WIKI资讯

希望组自主三代组装软件NextDenovo最新版本全球学术开源

希望组面向全球释放三代测序数据高效纠错、组装软件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1 （https://github.com/Nextomics/NextDenovo），并免费开放用于学术和其他非商业用途。据悉，本次希望组发布的最新版本NextDenovo是专为三代测序数据开发的纠错、组装软件，不但解决了现有三代测序数据组装工具资源占用大、运行时间长、组装质量不稳定的瓶颈问题，还实现了单Contig一条染色体和超大型基因组组装的突破，为利用三代数据组装基因组扫清了组装算法的障碍。 三代测序数据组装已经成为基因组De novo的主流方案，其中Nanopore的读长可达数百kb甚至超过2Mb，在解决染色体着丝粒/端粒区域、性染色体等基因组复杂区域以及复杂基因组组装问题方面，具有更大的优势[1]。前不久，加州大学圣克鲁斯基因研究所等单位的研究人员利用Nanopore的ultra-long reads成功拼接出了首个......阅读全文