present community）与潜在活性状态的微生物群落（the potentially active community）变化的差异，并分析微生物在土壤迅速淹水后的群落演变轨迹。结果表明，细菌群落比真菌群落对淹水的响应更为敏感，且与酶活性相比，土壤呼吸与群落结构的变化具有更强的相关性；按照细菌物种相对丰度在时间上的聚类情况，细菌群落被分为快速、中间和延迟三种不同应答模式，各模式的群落在系统发育......阅读全文
硫酸盐还原菌（SRB）广泛存在于土壤、海水、污水等缺氧和局部缺氧环境中，我国大多数土壤中都含有不同浓度的硫酸盐还原菌。全国土壤腐蚀试验站网长期试验结果表明，70%以上试验站存在硫酸盐还原菌腐蚀现象。加拿大2000km以上管线腐蚀调查表明，微生物腐蚀约占地下管线总腐蚀发生量的60%
地球上的高等动物和植物通常存在一定的地理分异规律，如谚语中常说的“一方水土养一方人”，但长期以来由于技术手段的限制，土壤微生物的地理分异规律及其功能意义却不甚清楚。 最近，中国科学院南京土壤研究所贾仲君课题组与何园球团队合作发现，酸性土壤中（pH4.9）存在一种活性氨氧化古菌，与该古菌亲缘关
土壤是蔬菜优质高产zui重要的物质基础，但随着设施蔬菜的大面积发展，土壤恶化现象越来越严重，土壤恶化主要体现在土壤板结、盐渍化加重、微量元素缺乏、土壤菌群失调等方面，今天就为大家介绍一下菜田土壤改良措施。 一、土壤板结、盐渍化加重危害：在大部分菜区，都存在长期大量不合理施用化学肥料的现象，
在寒冷的冬季，使用生物菌肥不仅可以活化在土壤中被固定的营养元素，且有利于根系的生长，但是不可盲目使用，应该根据不同的棚室土壤的环境情况来确定，否则很可能就会花了钱却得不到效果。一是土壤湿度。 土壤含水量过大或不足都会影响生物菌肥的施用效果。因为生物菌肥内
菌株分离(separation)就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开,并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选,进而得到所需微生物的过程.菌株分离、筛选(screening)虽为两个环节,但却不能绝然分开,因为分离中的一些措施本身就具有筛选作用.工业微生
菌株分离（separation）就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开，并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选，进而得到所需微生物的过程。菌株分离、筛选（screening）虽为两个环节，但却不能绝然分开，因为分离中的一些措施本身就具有筛选作用。工业微生
菌株分离（separation）就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开，并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选，进而得到所需微生物的过程。菌株分离、筛选（screening）虽为两个环节，但却不能绝然分开，因为分离中的一些措施本身就具有筛选作用。工业微生
菌株分离(separation)就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开,并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选,进而得到所需微生物的过程.菌株分离、筛选(screening)虽为两个环节,但却不能绝然分开,因为分离中的一些措施本身就具有
噬菌体是环境中普遍存在的一类专门侵染细菌的病毒。此前，科学家对噬菌体能否抑制土壤中的病原菌不甚了解。 当地时间12月2日，《自然-生物技术》发表南京农业大学资源与环境科学学院最新研究成果。该成果揭示，噬菌体不仅可以“专性猎杀”和“精准靶向”土传青枯病的病原菌，降低其生存竞争能力；同时还能够重
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环的
二、高通量测序在土壤微生物研究中的应用 1.1 研究土壤微生物的物种多样性 微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性，或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group)，通过某
近日，中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响，并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Micro
近日，中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响，并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Micro
近些年，集约化农业发展中的不合理措施，如化肥农药的持续过量投入以及经济作物的单一连作等，导致土壤微生物群落结构严重失衡，生态功能急剧削弱。土壤养分周转不畅、污染难以消解、土传病害频发就是土壤微生态失衡重要证据，这些也是农业资源与环境领域亟待解决的难题。 来自南京农业大学资源与环境科学学院沈其荣
稻田是重要的温室气体排放源，其中甲烷（CH4）排放对稻田总温室效应贡献在75%以上。稻田排放的CH4占到全球CH4排放的12%，减少稻田CH4排放对减缓全球温室气体排放具有重要意义。生物质炭是有机材料在少氧或无氧条件下裂解产生的一类含碳量高、疏松多孔的物质。生物质炭在农田上的施用具有增加土壤碳固
盲目提高化学肥料的用量不一定打造出土壤的高肥力，反而土壤的肥力还会下降，甚至危及到土壤自身的健康状况。其实，土壤高肥力的表现不仅仅存在在高养分上面，有机质丰富，有益微生物活跃，通透性、缓冲性好，养分的转化效率高都是土壤高肥力的一种体现。那么，要想土壤获得较高的肥力，它的基础是什么呢？笔者认为，
湿地岸边带作为连接内陆水体与陆地生态系统的交界面，不仅是氮循环反应的“热区”，亦是温室气体——氧化亚氮的高释放区。前期大量研究表明湿地岸边带系统能够有效拦截陆源污染和净化水体，但其微观机理仍不清楚。 中国科学院生态环境研究中心祝贵兵研究组通过构建针对各氮循环反应微生物功能基因的高通量测序分析、
细菌种类多、繁殖快、适应环境能力强，因此，细菌广泛分布于自然界，在水、土壤、空气、食物、人和动物的体表以及与外界相通的腔道中，常有各种细菌和其它微生物存在。在自然界物质循环上起重要作用，不少是对人类有益的，对人致病的只是少数。 一、细菌在自然界的分布 （一)土壤中的细菌 土壤中含
一个国际研究小组在最新一期《科学》杂志上发表论文称，根据其绘制出的首份全球土壤细菌群落图谱，占比仅为2%的500多种细菌主导着整个地球土壤的生态过程，它们将成为科学家未来的重点研究目标。图片来源网络 土壤中的细菌占地球生物总量的很大一部分，它们在调节陆地碳动态变化、营养循环及植物生产能力等
芬兰日前研究发现，白腐菌可用于净化受工业有毒物质污染的土壤。白腐菌是一种能降解枯败树木的普通菌类，它可分解二恶英和多环芳烃等致癌性有毒成分。 芬兰阿尔托大学的艾瑞卡·温奎斯特（Erika Winquist）发现，白腐菌能净化受污染的土壤中难以通过传统方法根除的毒性有机化学成分。在三个月里，白腐
微生物群落组成与多样性的空间格局及对环境变化的响应研究，是揭示地球上生物多样性产生和维持机制的前提。近年来，土壤微生物的分布格局及其驱动机制研究成为国际上的研究热点。 中国科学院东北地理与农业生态研究所农田分子生态学科组科研人员对我国东北典型黑土农田样带细菌、真菌和酸杆菌地理分布格局进行了深入
QuEChERS_高效液相色谱测定黄瓜和土壤中甲基硫菌灵和多菌灵摘要: 建立了黄瓜和土壤样品中甲基硫菌灵和多菌灵的QuEChERS-高效液相色谱-电喷雾串联质谱( HPLC-ESIMS/MS) 检测方法。样品用乙腈溶液提取，经QuEChERS 方法净化，以Agilent ZORBAX SB-C18色
硝化作用是氮素循环过程中非常重要的一个环节，它包括将铵态氮氧化成亚硝态氮的氨氧化过程和将亚硝态氮氧化成硝态氮的亚硝酸盐氧化过程，参与这两个过程的功能微生物分别是氨氧化微生物和亚硝化微生物。传统的观点认为，酸性土壤的硝化活性很弱，这是由于在酸性条件下，氨氧化微生物氨单加氧酶（AMO）的底物——NH
一、实验原理稀释平板测数是根据微生物在高度稀释条件下固体培养基上所形成的单个菌落是由一个单细胞繁殖而成这一培养特征设计的计数方法，即一个菌落代表一个单细胞。计数时，首先将待测样品制成均匀的繁殖稀释液，尽量使样品中的微生物细胞分散开，使其成单个细胞存在，否则一个菌落就不只是代表一个细胞，再取一定稀释度
土壤板结是指土壤表层因缺乏有机质,结构不良,在灌水或降雨等外因作用下结构破坏、土料分散,而干燥后受内聚力作用使土面变硬，这个硬度的检测可以先用土壤硬度仪进行测定。土壤板结会导致透气性下降，这样就会使得根吸收到的氧气减少，直接导致的结果就是根系的有氧呼吸减弱甚至进行无氧呼吸，然后就是根系提供的能量减少
消落区是陆地生态系统和水生生态系统的过渡带，是一种分布较广泛的湿地生境。消落区生态系统中一个重要生态过程为反硝化作用，它是反硝化细菌在厌氧条件下将硝态氮转化为气态氮（N2和N2O）的过程，进而将氮从土壤生态系统中彻底的移除，因此消落区具有净化水质的生态功能，同时也是N2O温室气体的重要来源。消落
随着生产水平的提高，植烟土壤长期大量施用化肥，少施或不施有机肥，造成烤烟大田生长季节土壤封闭性强，通透性变差，土壤碳氮比失调，腐殖质含量低，导致土壤板结紧实。在复种指数较高的地区，往往采用免耕移栽，致使烟草根系发育不良，尤其是侧根较少。如果长期不向土壤添加有机质，是较难以维系植烟土壤肥力和生产力的。
氮是高寒生态系统的限制性营养元素，对固氮细菌多样性及其影响因素的研究有助于解决高寒生态系统土壤氮缺乏的难题。 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所科研人员在祁连山区冰沟选择了两种典型植被进行样方调查和土壤样品采集。通过对其土壤理化性质进行测定，对两种植被土壤中的固氮细菌多样性和丰度用克隆文库（
酸性土壤(pH<5.5)在全球范围内广泛分布，约占陆地无冰区表面的30%。但酸性土壤硝化作用的机理一直不甚清楚，成为全球氮循环研究的热点和难点。 中科院生态环境研究中心贺纪正研究员课题组多年来致力于土壤硝化微生物及硝化作用机理研究，取得了系列研究成果。2007年，他们在 Envi