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植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制

植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中,miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合,最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割,或者在内质网中抑制靶基因mRNA的翻译。与此一致的是,AGO1蛋白在细胞质、内质网、以及细胞核中均有分布。然而,AGO1在不同亚细胞区间的分布和定位模式与其介导靶基因沉默的方式和效率是否有关尚不清楚。 JIPB近日在线发表了复旦大学生命科学学院郑丙莲课题组题为“Brassinosteroids inhibit miRNA-mediated translational repression by decreasing AGO1 on the endoplasmic reticulum”的研究论文(https://doi.org/10.1111/jipb.......阅读全文

科研中的“新星”技术——MicroRNA荧光定量PCR

Micro RNA简介微小RNA(microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码单链小分子RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶

陈雪梅教授Cell揭示基因沉默新机制

  提及RNA分子,最广为人知的作用就是参与蛋白质的合成。然而MicroRNA (miRNA),这类被发现广泛存在于植物和动物中,长度约为22个核苷酸的小分子RNA,却并不编码蛋白,而是在基因调控中发挥作用,其影响了从发育、生理到应激反应几乎所有的生物学过程。   microRNAs几乎存在于

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程

  中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上,发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现,HYL1蛋白除了介导m

miRNA和siRNA简介及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

RNA实验方案和应用(二)

miRNA 模拟物是化学合成的,双链RNA分子(通常长度为18–24个核苷酸),通过转染到细胞中,模拟成熟的内源性miRNA分子。miRNA抑制剂是单链(通常长度为21–25个核苷酸),经过修饰的RNA分子,通过转染到细胞中,特异性的抑制miRNA的功能。模拟物和抑制剂包含一些化学修饰,以

micro RNA(miRNA)综述-2

miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs――lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA3'非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3'非编码区

microRNAs(miRNAs)简介(1)

microRNAs(miRNAs)是一种小的,类似于siRNA的分子,由高等真核生物基因组编码,miRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。miRNAs在物种进 化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,m

苏长青:miRNA治疗癌症?也许不是全能,但充满希望

   在百度上输入“肝癌”二字,除了一些百科性质的内容,常常还能看到“肝癌晚期能活多久”,“家人得了肝癌怎么办”,或者是“肝癌真的没得救了吗”之类的检索项。作为最常见的恶性肿瘤,原发性肝癌也许对于其它国家来说只是恶性肿瘤排行榜的一个名字,但是对于占据了全球一半新发肝癌病例的中国来说,这种疾病好似触手

RNA实验方案和应用(一)

RNA是具有多种不同的功能的生物大分子。信使RNA(mRNA)是DNA转录得到的,用做蛋白质合成的模板。蛋白质的合成是由核糖体完成的,核糖体由核糖体RNA(rRNA)和蛋白质组成。用于蛋白合成的氨基酸,是通过转运RNA(tRNA)输送到核糖体上的。RNA分子也是参与RNA转运过程的核糖蛋白的一部分。

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(三)

2) miRNA的靶基因预测方法 miRNA的研究意义之重大是毋庸置疑的。然而,与新的miRNA的频频发现相比,miRNA的功能研究相对缓慢。到目前为止,在发现的4449多个miRNA中,确定功能的miRNA仅有几十个。导致miRNA功能研究进展缓慢的非常重要的原因是miRNA的作用靶标难

MicroRNA(miRNA)荧光定量PCR原理

一、什么是miRNA?MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。据推测,这些非编码小分子RNA(miRNAs)参与调控基

RIP 技术--研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

  microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。   miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA

RIP 技术--研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

  microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。   miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

复旦大学,中科院Cancer Res发现癌症转移的新机制

  生物通报道:来自中科院生物化学与细胞生物学研究所,复旦大学中山医院等处的研究人员发表了题为“KRAS-NFκB-YY1-miR-489 signaling axis controls pancreatic cancer metastasis”的文章,发现KRAS通过激活NF-κB炎症信号通路激活

小分子RNA(miRNA)简介

一、什么是小分子RNA( MicroRNA)?    MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary

揭示miRNA在肿瘤细胞糖代谢中的功能及调控机制

  5月17日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所季红斌研究组与刘新垣研究组合作的研究论文miR-143 regulates cancer glycolysis via targeting hexok

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

双萤光素酶报告基因检测

  萤光素酶报告基因系统广泛应用于真核生物基因表达和细胞生理学研究,包括受体活性、转录因子、细胞信号转导、mRNA加工和蛋白质折叠等。萤光素酶是理想的报告基因,因为哺乳动物细胞中不含内源性萤光素酶,一旦转录完成立刻就生成功能性的萤光素酶。单萤光素酶报告基因实验往往会受到各种实验条件的影响,而双萤光素

诱导JNK组合促进胃癌发生研究进展分析

  胃癌是恶性肿瘤最常见的类型之一,是全球第二大癌症相关死亡原因。由于早期胃癌具有非特异度症状,患者往往晚期才能确诊。临床数据表明,晚期胃癌患者术后5年生存率仅为30%-40%,而早期胃癌则为70%-90%。因此,早期诊治是提高患者5年生存率和改善患者预后的重要途径。目前,胃癌的诊断依赖于内镜、病理

RIP 技术——研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具 一

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合

Cell杂志最受关注十篇文章(5月)

  Cell创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:  1. Betatroph

研究揭示microRNA抑制mRNA表达新机制

  为了让基因中包含的指令最终在体内发挥某些功能,构成基因DNA序列的核苷酸或者说碱基必须被读取并用于产生信使RNA(mRNA)。所产生的mRNA随后必须翻译成功能性的蛋白。细胞内的许多不同途径会影响这一重要的生物学过程,决定着基因是否、何时以及在多大的程度上表达。一类主要的调节因子是microRN

p53基因的临床应用(二)

简介    P53蛋白主要分布于细胞核浆,能与DNA特异结合,其活性受磷酸化、乙酰化、甲级化、泛素化等翻译后修饰调控。正常P53的生物功能好似“基因组卫士(guardian of the genome)”,在G1期检查DNA损伤点,监视基因组的完整性。如有损伤,

《细胞》:三效合一的新型基因表达调控技术

研究人员研制出一种分子开关,能够可逆控制哺乳动物基因的开启和关闭,控制基因的表达水平,将对生物学过程和疾病相关基因的研究的精确度提高到一个更高的水平。详细内容刊登于上周《Cell》。 作者对这项研究“允诺了很多,”明尼苏达大学Perry Hackett(未参与研究)说,“他们兑现了允诺。” 研究

microRNAs(miRNAs)简介(2)

65%B细胞慢性淋巴型白血病(CLL)病人,50%的套细胞淋巴瘤病人,16-40%的骨髓瘤病人、60%的前列腺癌病人中有13q14位点的缺失。因此,在这个30Kb的区域中必定有一个肿瘤抑制基因的存在。而mir-15a和mir-16-1位于这一区域中一个功能未知的被称为LEU2的非编码蛋白的RNA基因

RIP技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合到核糖核