HindIII和Bamh1酶切位点保护碱基的详解

用于基因工程的工具酶一,限制性内切酶(Endonucleosase)(一)限制性内切酶(Endonucleosase)的发现与分类1) 50年代初发现细菌能将外来DNA片段在某些专一位点上切断,从而保证其不为外来噬菌体所感染,而其自身的染色体DNA由于被一种特殊的酶所修饰而得以保护,这种现象叫做限制-修饰,它们由三个基因位点所控制:hsd R, hsd M, hsd S, 十年后,人们搞清了细菌的限制与修饰分子机理:hsd R---限制性内切酶hsd M---限制性甲基化酶hsd S---控制两个系统的表达1968年Smith等人从流感嗜血杆菌株中分离出两个类内切酶,Hind II和Hind III,为基因工程技术的诞生奠定了基础.截止到目前为止,已经分离出400余种II类酶,搞清识别位点的有300种,商品化的约有一百种,而实验室常用的有二十种 .2)限制性核酸内切酶可分为三大类:I类 能识别专一的核苷酸顺序,并在识别点附近切割......阅读全文

HindIII和Bamh1酶切位点保护碱基的详解

用于基因工程的工具酶一,限制性内切酶(Endonucleosase)(一)限制性内切酶(Endonucleosase)的发现与分类1) 50年代初发现细菌能将外来DNA片段在某些专一位点上切断,从而保证其不为外来噬菌体所感染,而其自身的染色体DNA由于被一种特殊的酶所修饰而得以保护,这种现象叫做限制

什么是保护碱基、添加保护碱基的目的与原则是什么?

限制性核酸内切酶产品选择专题首先要明确什么是保护碱基限制性内切酶 识别特定的DNA序列,除此之外,酶蛋白还要占据识别位点两边的若干个碱基,这些碱基对内切酶稳定的结合到DNA双链并发挥切割DNA作用是有很大影响的,被称为保护碱基。添加保护碱基的目的在分子克隆实验中,有时我们会在待扩增的目的基因片段两端

GST融合蛋白表达与纯化的实验步骤与注意事项(一)

GST表达融合蛋白 pGEX-KG大小:5006bp,氨苄青霉素抗性(Ampr),IPTG诱导表达酶切位点:BamHI 930、SmaI 937、EcoRI 962、XbaI 966、NcoI 974、SalI 980、XhoI 985、SacI 992、HindIII 994GST分子量:构建pG

如何设定PCR引物的保护碱基?

如果您想直接对PCR产物酶切,同时想获得理想的酶切效果,一般情况下需要在酶切位点序列5’端方向增加额外的保护碱基。保护碱基的数目随酶的种类不同而不同,根据文献资料汇总,一般保护碱基有3-4个就可以了。不提倡提供过多的保护碱基,因为太多的额外碱基会增加PCR扩增的难度,同时增加合成费用。

怎么分析酶切位点

酶切位点(Restriction Enzyme cutting site):DNA上一段碱基的特定序列,限制性内切酶能够识别出这个序列并在此将DNA序列切成两段。可能存在同尾酶,不同酶的识别序列不同,有的可能能识别多个酶切位点比如STY1识别序列有WW

互补碱基的DNA和RNA的主要碱基的差别

胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;相反,尿嘧啶是RNA的主要嘧啶碱,在DNA中则是稀有的。在DNA分子结构中,由于碱基之间的氢键具有固定的数目和DNA两条链之间的距离保持不变,使得碱基配对必须遵循一定的规律,这就是Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,G

碱基的定义和结构

碱基,在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子,称为含氮碱基,氨基(-NH2)是最简单的含氮碱基。碱基,在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对,且彼此堆叠,所以,

常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)

常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)(BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等)在分子克隆实验中,限制性内切酶是必不可少的工具酶。无论是构建克隆载体还是表达载体,要根据载体选择合适的内切酶(当然,使用T载就不必考虑了)。先将引物设计好,然后添加酶切识别序列到引物5' 端。

常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)

常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)(BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等)在分子克隆实验中,限制性内切酶是必不可少的工具酶。无论是构建克隆载体还是表达载体,要根据载体选择合适的内切酶(当然,使用T载就不必考虑了)。先将引物设计好,然后添加酶切识别序列到引物5' 端。

质粒载体和外源DNA中限制酶切位点的性质

 如今,质粒载体中限制酶切位点的种类极为繁多,因而通常都有可能找到某种带限制酶切位点恰恰与外源DNA片段本身毫无二致的载体。这就具备一个不可比拟的优点,也应是可以用相应的限制酶消化重组质粒崦回收外源DNA。另一种方案,则是把片段插入到载体中能产生匹配末端的任何位点中。例如,识别不同的六核苷酸的限制酶

质粒载体和外源DNA中限制酶切位点的性质

如今,质粒载体中限制酶切位点的种类极为繁多,因而通常都有可能找到某种带限制酶切位点恰恰与外源DNA片段本身毫无二致的载体。这就具备一个不可比拟的优点,也应是可以用相应的限制酶消化重组质粒崦回收外源DNA。另一种方案,则是把片段插入到载体中能产生匹配末端的任何位点中。例如,识别不同的六核苷酸的限制酶B

新碱基的功能和特点

甲基胞嘧啶(mC):源于C,是表观遗传机制的主要原因。作为一种重要的表观遗传修饰,mC参与基因表达调控、X-染色体失活、基因组印记、转座子的长期沉默和癌症的发生。甲基腺嘌呤(mA),其主要作用是确定表观基因组的性质,并因此在细胞的生命过程中发挥重要作用。藻类、蠕虫以及苍蝇都拥有mA。mA的主要功能是

碱基的定义和作用介绍

碱基是合成核苷、核苷酸和核酸的基本组成单位,其组成元素中含有氮,也称“含氮碱基”。

质粒构建之酶切位点的选择

结论:一定要选择具有相同buffer的两个酶 技术背景: 克隆目的基因,并把其装入表达载体转化/转染原核细胞/真核细胞中,是获取目的蛋白/研究基因功能的经典方法,也是目前科研工作者常用的方法。其中酶切是该技术不可缺少的一部分,随着载体设计技术的发展,双酶切以其独特的优点而逐渐取代了单酶切 。 具体

教你如何做分子构建,从此迈向科研达人!

做过分子实验的人都知道,要想做的有效率有质量是很苦逼的,1 个月做 100 个克隆那都是 小 case,没点看家的本事怎么行。如果再遇到比较稀有的基因,周旋个把月,那也是家常便饭。下面就和大家分享一些载体构建的经验,从此迈向科研达人!1. 准备工作 俗话说:用欲善其事,必先利其器。建议大家在做构建之

双酶切小技巧

A.任何时候2 种酶的总量不能超过反应体系的1/10体积。B.双酶切时如果两种酶反应温度一致而buffer不同时,可查阅内切酶供应商在目录后的附录中提供的各种酶在不同buffer中的活力表(也可以向ebiotrade.com客户服务部索取),如果有一种buffer能同时使2 种酶的活力都超过70

碱基对的结构和组成

碱基对,是一对相互匹配的碱基(即A—T, G—C,A—U相互作用)被氢键连接起来。它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。

碱基置换的概念和类型

碱基置换(substitution)包括两种类型:转换(transition)是由嘌呤置换嘌呤或嘧啶置换嘧啶。颠换(transversion) 是指嘌呤置换嘧啶或嘧啶置换嘌呤。如碱基置换发生于编码多肽的区,则因可影响密码子而使转录、翻译遗传信息发生变化,因此可以出现一种氨基酸取代原有的某一种氨基酸。

碱基对的概念和作用

碱基对,是一对相互匹配的碱基(即A—T, G—C,A—U相互作用)被氢键连接起来。它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U

碱基互补配对的概念和原则

碱基互补配对是指核酸分子中各核苷酸残基的碱基按A与T、A与U和G与C的对应关系互相以氢键相连的现象。它是沃森和克里克首先在DNA双螺旋结构模型中提出来的,后来发现,不仅在DNA复制中有这种规律,在转录过程DNA和RNA关系中也有类似的规律。甚至单链RNA中凡在空间靠近、可以氢键互相结合的碱基,也能这

内切酶用于克隆PCR的相关介绍

  克隆PCR产物的方法之一,是在PCR产物两端设计一定的限制酶切位点,经酶切后克隆至用相同酶切的载体中。但实验证明,大多数限制酶对裸露的酶切位点不能切断。必须在酶切位点旁边加上一个至几个保护碱基,才能使所定的限制酶对其识别位点进行有效切断。酶切位点(内切酶的识别序列)要加在引物的5'端,为

PCR产物末端限制酶切位点的切断情况

克隆PCR产物的方法之一,是在PCR产物两端设计一定的限制酶切位点,经酶切后克隆至用相同酶切的载体中。但实验证明,大多数限制酶对裸露的酶切位点不能切断。必须在酶切位点旁边加上一个至几个保护碱基,才能使所定的限制酶对其识别位点进行有效切断。下表列举了15种限制酶,分别比较了各种限制酶在其酶切位点旁边分

PCR产物末端限制酶切位点的切断情况

克隆PCR产物的方法之一,是在PCR产物两端设计一定的限制酶切位点,经酶切后克隆至用相同酶切的载体中。但实验证明,大多数限制酶对裸露的酶切位点不能切断。必须在酶切位点旁边加上一个至几个保护碱基,才能使所定的限制酶对其识别位点进行有效切断。下表列举了15种限制酶,分别比较了各种限制酶在其酶切位点旁边分

什么是内切酶?

  内切酶incisionenzyme是一种能催化多核苷酸的链断裂的酶,只对脱氧核糖核酸内一定碱基序列中某一定位置发生作用,把这位置的链切开。通过内切酶可以把某一个遗传基因切下来,若再连在别的细胞的遗传基因上,便可使这细胞具有新的遗传特性。内切酶的发现和采用,使基因工程成为可能。一种限制酶只能识别一

回文序列限制性酶切位点

回文序列在分子生物学中起着重要的作用。许多限制性内切酶能识别特定的回文序列并切割它们。比如,限制性内切酶EcoR1识别以下回文序列:5'- G A A T T C -3'3'- C T T A A G -5'

DNA和RNA的主要碱基区别

DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要区别是:胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;

DNA和RNA的主要碱基区别

DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要区别是:胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;

组成碱基对的碱基有哪些?

组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。

细胞化学基础碱基的种类修饰碱基

DNA和RNA分子中还含有核酸链形成后经过修饰形成的其它非主要碱基。这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化(methylation)或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。DNA中最常见的修饰碱基是5-甲基胞嘧啶(m5C)。RNA中有许多修饰的碱基,包括核苷类假尿苷(Ψ)、二氢尿苷(D)、肌苷

碱基互补配对原则的碱基互补的介绍

  在脱氧核糖核酸分子中,含氮碱基为腺嘌呤(A),鸟嘌呤(G),胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。每一种碱基与一个糖和一个磷酸结合形成一种核苷酸。在其双链螺旋结构中,磷酸-糖-磷酸-糖的序列,构成了多苷酸主链。在主链内侧连结着碱基,但一条链上的碱基必须与另一条链上的碱基以相对应的方式存在,即腺嘌呤对应胸