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中国学者葡萄基因组学研究取得新进展

葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种,成为植物品种选育的有效手段。因此,开展葡萄基因组学研究,将极大地促进葡萄产业的发展。 中国科学院武汉植物园园艺作物学科组深入开展了葡萄基因组学研究,并取得一系列进展。该课题组研究人员首先构建了葡萄种间杂交F1群体,利用 RAD-seq分子标记技术,构建了一张目前文献报道的最高密度遗传图谱。该图谱含有完整的序列信息SNP分子标记约4400个,全部19个连锁群总遗传距离约2000厘摩。该遗传图谱将用于葡萄关键农艺性状QTL定位,并开发与优异性状紧密连锁的分子标记,应于用葡萄分子标记辅助育种。 同时,该课题组研究人员还利用国际上公布的葡萄......阅读全文

分子标记

内容:一、遗传标记 二、DNA分子标记 三、染色体原位杂交 四、DNA分子标记的应用 长期以来,植物育种中选择都是基于植株的表型性状进行的,当性状的遗传基础较为简单或即使较为复杂但表现加性基因遗传效应时,表型选择是有效的。但水稻的许多重要农艺性状为数量性状,如

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

小麦基因组测序 为第三代育种绘制“高清地图”

  不久前,中国科学院遗传与发育生物学研究所发表于国际著名期刊《自然》的论文称,该所研究团队已完成小麦A基因组测序和染色体精细图谱绘制。这是继2013年,该团队成功绘制出小麦A基因组祖先种乌拉尔图小麦基因组草图并发表于《自然》之后,在此领域的又一项重大成果。图片来源于网络   中国科学院遗传与发育生

花生二倍体野生种全基因组测序完成

  国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative, IPGI)——由多国作物遗传学家参与的国际团队,于2014年4月2日宣布,历经数年努力后成功完成了世界上首个花生全基因组测序。新测定的花生基因组序列将为世界各地的研究人员和植物育种者使用,来促

作物基因组学研究进展(二)

⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一,小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响,小麦生产面临严峻的挑战,对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦(Triticum aestivum L.)是3个不同亚基因组形成的异源

西南大学最新文章:抑郁症基因表达谱分析

  重度抑郁症(major depressive disorder, MDD)是一种环境与遗传因素共同作用导致多个基因功能失调的复杂疾病, 近期来自西南大学认知与人格教育部重点实验室的研究人员采用多脑区以及基因集合的分析模式, 搜集了前人研究中13个来源于不同脑区的、包含患者与对照组脑转录组数据的数

香山科学会议综述:学科交叉为植物染色体工程注入新活力

          安徽中医学院中药标本中心收藏有药用植物蜡叶标本7万多份,数量居全国医药院校之首。除一般的标本外,还有许多地道药材和特色药材的专题标本和珍稀濒危的模式标本,为研究安徽和全国中药材资源,以及普及中药知识提供了丰富的实物

两篇Cell文章:发布CRISPR研究重大突破

  发表于10月9日《细胞》(Cell)杂志上的两篇研究论文中,来自加州大学旧金山分校的科学家报告称他们应用一种新型的、精确的方法开启和关闭了细胞内的基因。这一成果有可能促成更好地了解疾病以及开发出新的治疗方法。  这一研究进展的核心是一个叫做SunTag的新发明。SunTag实质上是一套分子挂钩,

从基因组到新品种 一根黄瓜也能“顶天立地”

  1月8日是2018年度国家科技奖励大会召开的日子。2018年度国家自然科学奖二等奖和科技进步奖二等奖获奖团队部分成员黄瓜的驯化过程  清晨,黄三文和顾兴芳在进入人民大会堂参加大会之前合了一张影,成为他们科研友谊的见证。  他们同来自中国农业科学院蔬菜花卉研究所(以下简称蔬菜所),同样研究黄瓜,在

首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表

  2012年12月24日,由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结

“大数据”助力人类疾病研究

  近年来,科学家们依托“大数据”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,分享给大家!  图片来源:CC0 Public Domain  【1】Front Immunol:大数据帮助设计更好的流感疫苗  doi:10.3389/fimmu.2019

武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展

  葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种

micro RNA(miRNA)综述-3

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR

小分子RNA——microRNA综述(2)

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序

专家经验谈:活病毒成像指南

  对于大多数生物学过程来说,所见即所得。由于病毒在感染性疾病中的作用,许多生物学家希望能够实时观察病毒的活动。要观察病毒感染细胞和病毒装配的过程,荧光成像是少数几种非介入性的途径之一。进行这样的研究需要带灵敏相机的高质量显微镜,能支持每秒多次成像。还需要确认荧光标签和实验设置不会干扰到我们想要研究

多位专家指导:如何进行多种成像实验

  超高分辨率显微镜赋予了人们突破衍射极限的能力,研究者们在这一技术的帮助下已经获得了许多固定样本的漂亮图像。不过,用超高分辨率显微镜进行活细胞成像,将是一个更大的挑战。  样品制备的重要性  样品质量对于超高分辨率显微镜而言特别重要,这一点与传统显微成像是一致的。在初次涉足超高分辨率成像时,之前的

华中农业大学Nature子刊公布测序新成果

  来自华中农业大学、新加坡基因组研究员以及加州大学河滨分校等机构的研究人员报告称他们绘出了甜橙(sweet orange)基因组草图,为未来了解及改善许多重要的柑橘性状提供了有价值的资源。相关成果发布在11月25日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。   领导这一研

华中农业大学Nature子刊发表测序新成果

  来自华中农业大学、新加坡基因组研究员以及加州大学河滨分校等机构的研究人员报告称他们绘出了甜橙(sweet orange)基因组草图,为未来了解及改善许多重要的柑橘性状提供了有价值的资源。相关成果发布在11月25日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。   领导这一研

Cell重要论文:解密第六种碱基

  人体的几乎每个细胞都携带着一份完整的人类基因组。那么人类眼中的感光细胞为何会与心脏或脾脏的细胞如此的不同?   答案当然是因为每种细胞类型只选择性表达了一套独特的基因,而主动沉默了与它的功能无关的基因。科学家们很早以前就知道,那样的基因沉默是借助于对DNA碱基胞嘧啶的化学修饰,生成称作5-甲基

《Science》12月最受关注的文章

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

PNAS、Nature共造基因测序新方法,不“放过”任何碱基

  日前,来自哥伦比亚大学、哈弗大学及美国国家标准技术局的研究人员报道了使用蛋白纳米孔阵列实现了单碱基分辨率的实时单分子电子DNA测序,相关结果以《Real-Time Single Molecule Electronic DNA Sequencing by Synthesis Using Polym

马涵慧博士再发CRISPR研究成果

  最近在《Journal of Cell Biology》发表的一项研究中,美国麻省大学医学院的科学家,揭示了“CRISPR-Cas9机器在活细胞内如何运作”的重要新细节,对于开发使用强大基因编辑工具的治疗方法,具有重要的意义。  本文通讯作者、生物化学与分子药理学教授Thoru Pederson

发育生物学领域最新研究进展

  本期为大家带来的是发育生物学领域的最新研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Eur Respir J:新研究揭示肺脏发育高清图谱  DOI: 10.1183/13993003.00746-2019  过早出生的婴儿常常患有肺部发育不良,并可能面临危及生命的后果。为了给这些婴儿提供新颖的治疗

科学家发现控制红苹果着色分子机制

  红苹果,人人爱。可是,苹果皮为什么能进化出诱人的红色,是个有趣而复杂的问题。  4月2日,《自然-通讯》在线发表了中国科学家的最新成果,诠释了苹果为什么这样红的奥秘。中国农业科学院果树研究所(以下简称果树所)苹果资源与育种创新团队在完成了苹果花药培育纯系高质量基因组测序的基础上,揭示了反转座子控

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

基因组学推动生命科学大步向前

  2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。   一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。   事实上,伴随着2

从传统育种到全基因组选择 动物遗传育种进入新时代

  全基因组选择,是近年来畜禽分子育种的全新策略,已成为动、植物分子辅助育种的热点和趋势。它突破了对候选个体从表型选择到基因组选择,解决了畜禽肉质和抗性等难以选育性状的障碍,提高了遗传评定的准确性,实现了低成本早期选择。  在国家863计划课题“基于高密度SNP芯片的牛、猪基因组选择技术研究”支持下

厦大特聘教授:如何优化乳化PCR

  仅仅不到三十年的时间,聚合酶链式反应PCR席卷了生命科学研究,成为了许多生物实验室必备的实验技术。虽然其基本前提――扩增目的DNA样品――不变,但近年来出现了不少创新,将这一技术发展到了许多应用领域,比如利用定量PCR分析特异性RNA转录的拷贝数,来确定基因表达水平。另外基因组研究的发展也促使研

新的SNP芯片助力水牛、小麦和观赏植物的研究

  在每年的圣地亚哥PAG(Plant and Animal Genome)会议上,新的SNP基因分型芯片都会被推出。今年也不例外。水牛、小麦、观赏植物及其他物种的一系列SNP芯片被介绍给了农业研究人员。  众多的学术会议和海报强调了SNP基因分型芯片的使用,而多家公司的研讨会也以它们为中心,因此A

2019年1月18日Science期刊精华

  本周又有一期新的Science期刊(2019年1月18日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。  1.Science:揭示一种新的抗体疗法可阻止骨髓移植后的巨细胞病毒重新激活  doi:10.1126/science.aat0066; doi:10.1126/science.aav9867