检测癌症相关DNA修饰新测序方法

牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明,他们开发的新方法,TET辅助吡啶硼烷测序(TET-assisted pyridine borane sequencing,TAPS)是一种比亚硫酸氢盐测序(bisulfite sequencing)损伤更小、效率更高的替代者,现在亚硫酸氢盐测序是绘制表观基因的黄金标准。 “我们认为TAPS可以直接取代亚硫酸氢盐测序,成为DNA表观遗传测序的新标准,”Song说。“它使DNA表观遗传学测序更经济实惠,并可用于更广泛的学术研究和临床应用。” 一类表观遗传修饰涉及化学基团附着在特定的DNA“字母”上。标记本身不改变DNA序列,而是影响基因开关。两种最常见的修饰包括胞嘧啶上添加甲基和羟甲基,以生成5mC和5hmC。“5mC和5hmC丰度异常是癌症的典型特征,”Song说。 几十年来,生物学家一直......阅读全文

DNA检测将替代常用癌症检测方法

  巴氏涂片检查方法(Pap smear)是公共卫生一种广泛使用的金标准检查方法,这种方法主要针对子宫颈癌等疾病,能有效的检测出人类乳头瘤病毒(HPV)细胞的异常变化。然而近期美国食品药品管理局(FDA)批准了一种以DNA为基础的病毒检测方法。   1943年,Papanicolaou和Tra

神秘DNA提供新的癌症检测法

  最近,美国弗吉尼亚大学的研究人员发现,存在于染色体外面的奇特环状DNA,根据产生它们的细胞类型,而有所差异。这一研究结果增加了一种诱人的可能性,即,这些环状DNA可以作为不同类型癌症的生物标志物。相关研究结果发表在最近的《Cell Reports》。  MicroDNAs,是一类已被命名的新DN

检测癌症相关DNA修饰新测序方法

  牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明,他们开发的新方法,TET辅助吡啶硼烷测序(TET-assisted pyridine borane sequencing,TAPS)是一种比亚硫酸氢盐测序(bis

敏感检测癌症DNA甲基化技术,有望改进非侵入式癌症检测

  检测肿瘤释放进入血液中的游离DNA(cfDNA,cell-free DNA)的突变是一种极具潜力的癌症检测方法。然而这类检测的敏感性和准确性及其检测早期癌症的能力目前仍然处于低水平。一种潜在的替代方法是检测cfDNA上的甲基化水平,因为在肿瘤中,DNA甲基化水平会发生显着的变化。  早期的全基因

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

DNA甲基化与癌症之NGS检测篇

  摘要  DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

利用DNA图谱诊断癌症

  作为无创产前诊断等相关领域技术的首创者,来自香港中文大学的卢煜明(DennisLo)教授最早就曾发现孕妇外周血中存在“漂流”的胎儿DNA,也就是说,假设每毫升母亲样品相当于1000个基因组,则总共含有1900条母亲的21号染色体,100条整倍体胎儿的21号染色体或150条21三体胎儿的21号染色

用循环DNA进行早期癌症的非创伤性检测

  一种新型的基于DNA测序的方法对以非创伤性方式来发现早期癌症有帮助,它是通过分析血液循环中的源自肿瘤的遗传物质碎片来实现这一目的的。这些发现或为创建对癌症病患更有用的筛检及管理工具做好了准备。全球每年有超过1400万人被诊断罹患癌症,他们中的大多数都是在癌症发展到晚期的时候才被发现的,这时可供

科学家称可通过DNA检测提前预测癌症发病

X射线下的乳房肿瘤----美联社   据卡塔尔半岛电视台网站8月5日报道,俄罗斯科学家宣布他们可以通过DNA检测提前三到五年预测到癌症的发病。如果这是真的,这将为癌症的预防和治疗打开新的视野。   “俄通社-塔斯社”周一援引莫斯科大学第一医学院新闻办公室消息称,医学院专家们发现了一种能够提前三到

快速的DNA测序仪正带来简单的癌症血液检测

  中国(相关)的一切都很大,包括它的癌症问题。在一些富裕的城市,如北京,癌症被认为是最常见的杀手。空气污染,吸烟率高,以及因工业污染而造成的“癌症村”,正在增加这个国家的死亡率。它的肝癌发生率是西方国家的四倍,部分原因在于每14个中国人中就有一个携带乙肝病毒,全世界每年死于癌症的人中,大约有27%

癌症检测

什么是肿瘤标志物  肿瘤标志物是由肿瘤细胞产生的,存在于细胞.组织或体液中,能用化学或免疫方法定量、证明癌肿存在(或在某一脏器存在)、可以监测肿瘤治疗和预后的物质。有的肿瘤标志物在正常人体内不存在,罹忠癌症后才会出现,有的则是罹患癌症后水平会显著高于正常人,因此,肿瘤标志物检查可以检测到早期癌症的踪

Nature解析癌症与“垃圾”DNA

  癌症是由多次遗传改变(或突变)而引起的一类疾病。我们从父母那里继承了或强或弱的形成某些癌症类型的遗传易感性;此外,在我们的一生中我们的细胞内也会不断地累积新的突变。尽管已开展了很长一段时间的癌症遗传起源研究,直到现在研究人员仍无法估量基因组一些非编码区域的作用。  来自日内瓦大学(UNIGE)的

癌症与某些“垃圾DNA”有关

  英国研究人员日前报告说,人类基因组中一些“垃圾DNA”产生的物质与乳腺癌等癌症存在相关性,这项发现有助于研发新的癌症治疗方法。   英国诺丁汉大学等机构研究人员在美国《基因组学》(Genomics)杂志上报告说,他们发现人类基因组中名为L1的DNA序列会导致生成一些反常产物,而这些产物多见于乳

Sci-Transl-Med:基于DNA片断的尺寸开发癌症血液检测技术

  日前,一项刊登在国际杂志Science Translational Medicine上的研究报告中,来自英国、丹麦、波兰、荷兰和瑞士的科学家们通过对血流中循环的肿瘤DNA片段的尺寸进行研究,开发了一种新型的癌症检测技术,文章中,研究者描述了如何在不同类型的癌症中应用这种新型技术。图片来源:CC0

垃圾DNA是诱发癌症的动力

  根据“人类卫星二”,人类基因组认为是“垃圾DNA”的异常高拷贝但未被探索的序列具有令人惊讶的能力,影响我们基因组的主要监管者。放松管制时,这些重复核苷酸序列的大片段将主要调节蛋白结合并分解成癌细胞中的大核体。这可能导致表观遗传学不稳定  -基因调控的变化  -这是许多癌症进展的动力。  神经学教

每个癌症患者都应进行DNA测序

  英国首席医疗官萨利·戴维斯女士近日发布了一份年度报告,主旨是建议每个癌症患者接受DNA测序,以防止误诊、不必要的反复确诊和无效的化疗。  目前,英国每年有超过35万人被诊断患有癌症,每年约有16.3万人因此死亡。萨利表示,是时候结束“诊断性恶性肿瘤”了,这类患者一般要咨询5位以上医生,在确诊前平

-“垃圾DNA”中发现潜在癌症病源

  人类基因组中仅有1%~2%是负责蛋白质编码的基因,其余非编码区域早先被认为是毫无用处的“垃圾DNA”。但是,美、英等国研究人员最近在这个“垃圾”区域中找到近百个乳腺癌与前列腺癌的潜在“导火索”,提示研究“垃圾DNA”对了解癌症的重要性。   美国耶鲁大学、英国韦尔科姆基金会桑格研究所等机构的研

-循环肿瘤DNA实时跟踪癌症发展

  据本周三在《Nature Communications》杂志发表的一项新的研究中,科学家首次发现,流进入血液中的肿瘤DNA,可用于实时跟踪肿瘤的发展以及对治疗的响应。  三年多来,剑桥大学的研究人员,从肿瘤已经扩散到身体其他部位的一名乳腺癌患者身上,采集了外科肿瘤样本(活检)和血液样本。他们仔细

癌症猎手:血液中的微量DNA

        癌症,多细胞复杂生命的魔咒,随着人类医学的不断发展、平均寿命的不断提高,癌症从一种罕见病,逐步发展成为一种常见流行病。伴随着癌症患者人数的飞速增长,曾一度在大众中引发恐慌,当其时也,美苏政府均承诺要在若干年之内攻克癌症。许诺的时间早已过去,但人类的医学离彻底解决癌症,还相当遥远。只不

JACS:微型DNA探测器可显著提高癌症检测准确度

  根据最近一项研究,一种新的,使用由DNA制成的微小电路可以通过其表面上的分子特征来识别癌细胞。  在这项研究中,杜克大学的研究人员通过相互作用的合成DNA链形成了简单的电路,这些合成DNA链比人的头发细了数万倍。  与计算机中的电路不同,这些电路通过附着到细胞外部并分析细胞表明特异性高表达的分子

检测-DNA-突变,可以告诉我们谁可能有发展早期癌症

  爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展,在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是 Lola 和 Saul Kramer 分子遗传学主席 Jan Vijg 博士。  在科学家可以分析单个细胞的

DNA标记促进基于血液的检测手段有效评估癌症疗法的预后

  检测组织活检中的细胞改变一直是癌症诊断的基础,然而,组织活检具有侵入性,且由于取样位置、取样频率的限制和对组织异质性的代表性差,常常会受到不准确的限制。20世纪40年代末,研究人员在机体血液中发现了无细胞的DNA(cfDNA),近些年来基因组学和计算分析技术的快速发展,如今,一篇发表在国际杂志F

-DNA甲基化:癌症共有的“指纹”

  8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中,研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化,DNA甲基化标记,它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。  约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinber

DNA修复机制如何帮助抵御癌症

  2015年的诺贝尔化学奖颁发给了细胞DNA修复机制的相关研究,而理解细胞如何修复损伤的DNA对于开发有效的抗癌疗法或许非常重要。通过揭示机体细胞如何自发地修复引发疾病的DNA突变,研究者或许就可以帮助开发改善治疗癌症的化疗方法的有效性。  研究者Nora Goosen表示,我们可以利用知识来战胜

将DNA分割成液滴,新型血液检测给癌症患者带来福音

  识别非小细胞肺癌患者(NSCLC)的特定基因突变有助于临床医生选择最佳的治疗方案。《The Journal of Molecular Diagnostics》杂志描述了一种新的血液检测,可快速准确地识别与非小细胞肺癌相关的基因突变,能够使临床医生做出早期地、个性化的治疗选择。   该方法的发

癌症检测新手段

一项新的研究表明,一种针对不具有EGFR突变的非小细胞癌(NSCLC)患者,为他们提供预后信息的血液检测,能够降低癌症晚期的诊疗成本,并提高NSCLC患者的生存率,改善他们的生活质量。VeriStrat多肽组质谱检测(由美国Biodesix公司研发),用于帮助临床医生对不具有EGFR突变的晚期NSC

癌症基因检测标准

  据世界癌症预防组织机构统计,现今社会每100人就有1人因患癌症而死亡, 每年死亡的人数中,1/5是死于癌症。未来20年里,癌症将继续位居人类死因首位。  癌症的新认识  癌症只是慢性病,一类与冠心病、糖尿病有所类似的慢性病  癌症是生活方式疾病,80%与不良生活方式有关。  遗传、疾病、环境与职

聚集癌症血液检测

  虽然实体肿瘤的检测仍然是癌症诊断中的常规程序,但新一代测序等现代技术,已经使科学家们能够更详细地跟踪肿瘤的组织起源。许多肿瘤会脱落细胞,称为外泌体(exosome)的囊泡,也有DNA进入血液和其他体液的痕迹。最近的研究表明,这些碎片可以作为标记物,来监测疾病的进展,甚至有助于研究人员在症状出现之

癌症“坏运气”?Science:近2/3癌症突变源于DNA复制出错!

  “近2/3的癌症突变源于DNA复制过程中随机发生的错误!”  这是来自于约翰•霍普金斯大学基默尔癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)的科学家们在3月24日发表于《Science》期刊上的一篇最新学术论文的结论。它意味着,DNA复制出错是导致癌变的主要因