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Nature子刊首次展示掌上测序仪的巨大潜力

纳米孔测序也被称为第三代测序,而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。去年11月,该公司启动了掌上测序仪MinION的早期试用计划。这个备受关注的测序仪只有USB大小,可以实现即插即用。 East Anglia大学和Public Health England的研究团队十二月九日在Nature Biotechnology杂志上发表了使用MinION获得的研究成果,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的抗性基因。这项研究表明,这一技术能够很好的用于传染病诊断。 “长读取”测序对于确定抗性基因的位置是非常重要的,纳米孔测序就是一种长读取的基因组测序技术。此前的长读取测序需要在昂贵的仪器上进行,而且操作起来比较复杂,往往只能在专业性的实验室里使用。而MinION非常小巧轻便,售价更低至650英镑左右。 最近在全球范围扩散的伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)单体型H58是一种具有多重耐药性的突变......阅读全文

Nat Methods: 2014年值得关注的技术

  单细胞测序被评为2013年年度技术   2014 年首刊,《Nature Methods》杂志将2013年度技术(Method of the Year 2013)授予了单细胞测序(single-cell sequencing)。同时,杂志还介绍了2014年值得关注的技术,包括

2019年8月CRISPR/Cas最新研究进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片

2020年CRISPR/Cas最新研究进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

生物谷7月份结构生物学研究进展一览

  1. Cell:中科院生物物理所王艳丽/章新政课题组从结构上揭示Cas13a切割RNA机制  doi:10.1016/j.cell.2017.06.050  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CR

一周资讯回顾:他用DNA测序技术,让百年肿瘤“变废为宝”

  国内资讯  重磅!《“十三五”生物技术创新专项规划》发布,基因测序、免疫疗法、AI等“被点名”  5月10日,据科技部官网消息,按照《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》、《国家创新驱动发展战略纲要》、《“十三五”国家科技创新规划》等的总体部署,为加快推进生物技术与生物技术产业

合成基因组发表两月 部分国际反应

  我们也必须记住,自然界本身就是一名已经存在的专家,她在创造可对人类造成极大危害的微生物。合成生物学的最新进展并不一定会把我们带到比现有技术或自然界本身更接近伤害的道路。  慎重的民主就要听不同的观点,考虑对方的论点,最好找到共同点,至少要尊重不同观点,然后作出决定。面对复杂问题各

单碱基基因编辑研究进展速览

  本文中,小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展,分享给大家!  【1】Nat Commun:科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑  doi:10.1038/s41467-019-10421-8  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪

一文了解癌症检测创新性研究成果!

  时至岁末,转眼间2019年已经接近尾声,迎接我们的将是崭新的2020年,在即将过去的2019年里,科学家们在癌症检测领域取得了多项重要的研究成果,本文中,小编就对本年度科学家们在癌症检测研究领域取得的重磅级研究成果进行整理,分享给大家!  图片来源:CC0 Public Domain  【1】J

年终盘点:2018年基因编辑盘点

  2018年11月,中国科学家贺建奎声称世界上首批经过基因编辑的婴儿-一对双胞胎女性婴儿---出生。他利用一种强大的基因编辑工具CRISPR-Cas9对这对双胞胎的一个基因进行修改,使得她们出生后就能够天然地抵抗HIV感染。这也是世界首例免疫艾滋病基因编辑婴儿。这条消息瞬间在国内外网站上迅速发酵,

年度巨献:2019癌症免疫疗法重磅级研究成果!

  时光总是匆匆易逝,转眼间,2019年就要结束了,在即将过去的一年里,科学家们在癌症免疫疗法研究领域取得了哪些重要的研究成果呢?本文中,小编对相关重要的研究成果进行整理,分享给大家!  图片来源:Emory University  【1】Immunity:阐明T细胞“耗尽”的机制有望改善癌症免疫疗

2017年5月CRISPR/Cas亮点盘点

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。  

帕金森领域研究进展一览

  本期为大家带来的是帕金森领域的相关研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. neurology:眼部疾病常见于帕金森症患者  DOI: https://doi.org/10.1212/WNL.0000000000009214  根据最近发表的一项研究,患有帕金森氏病的人比健康人群更容易出现视力

不容错过!2019年8月Nature子刊重磅研究一览!

  本文中小编为大家盘点了2019年8月Nature子刊的亮点研究,分享给大家一起学习进步,希望读者朋友们喜欢。  【1】Nat Commun:重复精液暴露促进宿主对HIV感染产生抵抗力,只是谁敢尝试呢?  DOI:10.1038/s41467-019-11814-5  长期以来,人们认为精液仅能作

最全癌症基因图谱公布 有望提前数十年识别出肿瘤突变

  癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起。早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。  2月5日,Nature杂志及其子刊同期发表了20余篇关于癌症研究的文章,由来自37个国家、

2018年糖尿病专题盘点

  2018年即将过去,年末为大家献上生物谷本年度糖尿病专题盘点,希望读者朋友们能够喜欢。1. Nature:利用细胞替换疗法治疗1型糖尿病取得重大进展!胞外基质组分决定着胰腺祖细胞的命运DOI: 10.1038/s41586-018-0762-2  I型糖尿病是一种自身免疫性疾病,它会破坏胰腺中产

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(五)

二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究,但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近

专家点评Nature 中国科学家发现肝癌精准治疗新靶点

  肝癌由于预后差、死亡率高、不易早期诊断等特征,也常被称为“癌中之王”(一般认为是胰腺癌)。肝癌是对各种组织学上不同类型的原发性肝脏肿瘤的统称,主要包括肝细胞癌、肝内胆管癌、肝母细胞癌、胆管囊腺癌等。其中,肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)占绝大部分,约占原发性

液体活检急速升温,检测新秀不可忽视!

  作为体外诊断的一个分支,液体活检是指一种非侵入式的血液测试,能监测肿瘤或转移灶释放到血液的循环肿瘤细胞(CTC)和循环肿瘤DNA(ctDNA)碎片,是检测肿瘤和癌症、辅助治疗的突破性技术,目前已逐步进入临床,国内最新进展是药监局批复格诺生物的肺癌CTC 试剂盒,带动行业进入应用。  液体活检的优

基因编辑进展梳理 Part I CRISPR系统拓展及机制研究(二)

 两篇研究揭示Cas4核酸酶对于CRIPSR免疫反应的重要性2018年3月27日的,Shiimori团队在Cell Reports期刊上发文,证明了Cas4核酸酶是间隔序列前体临近基序( PAMs )靶向选择所必须的,有助于Cas1和Cas2选择新的CRISPR间隔物,并赋予天然宿主S

一文了解12月HIV研究亮点进展

  人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV),即艾滋病(AIDS,获得性免疫缺陷综合征)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1983年,HIV在美国首次发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒(lentivirus),属逆转录病毒的一种。HIV通过

基因测序技术未来40年的发展展望

1977年,Science的两篇论文描述了第一种用于确定DNA片段中化学碱基顺序方法。而在这些文章发表之前,分子生物学家已经能够排列片段。四十年过去了,如今,DNA测序技术正以惊人的速度向前发展。在过去十年中,高通量测序技术使数据生成呈指数级增长态势。 由此产生的大量数据在基础生物学领域的应用已经产

梳理近期那些不靠谱的研究

  近年来,由于细胞系污染、实验技术本身存在问题而有待改进、实验结果无法重复和研究人员存在学术不端等缺陷,不少论文的实验结果广受质疑,甚至论文惨遭撤回。基于此,小编针对近期这方面的相关新闻进行梳理,以飨读者。  1.PLoS ONE:HeLa细胞幽灵---细胞系污染导致大约3.3万篇论文存在问题  

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

华大智造:我们的这种测序方法吊打传统MPS

  在生物医学大数据的重要价值日益凸显的今天,大规模组学计划成为世界各国的重要战略布局,如何能够更准确、更快速、更低成本地开展基因测序变得愈发迫切,驱动着技术之轮飞驰向前。高通量测序诞生和发展的历史,镌刻着科学家和产业先驱们在“更准、更全、更快、更便宜”的道路上所作出的种种努力。近日,由华大智造联合

【盘点】5月CNS三大期刊亮点研究汇总

  5月份就要过去了,生物谷小编根据本站报道的Cell、Nature和Science文章的点击量,对读者们关注度比较高的文章进行了盘点,这三大期刊虽然不能完全代表整个生物学领域的进展,但仍然十分具有指导性,囊括了生物学各个领域的部分最前沿进展。癌症,HIV以及肠道微生物仍然是读者们最为关注的几个领域

曾艺研究组发现小鼠胰岛成体干细胞身份

  北京时间3月19日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)曾艺研究组的文章“Long-term expansion of pancreatic islet organoids from resident Procr+ progenitors”在国际学术期刊《细胞》(Ce

新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq(Repertoire and Gene Expression by Sequencing),该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征,能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列,追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7

Nature子刊:新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  近年来,随着精准医疗的发展,癌症治疗已经取得了长足的进步,其中借助免疫系统开发的多种治疗方法被人们寄予厚望。虽然部分治疗方法在临床治疗中已经获得一定的成功,但大多数只对部分患者有效,并且还会导致耐药、超进展以及免疫相关严重不良反应等问题。因此,了解免疫系统在癌症治疗中的表现,准确筛选最有可能获益

PacBio首次确认一种疾病大片段缺失突变

  二代测序为生命科学研究带来了翻天覆地的变化,但是越来越多研究表明这种短读长测序 (short-read sequencing, SRS)虽然高通量,成本低,然而对于串联重复序列、高GC/AT序列、高度多态性区域、高度同源区域以及大片段结构变异的检测能力非常有限,难以全方位的捕捉基因组的变化。据估