多组学数据库“齐聚荟”助力油菜“全能”竞技

油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油菜遗传育种的核心研究内容之一。 华中农业大学信息学院教授杨庆勇团队发布油菜群体变异数据库BnVIR,建立了甘蓝型油菜基因型与基因表达、表型的关联,为快速高效地挖掘油菜候选变异和基因提供了平台。这是继该团队构建首个油菜泛基因组及其数据库BnPIR、油菜转录组数据库BnTIR、植物遗传变异参考面板数据库Plant-ImputeDB后又一重要工作,对油菜种质资源精准鉴定、评价、利用以及分子育种具有重要推动作用。相关论文2月8日在线发表于《分子植物》。 寻找遗传变异从“图”开始 油菜是世界四大油料作物之一,我国年均油菜生产和消费居......阅读全文

多组学数据库“齐聚荟”-助力油菜“全能”竞技

油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油

动物所等建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研

研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(

研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研

科学家合作构建再生生物学多组学数据库

  随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再

我国首个以牧草为主的多组学数据库平台建立

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505990.shtm美洲狼尾草一类的小米(millets)是抗非生物胁迫能力强、营养丰富的禾本科优质牧草及粗粮。它可保证生活在极端气候条件地区人们的粮食安全,并为其它作物提供与耐非生物胁迫有关的遗传资源。

科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库

  水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

CASMS分论坛:多组学整合与大数据

  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

  近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。   农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断

空间多组学质谱技术研讨会(2023)

  空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。  质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  P4 China 2016国际精准医疗大会将于2016年12月16-18日于北京召开,由中国生物工程学会,上海商图信息咨询有限公司(BMAP)等多家单位联合举办。峰会将会邀请近60位演讲嘉宾,预计近800位精准医疗行业与临床科研资深人士与会。  个体化精准诊疗医学是近年卫生保健领域发展最广泛、最

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  自从精准医学概念提出以来,它一直都是全球最热的研究领域,政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言,基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛,从系统生物学出发,对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨,并分享了科研成果应用于

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

布鲁克质谱:拓展多组学研究边界-推动临床转化

  --布鲁克中国区经理何磊先生专访  分析测试百科网讯,自2017年推出timsTOF以来,布鲁克每年都在为科学家们带来创新的产品,今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和单细胞蛋白质组研究平台timsTOF SCP。布鲁克质谱中国区业务快速增长,不仅来源于创新的产品,也同中国团队的努力

科学家开发出新型空间多组学技术

  5月25日,中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组在《自然-方法》(Nature methods)上,发表了题为Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics

  大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。  近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组

如何选择技术方法来进行单细胞多组学研究

现阶段,科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组,甲基化组织或染色质,而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。如何做出选择有了这么多种的检测方法可供选择,研究人员还需

中海油田多组学测序分析检测采办计划公告

  中海油田服务股份有限公司多组学测序分析检测采办计划公告,为便于供应商及时了解项目采办信息,现将(多组学测序分析检测)的采办计划公开如下:  本次公开的采办计划是本项目采办工作的初步安排,实际采购应以相关采购公告和采购文件为准,所有提供和反馈的信息只作为项目采办参考。  本次公告有效期是(2023

空间多组学质谱技术-让微观世界更“清晰”

  2023年4月26-27日,由中国科学院高能物理研究所主办,中国科学院高能物理研究所测试中心、中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室、中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室承办的“空间多组学质谱技术研讨会”及“AFADESI空间代谢组学高级研修班“成功举办。  此次研讨会及研修班邀

空间多组学质谱技术-让微观世界更“清晰”

2023年4月26日,由中国科学院高能物理研究所主办,中国科学院高能物理研究所测试中心、中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室、中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室承办的“空间多组学质谱技术研讨会”成功举办。此次研讨会邀请了国内外相关领域的专家学者和企业代表共同探讨空间多组学质谱技术