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人们盼星星、盼月亮，总算等到了纳米孔测序仪开放试用。如今，1000多个实验室测试了MinION测序仪，并发表了结果。他们在这一期的《Nature Methods》上介绍了他们的使用体会。而更多的产品也在开发之中。 纳米孔（nanopore）技术让核酸分子穿过直径只有几纳米的孔而确定其序列。这个孔可能是蛋白质，如嵌在聚合物膜中的α-溶血素，也可能是固体材料中形成的孔，如氮化硅。在膜上施加电压，形成离子电流和电泳力，拉动DNA穿过这个孔。这时，它会带来序列特异的电流波动。这种方法也能用来分析RNA和蛋白质。 纳米孔测序仪可处理长度在10,000,-50,000 bp的DNA片段，未来甚至达到100,000 bp。这些长读取让研究人员能更快地组装成完整或近乎完整的序列。不过，纳米孔测序仪目前仍存在大量的挑战，包括需要更高的准确性，需要更高的通量，也需要更多的数据分析软件。 考虑到它的体积小巧，这种测序仪很适合检测环境中的病原......阅读全文
时间总是过得很快，2016年马上就要过去了，迎接我们的将是崭新的2017年，2016年，我国有很多优秀科研机构的科学家们都做出了意义重大、影响深远的研究成果，发表在国际顶级期刊上。本文中小编盘点了2016年我国科学家发表的一些重磅级研究，以饕读者。 --结构生物学 -- 1.清华大学 施一
纳米孔测序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次报道了Oxford Nanopore公司研制的纳米孔测序仪样机——MinION，用于破译病毒DNA。然而MinION的发展历程并不那么顺利，英国牛津大学基因组学中心基因组学家Rory Bowden说，“众所周知，在每次读取
埃博拉病毒（EBOV）感染人类会引起致命的出血热，发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了严重的疫情，死亡人数已经超过11,000人。今年一月份，就在人们以为这场疫情正式结束之际，塞拉利昂又出现了新的病例。 本期Nature杂志发表的一项新研究展示了便携式基因组测序仪在这次疫情中起到
第二代测序是当今应用最为广泛的技术，但读长短是它的软肋，并且它无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题。第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点，近年来渐渐被应用于各大研究中。以前谈到第三代测序，也许你想到的是病毒基因组或细菌基因组测序，而如今随着技
每个月都有一大波新的CRISPR工具来袭。比如，Cas9抑制剂的出现可在各种场景下防止脱靶效应。人们也将CRISPR-Cas9系统与前沿的单细胞测序技术相结合，开发出新的策略。与此同时，研究人员开发出Cas9以外的效应物核酸酶，比如C2c2，靶向RNA以实现编辑和成像应用。 对于这些热门的技术
每年12月，《科学》杂志都会公布年度突破及入围成果。以下为今年的10大突破和赢家，排名不分先后。 1.时空涟漪撼动科学界 今年发现时空涟漪（即引力波）撼动了科学界。它完成了阿尔伯特·爱因斯坦在100年前完成的一项预测，为40年来寻找这种无穷小的涟漪画上了句号。但这个故事并未结束，科学家将此次
假设你是Doctors Without Borders组织中在西非工作的一名医生，一个发热、头疼、疲劳的小孩被带进你的诊所。根据当地的环境和季节，最可能被诊断出的就是疟疾或埃博拉。然而，这两种疾病都不能给病人一个积极的预后。埃博拉病毒能够快速传播给其他人，需要将患者尽快隔离。 这种情况下，确诊
2014-2016年，西非暴发埃博拉疫情流行期间，进行了大量ELISA和基于RT-PCR的检测，这些方法的检测虽然简易、便携、快速，但由于病原体不断进化，这些方法很快变得过时，并且还缺乏能在症状出现前检测出病毒的方法。 使用传统的测序技术虽然可以克服病原体不断进化的问题，但这一技术只有在将样品
截至2019年12月23日，中国学者在Cell，Nature及Science在线发表了107篇文章（2019年的Cell ，Nature 及Science 已经全部更新），iNature团队对于这些文章做了系统的总结： 按杂志来划分：Cell 发表了31篇，Nature 发表了44篇，Scie
基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一，受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称，Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的，是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
2016年2月14日/生物谷BIOON/--近期塞卡病毒在赤道附近国家开始大肆传播，引起了非常多的新生儿出现“小头症”。虽然这个病毒对于成人来说症状非常轻微，然而对于非常脆弱的孕妇和新生儿而言，简直像噩梦一样的存在。近两年来，仅仅巴西一国，就出现了超过两千例由塞卡病毒引起的小头症。这些年来，病毒
Scott Tighe（左）等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。 “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗？Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机
Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机上收集的化验样本获取DNA，他和同事能在1个小时内现场进行谱系分析，甚至详细描述出捐赠者一天的生活细节。“我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示
科技日报北京9月30日电(记者刘岁晗)美国研究人员近日完成的一项原则证明性研究称，基于DNA排序的实时血液检测，可迅速对埃博拉出血热、基孔肯雅热等危重传染病进行诊断。研究人员表示这项检测未来有望用于实验场地和医疗设施缺乏的地区。大多数商用或科研用基因诊断是以特定的病原体为目标。但美国加州大学旧金山分
应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用，研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说，2012年，Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂（aromatase inhibitor）治疗法之间的关联。他们指出突变，后果与诊断之间的关联，同样还有
George M. Church是哈佛医学院的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员。他被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年，Church和Walter Gilbert发表了首个直接基因组测序方法，该文章中的一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外，如今的多重化分子技术和条码式标签也
George M. Church是哈佛医学院的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员。他被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年，Church和Walter Gilbert发表了首个直接基因组测序方法，该文章中的一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外，如今的多重化分子技术和条码式标签也
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
来自英国Oxford Nanopore公司的MinION是第一台商业化的纳米孔测序仪。它在带来无限希望的同时，也承受着高错误率的质疑。英国伯明翰大学的Nicholas J. Loman和爱丁堡大学的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文，称新开发的工具让纳米孔测
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍
这是一个与 mRNA 结合的细菌核糖体的分子模式图，该核酸蛋白复合体正在合成蛋白质。 随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘，帮助我们了解表观转录组学（epitranscriptomics）的工具也变得越来越多了。 2004 年，以色列特拉维夫大学（Tel Aviv University
单细胞测序被评为2013年年度技术 2014 年首刊，《Nature Methods》杂志将2013年度技术(Method of the Year 2013)授予了单细胞测序(single-cell sequencing)。同时，杂志还介绍了2014年值得关注的技术，包括
最近，英国诺丁汉大学的科学家们首次证明，我们有可能实时地、有选择性地测定DNA序列片段，从而大大减少了分析生物样品所需的时间。 在Nature子刊《Nature Methods》上发表的一篇论文，描述了一种新的技术，可高度选择性的进行DNA测序，这种技术被称为“'Read Until”。这种方
辉煌过没落了，飘荡着忧伤；虽有希望，但罗氏面前，迷雾重重。 辉煌与没落 2013年10月，罗氏悄悄地启动454 Life Sciences关闭进程：130名雇员的解聘将在2014-2016年内逐步进行，2015年454测序仪生产计划完成后 ... 辉煌过没落了，飘荡着忧伤；虽有希望，但罗氏面前，
面向国家重大战略需求 打造国内一流、国际知名的检验检测检疫科研机构——中国检验检疫科学研究院科技创新发展纪实 科研人员在讨论实验结果 工作人员使用病毒气溶胶采集富集仪进行检测 科研人员在进行实验分析 中国检科院成功举办“全国检验检测检疫学术论坛” 经济全球化进程的日益加快与综合国力竞争
第三代测序技术，即单分子测序技术，又称纳米孔测序，以美国太平洋生物（Pacific Biosciences）的 SMRT 技术为代表。DNA 测序时，不需要经过 PCR 扩增，实现对每一条 DNA 分子的单独测序。 SMRT 测序面临的一个挑战是将更长的 DNA 分子放入 100 纳米大小的零
4月12日，这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心（CDC）的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器（生命科学领域专有的预印本文献库）的预印本（a preprint posted）中介绍了这项工作，他说：“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质，这确实开始开辟了很