代谢组学样本收集答疑解惑

样本收集是代谢组学研究的第一步,是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本?不同种类的生物样本的规范收集流程是什么?有哪些注意事项(抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节)?如何保存生物样本?可保存多久等等?这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题,本文将针对以上常见问题作出系列总结归纳。 一、选择什么生物样本类型开展临床代谢组学实验 代谢组学研究文献中已报道的样本类型种类繁多,如血(血清、血浆、全血)、尿、组织、粪便、细胞、脑脊液、淋巴液、唾液、羊水和胆汁等等[1]。选择何种类型的样本开展实验,取决于课题的研究目的和检测目标。无创或微创方式可采集的样本如血、唾液、尿、粪便等生物样品广泛用于临床诊断的生物标志物发现和验证,这种方式采样便于临床转化和推广。组织和细胞样品常常用于探索和解释疾病的病理机制研究。 在临床上,通过手术相对易于获得癌组织且样品量可以保障,但是,初诊患者一般是通......阅读全文

代谢组学样本收集答疑解惑

  样本收集是代谢组学研究的第一步,是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本?不同种类的生物样本的规范收集流程是什么?有哪些注意事项(抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节)?如何保存生物样本?可保存多久等等?这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题,本文将针对

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

luminex多因子检测样本收集方法

ProcartaPlex™以更少量的样本完成对更多生物标志物的分析。由卓越的免疫试剂供应商开发,用于Luminex®平台,ProcartaPlex使您可以在25-50μL的样本(血浆、血清、细胞培养上清液以及其他体液)。实现在25-50μL的样本中同时对多达50种因子进行检测与定量。该技术在多通道“

血液样本的收集与保存方法

全血根据收集的条件,分成不抗凝和抗凝两种。同时,不抗凝分离出的上层黄色的液体我们称之为血清;抗凝分离出的上层黄色的液体我们称之为血浆。标本的存放温度及时间,血清、血浆及细胞分离的方法步骤也是分析前影响检验结果的重要因素。抽血后,血细胞因代谢需要,要消耗掉部分营养成分,故对这些成分进行测定时,需及时地

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

长寿的代谢特征代谢组学研究的启示

  长生不老是人类自古以来的夙愿。  中国古代神话故事中,有菩提老祖的大品天仙诀,王母娘娘盛会上的蟠桃,太上老祖炼丹炉里的不老丹,还有妖怪们梦寐以求的唐僧肉都可以实现长生不老。在史学瀚海中,《史记》记载秦始皇东巡碣石,携童男童女入海求仙,寻求长生不老药;在现代科学中,衰老仍然是生物医学领域热门主题之

ELISA实验中样本的收集和运输

酶联免疫吸附实验(ELISA)可以用于:(1)检测大分子抗原和特异性抗体等;(2)具有快速、灵敏、简便、载体易于标准化等优点。ELISA的基础是抗原或抗体的固相化及抗原或抗体的酶标记。结合在固相载体表面的抗原或抗体仍保持其免疫学活性,酶标记的抗原或抗体既保留其免疫学活性,又保留酶的活性。ELI

ELISA实验中样本的收集和运输

酶联免疫吸附实验(ELISA)可以用于:(1)检测大分子抗原和特异性抗体等;(2)具有快速、灵敏、简便、载体易于标准化等优点。 ELISA的基础是抗原或抗体的固相化及抗原或抗体的酶标记。结合在固相载体表面的抗原或抗体仍保持其免疫学活性,酶标记的抗原或抗体既保留其免疫学活性,又

尿液及粪便样本收集、留取须知细节

生活中、工作中,总是不乏听到一些叹息声,有的来自患者,有的来自学生,有的更是来自于我们自己。生活本不该如此,除了抱怨和叹息声,我们更有着梦想和远方。    真实场景再现    患者:医生你为啥不让我验大便,不就时间长了一点吗,我之前在人家医院放了一天人家二话没说就给我验了,你们是不是故意刁难我? 

做好代谢组学研究的关键

首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

采集:由于生物样本通常采用组内平行样本,不可避免的会由于时间、环境等因素产生“个体差异”,所以在采集动物血液时需要使用麻醉剂以减少采血过程中动物的疼痛感、不适感、创伤性,以减小应激反应造成的代谢物的变化、尽量缩短采集时间、保持一致的采集部位等细节问题;另外也考虑到样本采集或制备的原则和易实现性,操作

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

  中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。  赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和

ELISA试剂盒常见样本收集处理方法

ELISA检测的目的是为实验提供准确可靠定量分析实验的依据。为了保证实验数据的可靠性,在实验过程中必须坚持全面质量控制和全过程质量控制。在收集标本前都必须有一个完整的计划。以下是恒远生物整理的ELISA*常见的几种样本收集处理方法:1.细胞培养上清细胞培养液在2500rpm/min 离心20分钟后,

临床代谢组学研究常见问题

分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。Q:如何设置验证集和测试集?A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念,通常

质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现

 质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子,按质荷比m/e大小分

临床代谢组学研究常见问题(一)

  分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。   Q:如何设置验证集和测试集?   A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这

临床代谢组学研究常见问题(一)

  分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。   Q:如何设置验证集和测试集?   A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这

兰州污水全收集-让城市“代谢”安全畅通

     一座现代化的城市不仅要修建光鲜亮丽的有形工程,还要科学合理地处理城市的“新陈代谢”问题。2010年,兰州城区污水“全收集、全处理”作为市政府的1号工程全面启动,357公里的管网建设已基本全部完工;而以BOT模式建设的西固、盐场、雁儿湾三座污水处理厂已全部开始试运行。作为我市城市重

Perlegen收集糖尿病患样本寻找药物副作用基因

Perlegen收集3000多DNA样本 寻找药物副作用基因 根据美国商业新闻社(Business  Wire)报导,Perlegen  Sciences今天宣布已经从使用Actos(R)和Avandia(R)进行治疗的糖尿病患者身上收集了3000多个样本。收集样本是为了分析与发生不良反应相关的基

LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究

mGWAS (metabolome  Genome-Wide Association  Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰

抗代谢物与病因学的研究

应用抗代谢物的理论研究病因学已成为一个重要的发展方向,从已有查料证实在这方面的研究是有意义的,例如通过杭组织胺药物可以说明组织胺与过敏反应有一定的因果关系。虽然这个尚题仍有争论,但抗组织胺类药物在临床应用,确可以为过敏反应的病学提出有价值的查料。在临床上常用的抗组织胺类药物种类很多,常用的有苯海拉明

大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展

  近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。   原发性肝癌是全球最

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

  我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息