科学家捕获合成DNA原子视图，研究治疗疾病的“分子剪刀”
美国西弗吉尼亚大学研究人员实现了在原子水平上观察合成DNA，从而了解了如何改变其结构以增强其剪刀功能。更多地了解这些合成DNA反应，或是未来解锁医学新技术的关键。研究结果发表在最近出版的《自然》子刊《通信·化学》上。 原子细节可以为人们提供一个路线图，去构建和改进可广泛适用于医疗界的最新技术，理论上，其可应用于视网膜变性或癌症等疾病的治疗。 此次研究中使用的合成DNA，亦称为DNA酶。与人类DNA不同，DNA酶在实验室中创建，生产成本低廉且能够催化化学反应。研究人员表示，人们通常认为DNA作为人类遗传信息的存储单元是惰性的，然而，在实验室中进化出的某些类型的DNA违背了传统规则。这些DNA可折叠成复杂的形状，能够执行一系列效果显著的“行动”。 研究团队与美国能源部阿贡国家实验室展开合作，通过结晶合成DNA，然后用超强X射线将其摧毁以揭示其结构。实验中，研究人员看到了一个“小臂”的结构，其可伸出“手”找到互补序列的另一部......阅读全文
Cell重要成果：RNA剪切视图
来自耶鲁大学的科学家以最详细的细节描述了RNA执行基因表达化学过程的特征。在发表于10月26日《细胞》(Cell)杂志上的论文中，研究人员报告了 II型内含子(group II introns)的14个晶体结构。II型内含子是一种具有酶催化功能的内含子，参与RNA剪切这一遗传复制的关键阶
细胞活动3D视图阐明周围环境
正如不知道上下文的情况下很难理解对话一样，生物学家在不了解细胞环境的情况下也很难理解基因表达的意义。为解决这个问题，美国普林斯顿大学工程学院研究人员开发了一种新方法，整合了来自同一组织样本的多个切片的基因表达信息，提供了健康和疾病中的细胞活动的三维（3D）视图，包括常见的皮肤癌和鳞状细胞癌。
Haver CPA（光学视图颗粒分析系统）升级产品重装登场
在传统的颗粒分析领域，Haver&Boecker作为筛分机的制造商，一直引领着行业的发展。90年代早期，Haver&Boecker率先在这一领域进行创新革命，通过引入强大的计算机技术，揭开了颗粒分析领域发展的全新历史篇章。发展到现在，Haver CPA已经成为目前科技
仿生眼科技再创辉煌：装备智能软件 支持高清彩色视图
重见光明(Second Sight)公司是让仿生眼获得美国食品及药品监督局认证的第一人，目前公司正试图为“百眼巨人”二代仿生眼上载软件，为使用者提供更分辨率更高的视图。上载的软件甚至还为使用者提供了颜色识别功能(设备的原始视图仅提供黑白两色视图)。 “百眼巨人”第二代仿生眼本身算是一个
对 LAS 数据集 3D 视图使用激光雷达
使用 3D 透视图查看 LAS 数据集是可视化和了解 LAS 数据集引用的激光雷达数据的一种更好的方式。LAS 数据集 3D 视图 窗口允许您将 LAS 数据集视为 ArcMap 中 3D 环境的点或表面。只能通过 ArcMap 中的 LAS 数据集 工具条使用 3D 视图。通过 3D 透视图，可以
新技术使任意角度看平板电视图像都清晰
在观看平板电视或有些手表上的显示屏时，人们常会遇到一个观看视角的问题：只有从显示装置正面看才能更清晰地看到图像，而从其他角度看到的图像效果都不太理想。英国伦敦国王学院研究人员26日说，可以用一层纳米尺度的金膜来解决这个问题。 通常，在平板电视等显示装置的内部，发光物质发出的光向外传播
用原子力显微镜表征DNA纯化效果的实验
实验概要运用原子力显微镜(AFM)表征3种DNA纯化试剂盒对DNA的纯化效果。方法：PCR扩增K562/A02细胞mdr1基因DNA，分别以3种不同的DNA纯化试剂盒对PCR产物进行纯化后，按终浓度为10 ng・μl-1固定在用1 ng・μl-1 L型多聚赖氨酸预先处理过的新剥离的云母片上，用AFM
美科学家绘制人脑3D透视图涵盖所有基因组
网易探索9月24日报道 科学家们已经制作出了显示整个大脑部位基因活动的完整的成人大脑地图集。 这一地图集是通过对两个临床上不显著的大脑和来自于第三个人的半个大脑的900个具体部位的基因分析制作而成的。这两个大脑分别属于一位24岁和39岁的人。 西雅图的艾伦脑科研究所的研究人员称该图集
绘制D715-2441与PB2cap的结合模式图（二）
设置关键残基对象：关键残基包括：A链的K339、H357、E361、K376和F404。由于该蛋白只有一条链，在使用命令选择残基时，可以不用指定链名。按照下图顺序，将关键残基设置为res对象。2.3. 显示所需，隐藏多余在PyMOL中输入以下命令：然后，进行鼠标操作：2.4. 绘制相互作用力前面说过
示波器有三种视图模式，但90%的工程师都只用过一种
示波器可通过各种各样的视图模式来观察波形，有YT模式、滚动模式、XY模式，YT模式又可以进一步细分为普通、单/双ZOOM显示模式、插值模式，观察信号时，应选择哪一种模式才最合适，不同的模式之间又有什么关联？本文以ZDS3000/4000 Plus系列示波器为例，带您详细深入探讨，各个模式
原子力显微镜研究λ-DNA-组蛋白的相互作用
对DNA与组蛋白的相互作用的认识是我们进一步了解其功能和探讨生命现象的重要基础。原子力显微镜(AFM)成像分辨率高、成像直观,且样品制备简单,不需要经过脱水、抽真空、染色、包埋等 这些会使生物分子结构发生一定改变的复杂处理过程,并可对生物分子在近生理条件下检测它们的动态结构信息。
新加坡国立大学：可变带隙的纳米多孔石墨烯的表面合成
调制纳米多孔石墨烯的带隙对于很多领域是被需求的，比如作为有机杂化器件中的电荷传输层。该领域的关键是能够合成具有可变孔径和可调带隙的2D纳米多孔石墨烯。这里，表面合成了具有可变带隙的纳米多孔石墨烯。两种类型的纳米多孔石墨烯通过分级C-C耦合合成，并通过低温扫描隧道显微镜和非接触式原子力显微镜进行验
物理所硅烯的氢化研究取得新进展
最近几年，在硅基研究领域兴起了一种类石墨烯的新型二维材料——硅烯（silicene）。硅烯也是狄拉克费米子体系，其低能准粒子具有线性能带结构，而且它还是一种二维拓扑绝缘体。在硅烯中， 由于Si-Si原子之间较大的成键间距削弱了π电子交叠，它以sp2-sp3混合杂化的方式形成具有弱翘曲（low-b
浙大科学家研究分子马达 解释病毒为何能稳定复制
一个组装中的病毒的示意图。绿色为外壳，淡黄色为DNA链，红色即分子马达。 也许你还对2016年诺贝尔化学奖的主角“分子机器”记忆犹新：3位科学家以人工方法创造了世界“最小机器”，而仿照的对象正是大自然中千姿百态的分子机器。在我们体内，就存在许多生物分子机器，它们把化学能转变为机械能，从而为
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA序列测定-3
2．利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下，末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端，如果作为底物的核苷酸经过修饰（如ddNTP），则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段，亦存在DNA的两侧均被标记问题，可通过上述同
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA序列测定-2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法（双脱氧链终止法）和Maxam（1977）提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组核苷酸都有共同的起点，却随机终止于一种（或多种）特定的残基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA序列测定-1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶： 1．大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题：①Klenow片段的持续合成能力较
DNA重组技术(DNA Recombination)
一、DNA 的酶切与连接（1）酶切反应：同质粒DNA 的鉴定，只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切，则成比例增加。（2）加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀，-20℃2h以上。（3）15000rpm离心15min，弃上清。（4）加入75%乙醇洗涤2次，离心弃
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA重组与鉴定-3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时，破坏此酶的N端阅读框架，产生无α互补功能的N端片段，因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色，见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短，不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框，有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA重组的载体-3
在作为载体时，这些噬菌体有一个很大的优点，即克隆到M13mp载体的外源DNA片段（双链），在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆，可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板：①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板；②制备仅有一条
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA重组与鉴定-2
（1）CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子（如Ca2+、Mg2+等）低渗溶液中时，细菌细胞膨胀成球形，处于感受态；此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面，重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面，在丰富培养基中生长数小时后，球状细胞恢复原
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA重组与鉴定-1
重组DNA是在体外用限制性内切酶，将不同来源的DNA分子进行特异地切割，获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接，从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞，在宿主细胞中进行无性增殖，获得大量的目的基因或DNA片段，此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA重组的载体-2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体，大多数具有编码多种蛋白质的基因，能利用宿主细胞的蛋白质合成体系，进行生长和增殖。构建的噬菌体载体，以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA，全部序列已知，共编码50多个基因。其中约一半基因参与
DNA重组（DNA recombination）技术：DNA重组的载体-1
载体（vector）是携带靶DNA（目的DNA）片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型，亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下
新型纳米力学成像探针实现原子力显微镜下DNA的直读检...
新型纳米力学成像探针实现原子力显微镜下DNA的直读检测和高分辨成像 近日，中国科学院上海应用物理研究所物理生物学研究室与上海交通大学、南京邮电大学合作，基于DNA纳米技术发展了一系列DNA折纸结构并作为纳米力学成像探针，实现了原子力显微镜下对基因组DNA的直读检测和高分辨成像。相关结果发表于《
DNA合成（DNA synthesis ）技术介绍
蛋白质概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照预定核苷酸的顺序，将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸，可自动化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
DNA 指纹的概念高变区DNA与DNA指纹
人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后，用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ，然后将样品进行
DNA Fingerprinting, DNA Barcoding, and Next Generation Sequencing ...
DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has becom
DNA Immunoprecipitation for the Determination of DNA-Binding Specificity
Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1 Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA 1Correspond
“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”
“垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的，用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，而在学术上被称为非编码DNA序列。 由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键，而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”这一观念便形