上海有机所：新颖DielsAlder[4+2]环加成酶PyrI4的催化机制
Diels-Alder（D-A）反应是一类能够直接形成C-C键的重要有机反应，可以高效地实现对杂环、手性螺环和桥环等复杂结构的构筑，被广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D-A反应还被开发为“点击化学”（click chemistry）和“生物正交化学”（bioorthogonal chemistry），并应用于材料科学和生命科学的研究中。 通过对天然产物生源合成途径的分析，诸多天然产物的骨架构筑过程中可能涉及到D-A反应，因此D-A反应也经常被巧妙地应用于天然产物的仿生合成研究中。一方面，随着分子前线轨道理论的发展，合成化学家开发了一系列能够促进D-A反应的小分子催化剂；另一方面，基于著名化学家鲍林的酶催化理论（生物大分子在催化过程中可以通过主-客体相互作用稳定底物小分子的反应过渡态），人工筛选、制备的能够识别底物反应过渡态的抗体酶或核酶也能够在一定程度上催化分子间的D-A反应。 然而，由于缺乏直接的结构生物学和......阅读全文
酶催化机制的定义
中文名称酶催化机制英文名称enzyme catalytic mechanism定 义阐述酶如何与底物相结合，酶催化底物的反应进程，影响酶催化效率的主要因素等一系列问题。主要分为酸碱催化、共价催化、多元催化、金属离子催化、微观可逆原理五种机制。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
小核酶的催化机制
此类核酶催化的都是位点特异性剪切/连接反应，催化机制都涉及到一个被激活的亲核基团对一个磷酸二酯键的进攻，形成五价磷过渡态或半衰期极短的中间物，然后是一个离去的氧。反应的结果是磷酸基团的立体化学发生变化。这类核酶在催化机制上的差别主要是亲核基团和离去基团的不同。四种小核酶都使用内部紧靠剪切点的一个核苷
大核酶的催化机制
大核酶催化的反应有剪切反应、剪接反应和转肽反应。其中最典型的代表是存在于所有细胞中的核糖核酸酶P。与其他核酶不同的是，核糖核酸酶P使用水分子作为亲核基团，并且，核糖核酸酶P既含有RNA，又含有蛋白质。核糖核酸P的催化机制是依赖于2个Mg2+的双金属催化，1个Mg2+激活充当亲核试剂的羟基，使这个羟基
磷酸酶的催化机制
半胱氨酸依赖的磷酸酶通过形成磷酸－半胱氨酸中间体来催化磷酸酯键的断裂，具体过程如下（以磷酸化的酪氨酸去磷酸化过程为例，参见右图）[1]首先，酶活性位点上的自由的半胱氨酸亲核基团进攻磷酸基团中的磷原子并成键；然后，连接磷酸基团与酪氨酸的P-O键接受位置合适的酸性氨基酸（如天冬氨酸）或水分子所提供的质子
简述脂肪酶催化机制
脂肪酶具有油-水界面的亲和力，能在油-水界面上高速率的催化水解不溶于水的脂类物质；脂肪酶作用在体系的亲水-疏水界面层，这也是区别于酯酶的一个特征。 来源不同的脂肪酶，在氨基酸序列上可能存在较大差异，但其三级结构却非常相似。脂肪酶的活性部位残基由丝氨酸、天冬氨酸、组氨酸组成，属于丝氨酸蛋白酶类。
脂肪酶的催化机制
脂肪酶具有油-水界面的亲和力，能在油-水界面上高速率的催化水解不溶于水的脂类物质；脂肪酶作用在体系的亲水-疏水界面层，这也是区别于酯酶的一个特征。来源不同的脂肪酶，在氨基酸序列上可能存在较大差异，但其三级结构却非常相似。脂肪酶的活性部位残基由丝氨酸、天冬氨酸、组氨酸组成，属于丝氨酸蛋白酶类。脂肪酶的
金属氧化物的催化机制
金属氧化物在催化领域中的地位很重要，它作为主催化剂、助催化剂和载体被广泛使用。就主催化剂而言，金属氧化物催化剂可分为过渡金属氧化物催化剂和主族金属氧化物催化剂，后者主要为固体酸碱催化剂（见酸碱催化作用）。碱金属氧化物、碱土金属氧化物以及氧化铝、氧化硅等主族元素氧化物，具有不同程度的酸碱性，对离子型（
脂肪酶的催化机制介绍
脂肪酶具有油-水界面的亲和力，能在油-水界面上高速率的催化水解不溶于水的脂类物质；脂肪酶作用在体系的亲水-疏水界面层，这也是区别于酯酶的一个特征。来源不同的脂肪酶，在氨基酸序列上可能存在较大差异，但其三级结构却非常相似。脂肪酶的活性部位残基由丝氨酸、天冬氨酸、组氨酸组成，属于丝氨酸蛋白酶类。脂肪酶的
木瓜蛋白酶的催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。
木瓜蛋白酶的催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。