PCR扩增CDNA库中的特异序列策略

最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特异DNA扩增几百万倍, 并已成为分子克隆和诊断的十分有用的工具。最近,TAQDNA聚合酶的使用极大地简化 了PCR方法。该酶在75℃左右有很宽的最适温度区,在小于95℃以下重复保温仍能存 活,更重要的是,该酶活性高,无外切酶活性,因此理论上不用通过建立和筛选基因 库的所用步骤就能从序列编码的基因作模板以探索一种简单.快速的基因分离方法。 下面我们将描述在鉴定南美蝙蝠唾液腺外分泌蛋白中使用的方法和过程。 Dr.S.Gardell(MSDRL,WestPoint,PA)纯化了从南美蝙蝠唾液腺中分离的一种外 分泌蛋白,因此......阅读全文

PCR扩增CDNA库中的特异序列策略

    最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特异D

用PCR扩增cDNA库中的特异序列

最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特

PCR技术(十七):用PCR扩增cDNA库中的特异序列

最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特异DNA扩增

关于PCR特异扩增ITS序列的简介

  这是目前鉴定物种和做分子分类研究的最主流的方法.原理是:ITS序列是中度重复序列,广泛分布于基因组并且是同步进化的,而且不同物种间进化差异很大,它的碱基序列同源性的程度决定生物之间的亲源关系远近,并可以以此来作为分类依据划分物种.另外对于未知物种,可以通过与GENEBANK提供的序列比对来确定该

cDNA文库组标准流程八:pBlueScript-cDNA库扩增

1.试剂及配方:2 x LB (1升):        20g    氯化钠        20g    蛋白提取物        10g    酵母提取物      加入蒸馏水至1升,用NaOH调pH值至7.0,高压灭菌2 x LB-甘油(12.5%)(200ml)175ml  2 x LB液体2

RTPCR扩增目的基因cDNA

实验概要学习从细胞或组织的RNA中用逆转录PCR扩增目的基因的技术及操作。实验原理普通PCR方法可以以DNA为模板扩增基因,但真核生物的基因组中通常分为可转为mRNA的外显子和不转录的成mRNA的内含子,所以从染色体DNA用PCR方法扩增出的基因是内含子和外显子相间排列的DNA分子,不能用于基因工程

如何提高PCR的扩增特异性?

      疫情当下,最热频的词汇莫过于核酸检测了。而核酸检测最核心的技术也越来越被大众所熟知,就是我们高中就学过的聚合酶链式反应,又称为PCR。        自从1983年,Kary Mullis才发明出这个用于扩增目标DNA的研究工具—PCR技术后,其逐渐成为分子生物学研究必不可少的一部分

基因克隆(gene-clone)的几种常用方法介绍1

基因(gene)是遗传物质的最基本单位,也是所有生命活动的基础。不论要揭示某个基因的功能,还是要改变某个基因的功能,都必须首先将所要研究的基因克隆出来。特定基因的克隆是整个基因工程或分子生物学的起点。本文就基因克隆的几种常用方法介绍如下。1 根据已知序列克隆基因对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最

常用的分子生物学基本技术(二)

载体 所谓载体是指携带靶DNA片段进入宿主细胞进行扩增和表达的工具。细菌质粒 是一种细菌染色体外小型双链环状结构的DNA,分子大小为1-20kb,对细菌的某些代谢活动和抗药性表型具有一定的作用。质粒载体是在天然质粒的基础上人工改造拼接而成。最常用的质粒是pBR322。噬菌体(phaeg) 噬菌体是感

应用mRNA反转录扩增cDNA(RTPCR)

RT-PCR技术可应用于:(1)构建大容量cDNA文库;(2)鉴 定已转录序列是否发生突变及呈现多态性;(3)测定基因表达的强度。实验方法原理酶促催化使RNA反 转 录 为cDNA第一链。 一 条寡聚脱氧核苷酸引物先 与 mRNA杂交,然 后 由RNA依赖的DNA聚合酶催化合成相应互补的cDNA拷贝

应用mRNA反转录扩增cDNA(RTPCR)

实验方法原理 反转录 PCR ( reversetranscriptase'PCR,RT-PCR ) 是一种从 RNA 扩增 cDNA 拷贝的方法。RT-PCR 对于获得与克隆 mRNA 的5'、3' 末端序列和从非常少量的 mRNA 样品构建大容量的 cDNA 文库

应用mRNA反转录扩增cDNA(RTPCR)

            实验方法原理 酶促催化使RNA反 转 录 为cDNA第一链。 一 条寡聚脱氧核苷酸引物先 与 mRNA杂交,然 后 由RNA依赖的DNA聚合酶催化合成相应互补的cDNA拷贝,后者能进一步 用 于PCR扩增。依据实验的不同目的,针对单链cD

RACE的原理、应用和优缺点(二)

三、RACE 的应用 RACE技术主要是应用于对全长cDNA序列的获得,但对该技术进行一定的修改后,也可在其它方面显示出极高的应用价值。 首先,RACE技术可用于cDNA文库的构建及筛选。Belyavaasky等(1989)用10个骨髓瘤细胞分离的总RNA,通过TdT加同聚尾、(dT)

常用的分子生物学基本技术1

DNA重组技术(或基因工程)是20世纪生物学的伟大成就,并已渗透到生命科学包括医学 各个领域,为肿瘤的实验研究和临床诊断及治疗提供了崭新的技术和有用的工具。本附录扼要介绍在分子肿瘤学领域中常用的分子生物学基本技术及其在肿瘤研究中的应用,着重介绍它们的原理和应用。至于具体的技术方法和操作步骤可参阅《分

PCR进阶——GCRich片段的扩增策略

  PCR早已是分子生物学实验的常规技术,但是GC-rich扩增始终是有难度的应用。  以人基因组为例,大约3%的序列可划为GC-rich序列,尤其是在启动子,增强子等控制元件,GC-rich序列更为常见。因此,GC-rich片段的PCR扩增困难,也就阻碍了有关这类序列的科研进展。  GC-Rich

RACE技术扩增构建全长cDNA文库

实验概要利用RACE(利用PCR技术快速扩增全长mRNA)技术构建全长cDNA文库是传统C库构建技术的改进。本实验即是利用寡核苷酸帽法,进行全长C库的构建,从而掌握RACE技术的原理与基本操作方法。实验原理其原理是利用真核mRNA的3’poly(A)和5’帽子结构作为标签,用通用引物识别并配对标签序

几种基因克隆的常用方法介绍(一)

基因(gene)是遗传物质的最基本单位,也是所有生命活动的基础。不论要揭示某个基因的功能,还是要改变某个基因的功能,都必须首先将所要研究的基因克隆出来。特定基因的克隆是整个基因工程或分子生物学的起点。本文就基因克隆的几种常用方法介绍如下。1 根据已知序列克隆基因对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最

逆转录PCR(RTPCR)扩增基因特异片段

逆转录PCR(RT-PCR)扩增基因特异片段 一、实验原理RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中R

DNA和RNA靶序列的原位PCR扩增实验

实验材料 样品试剂、试剂盒 双氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl仪器、耗材 加湿盒热循环仪实验步骤 1.  将载有固定样品的载玻片置105℃加热块上5~120 s。 2.  载玻片放入含0.3%H2O2中,于37℃或室温温育过夜,以灭活内源性过氧化物酶活性,然后以

DNA和RNA靶序列的原位PCR扩增实验

原位PCR是Hasse等于1990年建立的技术,就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。实验材料样品试剂、试剂盒双氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl仪

基因克隆的常用方法

基因克隆的常用方法 基因(gene)是遗传物质的最基本单位,也是所有生命活动的基础。不论要揭示某个基因的功能,还是要改变某个基因的功能,都必须首先将所要研究的基因克隆出来。特定基因的克隆是整个基因工程或分子生物学的起点。本文就基因克隆的几种常用方法介绍如下。

如何对-cDNA、gDNA进行选择性引物设计?

设计策略PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合部退火,该点为

如何对-cDNA、gDNA进行选择性引物设计?

设计策略 PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆 反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合

RACE的原理、应用和优缺点(一)

一、RACE 的简介  目前,全长基因的获得是生物工程及分子生物学研究的一个重点。尽管已经有多种方法可以获得基因的全长序列,但在很多生物研究中,由于所研究的目的基因丰度较低,从而使得由低丰度mRNA通过转录获得全长cDNA很困难。近年来发展成熟的cDNA末端快速扩增(RACE)技术为从低丰度转录快速

仅扩增全长cDNA末端的高级RACE方法

为了获得全长的cDNA 5’及3’末端序列,许多研究人员使用了称之为cDNA末端快速扩增,或RACE的方法。传统的RACE方法得到的PCR产物含有全长及断裂的cDNA产物。GeneRacer™试剂盒确保您只得到含有全长cDNA末端的完整序列,是您得到更高效的结果并节省您的时间GeneRacer™

基因表达轮廓(gene-expressed-profile)技术1

基因表达谱或基因表达轮廓(gene expressed profile)技术就是利用mRNA提取、cDNA合成、酶切、连接、PCR及分子杂交等分子生物学基础操作技术,将某一生物材料在某一特定阶段表达的基因全部展示出来,通过测序及与数据库比较或通过目标和对照样品中所表达基因的比较,可以找出特异表达

全长cDNA文库的构建—SMART技术

        真核细胞的mRNA在加工过程中有一个比喻为“穿鞋戴帽”的过程,因此mRNA的3'末端都带有一段Poly A,这是利用逆转录酶制备cDNA文库的基础。但是由于cDNA的5'端的序列各不相同,如何获得全长的cDNA,如何扩增由微量的mRNA逆转录得到的cDNA文库、如何利

SMART技术简介

真核细胞的mRNA在加工过程中有一个比喻为“穿鞋戴帽”的过程,因此mRNA的3’末端都带有一段Poly A,这是利用逆转录酶制备cDNA文库的基础。但是由于cDNA的5’端的序列各不相同,如何获得全长的cDNA,如何扩增由微量的mRNA逆转录得到的cDNA文库、如何利用已知片断序列得到全长的cDNA

SMART技术

  真核细胞的mRNA在加工过程中有一个比喻为“穿鞋戴帽”的过程,因此mRNA的3’末端都带有一段Poly A,这是利用逆转录酶制备cDNA文库的基础。但是由于cDNA的5’端的序列各不相同,如何获得全长的cDNA,如何扩增由微量的mRNA逆转录得到的cDNA文库、如何利用已知片断序列得到全长的cD

RTPCR在基因表达(gene-expression)检测中的应用

基因表达的检测有几种方法。经典的方法(仍然重要)是根据在细胞或生物体中 所观察到的生物化学或表型的变化来决定某一特定基因是否表达。随着大分子分离技 术的进步使得特异的基因产物或蛋白分子的识别和分离成为可能。随着重组DNA技术 的运用,现在有可能检测.分析任何基因的转录产物。目前有好几种方