微卫星DNA分子标记及其应用(一)
微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核苷酸重复,如(AC)n、(TG)n等,微卫星DNA广泛分布在真核生物的基因组中,大约每隔10-550kb就存在一个微卫星。微卫星DNA由于具有特异性的PCR扩增、多态信息容量(PIC)高、引物通用性好、突变率高、共显性等特点,已经被广泛应用。 1.微卫星DNA的特点及分类 微卫星DNA具有丰富的多态性,主要表现在核苷酸重复单位数目的多态性和重复序列中核苷酸的替换多态性。一般认为,一个微卫星DNA核心序列重复数目越高,其等位基因数目也就越多,多态性就越丰富。微卫星DNA遵循孟德尔遗传规律,能够稳定地从上一代传给下一代,且等位基因间呈现共......阅读全文
微卫星DNA分子标记及其应用
微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核苷酸
微卫星DNA分子标记及其应用(一)
微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核
微卫星DNA分子标记及其应用(二)
3. 微卫星分子标记技术的应用 微卫星DNA 作为遗传标记具有很大的优越性。近年来随着研究的不断深入,对微卫星标记的研究不仅具有重要的理论意义, 而且还具有较好的应用前景。3.1 微卫星多态性分析在自然界中,生物个体表现出来的各种遗传变异,在本质上就是DNA 的差异,因此通过研究DNA的变异来分
微卫星标记的概念
微卫星标记(microsatellite),又被称为短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个
微卫星标记的分类
Weber 将微卫星分为3 类:单纯(pure) SSR、复合(compound) SSR,和间隔(interrupted) SSR。所谓单纯SSR 是指由单一的重复单元所组成的序列,如(AT) n;复合SSR 则是由2 个或多个重复单元组成的序列,如(GT)n(AT)m;间隔SSR 在重复序列中有
序列标记微卫星的定义
中文名称序列标记微卫星英文名称sequence tagged microsatellite;SIMS定 义染色体上已定位的、核苷酸序列已知的微卫星重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
微卫星标记的实验步骤
1. 客户收集标本(血液或组织等标本)并提取DNA。2. 设计引物序列并扩增,琼脂糖电泳检测结果。3. 合成荧光标记引物。4. 进行PCR扩增,产物通过测序仪器电泳检测, 获得扩增片段大小。5. 分析测序仪器读出的数据,给结果图谱。
微卫星标记法的特点
与其它标记技术相比,具有以下特点:首先,在每个微卫星DNA 两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,尤其在亲缘关系相近的物种间是保守的,而且在一些紧密相关的物种中其重复单位和重复次数具有一定的相似性。其次,这些小的、串联排列的重复序列经常是通过核苷酸链的滑动错配或者其它未知的过程来改变它们的长度,从而导
微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样,即微卫
微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样,即微卫
微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样,即微卫
微卫星DNA分析技术
微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),又称为短小串联重复(Shorttandemrepeats,STR)或简单重复序列(Simplerepeatsequence,SRS或SSR),广泛存在于原核生物和真核生物基因组中,常见的有二、三、四核苷酸重复序列,约占真核生物基因组的5%,其基本构
关于微卫星标记的基本简介
微卫星DNA 是真核生物基因组重复序列中的主要组成部分,主要由串联重复单元组成,每单元长度在1-10bp 之间,1 个SSR 的总长度可达几十到几百个bp。每个微卫星DNA 都由核心序列和侧翼序列组成,其核心序列呈串联重复排列。侧翼DNA 序列位于核心序列的两端,为保守的特异单拷贝序列,能使微卫
微卫星标记的概念和应用
微卫星DNA 是真核生物基因组重复序列中的主要组成部分,主要由串联重复单元组成,每单元长度在1-10bp 之间,1 个SSR 的总长度可达几十到几百个bp。每个微卫星DNA 都由核心序列和侧翼序列组成,其核心序列呈串联重复排列。侧翼DNA 序列位于核心序列的两端,为保守的特异单拷贝序列,能使微卫星特
关于微卫星标记的相关特点介绍
SSR 操作简单,仅需微量组织,即可使DNA 降解,进行有效地分析鉴定。其标记带型简单,记录条带一致,客观明确,PCR 技术的利用,使微卫星标记技术实现操作自动化。 与其它标记技术相比,具有以下特点:首先,在每个微卫星DNA 两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,尤其在亲缘关系相近的物种间是保守
微卫星DNA的基本介绍
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长
细胞化学词汇微卫星DNA
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
概述微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。 ⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样
微卫星DNA的分布情况
微卫星DNA又称短串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)或简单重复序列(simplesequencerepeats,SSR),广泛随机地分布于真核生物基因组中,在DNA序列中平均每6kb就可能出现一个,约占人基因组的10%,其基本构成单位(核心序列)为1-6bp,呈串联重复排列而
关于微卫星标记的基本信息介绍
微卫星标记(microsatellite),又被称为短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数
关于微卫星标记的实验的步骤介绍
1. 客户收集标本(血液或组织等标本)并提取DNA。 2. 设计引物序列并扩增,琼脂糖电泳检测结果。 3. 合成荧光标记引物。 4. 进行PCR扩增,产物通过测序仪器电泳检测, 获得扩增片段大小。 5. 分析测序仪器读出的数据,给结果图谱。
DNA标记
DNA标记(主要内容如下) DNA Labeling by Nick Translation Random Primed Labeling End-Labeling Purification of Labeled DNA Non-isotopic Labeling OthersDNA L
分子标记
内容:一、遗传标记 二、DNA分子标记 三、染色体原位杂交 四、DNA分子标记的应用 长期以来,植物育种中选择都是基于植株的表型性状进行的,当性状的遗传基础较为简单或即使较为复杂但表现加性基因遗传效应时,表型选择是有效的。但水稻的许多重要农艺性状为数量性状,如产量等;或多基因控制的质量性状,如抗性等
DNA分子标记技术研究进展(一)
遗传标记在遗传学的建立和发展过程中有着举足轻重的作用,随着遗传学的进一步发展和分子生物学的异军突起,遗传标记先后相应地经历了形态标记、细胞学标记、生化标记和DNA分子标记四个发展阶段。前三种标记都是以基因表达的结果为基础的,是对基因的间接反映;而DNA分子标记则是DNA水平遗传变异的直接反映,它具有
DNA分子标记技术研究进展(二)
2.第二代分子标记2.1 SSR标记技术 在真核生物基因组中存在许多非编码的重复序列,如重复单位长度在15~65个核苷酸的小卫星DNA(Minisatellite DNA),重复单位长度在2~6个核苷酸的微卫星DNA(Microsatellite DNA)。小卫星和微卫星DNA分布
微卫星DNA的研究和分布情况
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
微卫星DNA的结构和分布特点
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
微卫星DNA多态性的概念和应用
中文名称微卫星DNA多态性英文名称microsatellite DNA polymorphism定 义真核生物不同个体基因组中微卫星DNA短序列串联重复拷贝数和核苷酸序列的差异。通常是设计引物用PCR去扩增微卫星DNA,所得产物再用限制性内切酶消化,电泳分析可以得到含不同长度DNA的图谱。用于遗传
分子标记的概述
分子标记的概念有广义和狭义之分。广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。狭义分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。 分子标记(Molecular Markers),是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的
分子标记的简介
分子标记(Molecular Genetic Markers)是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是 DNA 水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态标记、同工酶标记、细胞标记相比,DNA 分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的农艺性状的选择十分便