ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)

案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materials 影响因子:39本篇文章由美国加州大学圣地亚哥分校教授张康与广州中山大学附属肿瘤医院院长徐瑞华团队一同合作完成,通过对比肝癌患者血浆、组织及健康人白细胞中ctDNA甲基化分布情况,发现肝癌患者体内血浆和组织一致性很高。通过1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情况及病理信息为资源库,建立了疾病预测分析模型,结果显示该模型基因的特异性、敏感性与肿瘤状态、诊断反应和时期显著相关(P<0.001)。与此同时,作者还构建了诊断结果预测模型,该模型的基因可用于预测疾病诊断和生存时期的分子标志物(P<0.001)。......阅读全文

ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)

案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materia

​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(一)

新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。最新

云序高分文章利器:​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享

  新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序   cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主

云序高分文章利器:​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享

  新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序   cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主

lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析

技术优势:●   专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程●   可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接●   可视化数据展示,提供paper级结果图表●   优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍:      人类基因组中仅有约2%的DNA序列最

lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析综述

  技术优势:   ● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程   ● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接   ● 可视化数据展示,提供paper级结果图表   ● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果   介绍:    人类基因组中仅有

最具潜力的液体活检技术,ctDNA-甲基化测序助力肿瘤筛查

癌症对每个人和家庭来说都是一场灾难,对国家来说是一笔极大的公共卫生项目支出,根据2019年国家癌症中心发布的中国恶性肿瘤流行情况分析报告显示,随着恶性肿瘤发病数持续上升,我国每年所需的相关医疗花费超过2200亿元。面对这一现状,唯有进行肿瘤早筛,在肿瘤发生发展的源头,将其扼杀,才能逆转这个局面。肿瘤

ctdna测序数据测序深度多少可用

ctdna测序数据测序深度多少可用2-氨基嘌呤等其他碱基结构类似物同样具有诱变作用。②药物或射线引起的化学变化 亚硝酸能够作用于腺嘌呤(A)的氨基而使它变为次黄嘌呤(HX);可以作用于胞嘧啶(c)而使它变为尿嘧啶(U)。这两种氨基到酮基的变化带来碱基配对关系的改变,从而通过 DNA复制而造成A∶T→

从LDT到IVD-第五届中国先进分子诊断技术与应用论坛开幕

  分析测试百科网讯 2019年5月9日,由商图信息BMAP主办,武汉东湖国家自主创新示范区生物医药行业协会、中国医疗器械行业协会IVD分会支持的第五届中国先进分子诊断技术与应用论坛在上海富豪环球东亚酒店举办。分析测试百科网作为合作媒体全程参与报道本次活动。  随着NMPA陆续批准用于肿瘤诊断的NG

小麦面包粉中呕吐毒素超标真实案例分享(二)

六、上海飞测小麦中呕吐毒素荧光定量快速检测系统上海飞测生物基于全球领先的荧光定量FPOCT技术平台,开发了呕吐毒素荧光定量快速检测系统,该系统结合了胶体金快速、酶联免疫定量以及色谱法准确的特点,可在8min内快速准确定量的测定出大麦、小麦、面粉中的呕吐毒素的含量,样品前处理简单(仅需7min),操作

ctDNA与癌症早筛,这项新突破是否会带来颠覆?

  ctDNA已被证明与肿瘤实时变化密切相关,已被用于评估耐药性、监测治疗反应等。近年来,利用ctDNA液体活检来早期诊断癌症的研究热度不断攀升,成果也越来越显著。今天我们要分享的是近期刊登在《 Nature Genetics》杂志上的癌症早期筛查新突破。  ctDNA液体活检与甲基化检测全新组合 

ctDNA甲基化检测在肿瘤诊疗中的价值

循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)来源于肿瘤细胞的凋亡、坏死或分泌产生的DNA片段,是循环游离DNA(circulatingcell-free DNA,cfDNA)的一部分。健康人群中大部分cfDNA的长度在70~200 bp,但肿瘤患者的ctDNA长度

环状-RNA-测序案例分析

案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的

基因测序的应用案例

史蒂夫·乔布斯曾接受过全基因测序  基因测序,本是一种实验室研究技术手段,因“名人效应”应用于高端体检、产前诊断等领域,价格不菲。基因测序最广为人知的,是影星安吉丽娜·朱莉通过基因检测,选择手术切除乳腺以降低患乳腺癌风险。2011年去世的苹果公司创始人史蒂夫·乔布斯患癌时,也曾接受过全基因测序。  

【案例分享】特种设备质量鉴定

事情是这样的,某科技公司从某机电厂处购买了4个300L的储液罐,安装于冷库内并投入使用,某次储液器在停用状态下突发爆炸事故,科技公司在事故发生后发现一台储液器焊缝部位存在泄漏,因此怀疑设备存在质量问题,买卖双方因而发生纠纷诉至法院。法院为审理案件特委托华碧对涉案储液器是否符合国家相关质量标准进行鉴定

稳定输出,样本DNA提取案例分享

最近实验室的师兄师姐们反馈,试用了MP的两款柱膜法新品试剂盒(SPINeasy DNA Kit for Soil和SPINeasy DNA Kit for Feces)都得到比较理想的实验数据,问了一圈身边的科研小伙伴们,认为操作简便,提取DNA纯度高、收率好的试剂盒为优先考虑购买的上上之选

RNA甲基化测序

1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行

饮食诱导非酒精性脂肪肝动物造模案例分享(二)

【 高果糖饮食(HFr) 】高果糖饮食可诱导小鼠肝脏脂质新生,胰岛素抵抗、脂肪变性、炎症、纤维化,与人类NASH患者具有相似表型,但该模型诱导的动物体重增长较HFD模型少,可以结合高脂饮食及高胆固醇饮食一起使用。案例三:雄性SD大鼠+MCD[3]实验表现两组体重在2周时无明显差异,但从喂食第6周开始

锂电池化成流程设置案例分享

化成流程设置案例如下图所示,杨涛等人采用了A(限压)和B(限容)两种化成模式,其结果表明,采用工艺B化成后的电池内阻要小于工艺A,且工艺B限容化成后的电池容量分布一致性明显优于工艺A。因此,采用限容化成可提高电池化成的一致性。化成工艺对高镍三元锂离子电池的性能影响赵彦孛采用如下流程评估了A组和B组两

ctDNA甲基化,液体活检助力癌症早筛的核心武器

  北京莱盟君泰国际医疗技术开发有限公司是LAM®总部在中国设立的分支,更是促成癌症早期筛查与临床干预前沿技术在中国“落地生花”的重要根据地。2018年,公司进入发展的关键期:与美国同步,推出针对多癌种的早期筛查技术,即基于ctDNA甲基化的液体活检产品。  “我们以‘未癌先知、健康先行’为创新理念

科学家找到新结直肠癌筛查技术-望实现无创筛查

结直肠癌是我国发病率排名前三的恶性肿瘤,早期筛查已被证实可以降低结直肠癌的发病率和死亡率。 11月11日,从复旦大学附属肿瘤医院获悉,该院大肠外一科蔡国响教授团队近日联合南方医科大学南方医院梁莉教授团队等,成功研发并验证了一种新的ctDNA甲基化单倍型检测手段ColonES,通过二代测序评

植物育种表型筛选技术方案与案例分享

表型筛选是在植物育种过程中将植物表现的优良性状筛选出来,并最终能够固定在植株上,从而培育出优良的品种。标准的生化检测技术,如分光光度法或高效液相色谱,已被用于植物育种过程中的表型筛选。这些方法结果准确,但它们具有破坏性、耗时、劳动密集且繁琐、成本高,并且不能满足大规模筛选程序的需要。植物育种过程需要

核磁共振在食品领域部分案例分享

案例一:不同超声波辅助压力处理下鸡肉的水分相态及运动性的变化图1 不同超声波辅助压力处理对鸡肉T2图谱影响注:·J0-J5为不同超声波辅助压力处理;T21为结合水,T22为不易流动水,T23为自由水;·不同超声波压力辅助处理后,自由水向不易流动水转化,鸡肉的持水力增强。案例二:不同种胶体及不同浓度胶

关于穿破硬脊膜案例的处理分享

椎管内穿刺时麻醉医生常用的操作技能,由于是经验性盲穿技术,故穿破硬脊膜仍是有可能发生,虽然几率为1.5%,但是头痛发生几率却高达52%。正所谓常在河边走,哪有不湿鞋,本人从事麻醉专业将近十年,一直小心翼翼,可最近在一次硬膜外穿刺过程中,还是不小心刺破了。病例回顾患者女性26岁,50kg,因“停经40

免疫共沉淀(coIP)实验案例分享

—— co-IP 检测 Hsp90 与 Cdc37 结合情况1、实验材料SKBR3 细胞,PMSF(Amresco,cat:329-98-6),cocktail(上海晶莱生物),脱脂奶粉(cat:66196131T),β-actin(上海晶莱生物)。Anti-Hsp90(santa,cat:

DNA-甲基化测序常用方法

随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向

血浆中ctDNA甲基化数字PCR检测攻略Naica数字PCR的应用

基因调控区的DNA甲基化状态的改变可导致多种癌症的发生。这种表观遗传学改变在生物学上是稳定的,并存在于循环肿瘤DNA(ctDNA)中,使其适合于早期检测和无创动态监测肿瘤负荷。数字PCR技术凭借其较高的灵敏度、精准度以及对抑制剂的耐受度,在对低拷贝样品检测时表现出了极大的优势。在转移性和II/III

订书肽的合成方法与成功案例分享

  生物体内的多种生命进程调节都是通过蛋白质与蛋白质之间的相互作用来实现的。例如病毒的自组装,细胞的生长,分裂,分化等过程。而通常蛋白-蛋白相互作用的界面太大,从而使小分子药物很难对其进行靶向定位,达到高效特异性地阻断这种相互作用,展现良好的治疗效果。蛋白类药物因为很难顺利通过细胞膜所以也达不到直

订书肽的合成方法与成功案例分享

  生物体内的多种生命进程调节都是通过蛋白质与蛋白质之间的相互作用来实现的。例如病毒的自组装,细胞的生长,分裂,分化等过程。而通常蛋白-蛋白相互作用的界面太大,从而使小分子药物很难对其进行靶向定位,达到高效特异性地阻断这种相互作用,展现良好的治疗效果。蛋白类药物因为很难顺利通过细胞膜所以也达不到直接

容易发生误诊的孕期腹痛多种案例分享

大夫:我肚子疼............. 每每有孕期腹痛的就诊,我们第一考虑是先兆流产或先兆早产。但是今天想和大家分享一下孕期腹痛的其它案例。比如孕期阑尾炎,孕期子宫肌瘤红色变性,孕期肾积水或泌尿系结石,孕期卵巢囊肿破裂或卵巢囊肿蒂扭转,孕期肠管痉挛,中晚孕期瘢痕子宫破裂,胎盘早剥,它们分别有什