酵母剪接体分析实验(一)

实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。试剂、试剂盒 Tris HCI 溶液EDTATE乙酸钠SDSRNA 的匀浆缓冲液RNA 的溶解缓冲液Tris 碱Tris EDTA 平衡苯酚乙醇硅烷化溶液TPM8 缓冲液mRNAHEPES-KOHR 缓冲液上样缓冲液去离子甲酰胺Northern 印迹杂交液仪器、耗材 液氮 离心机匀浆器旋转真空浓缩仪试管离心管玻璃板聚四氟乙烯垫片梳子黄色胶带电泳槽电源平头毛细管吸头滤纸实验步骤 一、材料与设备1. 从鼠组织中制备竞争性 RNA除非另有说明,所有溶液都用无菌蒸馏水配制。(1) DEPC 处埋水。(2) Tris HCI 溶液:1 mol/L Tris-HCl ( pH 7.4 ),0.1 mol/L Tris-HCl ( pH 7.4......阅读全文

酵母剪接体分析实验

            实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。

酵母剪接体分析实验

前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋

酵母剪接体分析实验(二)

4. 设备(1) 液氮 (N2)。(2) 离心机,匀浆器,旋转真空浓缩仪。(3) 各种试管、离心管。(4) 玻璃板:一块为 26.5 cm 高、20.2 cm 宽、0.4 cm 厚。带凹口的玻璃板尺寸同前一块,但带一 2.2 cm 深、16.3 cm 宽的凹口。(5) 聚四氟乙烯垫片和梳子:垫片和梳

酵母剪接体分析实验(一)

实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。试剂、试剂盒 Tris HCI 溶液EDTATE乙酸钠SDSRNA 的匀浆缓冲液RNA 的溶解缓冲液T

催化活化酵母剪接体的结构揭示了分枝机理

在1977年,Phillip Sharp和Richard Roberts俩个研究组独立发现了剪切这一过程,紧接着,1979年, Steitz研究组发现五种称为U1,U2,U4,U5和U6 snRNA的富含尿苷的小核RNA(snRNA)和7种12-35kDa的蛋白质(snRNPs)。之后,

施一公:克服提纯问题,发布最新酵母剪接体结构

  2018年5月25日,清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》(Science)杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer

Cell丨施一公组完成酵母剪接体结构最后拼图

  真核生物pre-mRNA剪接由超分子复合物剪接体(spliceosome)完成。完整的剪接过程主要分为八种不同的状态,预催化剪接体的前体(pre-B),预催化剪接体(B),活化复合物(Bact),催化活化复合物(B*),催化步骤I复合物 (C),催化步骤II活化复合物(C*),催化后剪接体(P)

施一公团队《细胞》解析酵母ILS状态剪接体

  北京时间9月15日凌晨,Cell在线发表了施一公教授课题组题为“Structure of an Intron Lariat Spliceosome from Saccharomyces cerevisiae”的论文,解析了酿酒酵母平均分辨率为3.5A的内含子套索剪接体ILS complex(In

施一公再发Science-克服提纯问题-发布最新酵母剪接体结构

  2018年5月25日,清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》(Science)杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer

剪接体

剪接体(英文:spliceosome)定义:由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。

清华大学生科院Cell:酿酒酵母“催化后剪接体”的结构

  这篇题为Structure of the Post-catalytic Spliceosome from Saccharomyces cerevisiae的论文首次展示了pre-mRNA中3’剪接位点的识别状态,该结构为回答RNA剪接反应过程中pre-mRNA中的3’剪接位点如何被识别,第二步转

施一公等在《科学》发文报道酵母剪接体三维结构

2016年12月16日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组于(Science)杂志就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《酵母剪接体处于第二步催化激活状态下的结构》(Structure of a Yeast Step II Catal

历时十一年!施一公组完成酵母剪接体结构最后拼图

  3月15日,清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的机理与结构研究,于《细胞》(Cell)期刊发表题为《催化激活状态的酵母剪接体结构揭示RNA剪接分支反应的机理》(Structures of the Catalytically Activated Yeast Spliceosome Revea

前剪接体和剪接体的分离及分析实验

剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理剪接体是由 RNA 和蛋白质

前剪接体和剪接体的分离及分析实验

实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。实验材料 PIP 10 载体核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶

前剪接体和剪接体的分离及分析实验

            实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。

Cell:剪接体与疾病

  剪接体(Spliceosomes)是由RNA和蛋白分子组成,大小为60S的多组分复合物,这种机器能进行Pre-mRNA剪接,即把内含子去除并把外显子序列连接成为成熟的mRNA,这是基因表达与调控的重要环节之一。从作用机制上来看,剪接体作为动态分子机器,需要由亚基从头逐步组装组合,来完成每个剪接事

剪接体的功能定义

剪接体(英文:spliceosome)定义:由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。

清华大学博士后发表Science-报道人源剪接体催化步骤

  自2015年,清华大学施一公教授研究组首次报道了裂殖酵母剪接体3.6 Å的高分辨率结构之后,这一研究组陆续解析了7个不同状态的剪接体高分辨的三维结构,整个剪接通路,将剪接体介导RNA剪接的过程串联了起来。但是与酵母剪接体相比,以人类为代表的高等生物的剪接体组成、组装和调控更为复杂,其结构研究也因

我科学家揭示剪接体组装及激活机制

日前,清华大学生命科学学院施一公研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》期刊发表题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》的论文,报道了酿酒酵母剪接体处于被激活前阶段的两个完全组装的关键构象——预催化剪接体前体和预催化剪接体。  这两个高分辨率三维结构首次展示了在剪接体组装过程中剪接位点和分支点

施一公组首次报道人源剪切体原子分辨率结构

  2017年5月12日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公研究组于《细胞》(Cell)在线发表了题为《人源剪接体的原子分辨率结构》(An Atomic Structure of the Human Spliceosome)。这是第一个高分辨率的人源剪接体结构,也是首次在近原子分辨率的

科学家首次展示RNA剪接分子时钟精确原子模型

   西湖大学生命科学学院施一公教授研究组题为《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接体激活过程中结构重塑的分子机理》的论文,11月27日在《科学》杂志以长文形式发表。此文报道了酿酒酵母处于激活状态的剪接体2.5埃的高分辨率电镜结构,该结构是目前报道的最高分辨率的剪接体结构,首次展

大满贯!2019年施一公团队连续发表Cell,Nature,Science文章

  2015年,通过单粒子冷冻电子显微镜(cryo-EM)分析确定剪接体的第一个近原子分辨率结构,报道了来自S. pombe的ILS复合物。从那时起,已经阐明了13种冷冻-EM结构,大部分分辨率在3.3和5.8之间,已经阐明了来自酿酒酵母的组装剪接体的七种不同状态,人类剪接体的7种不同状态的11种这

施一公连发两篇Cell文章:一步步完成剪接体的拼图

  清华大学施一公教授研究组一直致力于捕捉RNA剪接过程中处于不同动态变化的剪接体结构,从而从分子层面阐释RNA剪接的工作机理。  在11月16日公布的Cell杂志上,这一研究组再次发表研究论文:Structure of the Post-catalytic Spliceosome from Sac

Cell:施一公组首次报道人源剪切体原子分辨率结构

  2017年5月12日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公研究组于《细胞》(Cell)在线发表了题为《人源剪接体的原子分辨率结构》(An Atomic Structure of the Human Spliceosome)。这是第一个高分辨率的人源剪接体结构,也是首次在近原子分辨率的

Cell-Reports:揭秘人类细胞自我保护免于损伤的分子机制

  细胞中含有遗传物质的转录本,这些转录本能从细胞核迁移到细胞的其它部分,这种移动能够保护遗传转录本免于被“剪接体”(spliceosomes)所招募,如果这种保护作用并未发生,整个细胞就会处于危险之中,意味着癌症和神经变性疾病会发生;近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,

又1篇Science!施一公组发表冷冻电镜新成果

  这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cerevisiae Spliceosome Before Activation)的论文报道了酿酒酵母剪接体处于被激活前阶段的两个完全组装的关键构象——

Science:科学家成功解析人类剪接体关键结构

  看看任何一个真核细胞基因组内的蛋白编码基因,不管是动物,植物,真菌还是原生生物,我们都会发现由于内含子的存在,编码基因被隔断成几个片段。当一个基因发生转录,这些内含子会在蛋白质合成之前从mRNA前体中被移除,虽然关于这些内含子的移除过程已经得到了几十年的深入研究,但是在一些三维动态结构研究技术出

上海设施质谱分析系统助力剪接体三维结构重要发现

  8月21日,国家蛋白质科学研究(上海)设施(简称“上海设施”)质谱分析系统用户清华大学施一公课题组在国际顶级期刊《科学》(Science)上在线发表了题为Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution 的研究论文。该文章中解

清华施一公院士Science同期发表两篇新文章

  清华大学的施一公(Yigong Shi)教授是国际著名的结构生物学家,在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科 学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回国