蛋白质组学的标准化(上)
Tim Wehr 由于人类基因序列的建立已经接近完成，人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域，蛋白质组学将其研究目标定位于：鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质，这样做的预期是，将能发现那些能够成为疾病生物标志物(biomarker)或药物靶标的候选蛋白质。经证明，这是一项令人望而生畏的工作，难度之一在于，25,000个基因中的每一个都会产生拼接、翻译后修饰，最后表达的蛋白质数量将会大大增加。另一个增加难度的因素是蛋白质的浓度范围太广——通常为许多个数量级——并且很可能大多数人们感兴趣的都是那些低丰度的蛋白。 目前，已有大量的技术和实验方法用于解决蛋白质组学的问题。其中应用最广泛的是“自下而上”的方法。用蛋白质水解酶(典型的为胰蛋白酶)将细胞提取液或溶胞产物中的所有蛋白质酶解，接着用反相液相色谱(LC)分离，然后在线引入电喷雾源的质谱。一种参考的液......阅读全文
ThermoFisher推出Proteome－Discoverer蛋白质组学软件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白质组学研究的突破性生物软件 质量信息学平台提供了强大的分析、开放和灵活架构，易于使用的界面 2008年5月30日，圣何塞，服务科学，世界领先的赛默飞世尔科技公司，今天宣布将在ASMS 2008（第56届美国质谱大会）上
质谱和蛋白质组学：击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节，第一个是样品的处理阶段，这是最简单，也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分，使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分，这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的
华盈视角：蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者，在生物医学领域中有着重要意义，检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律，为疾病的治疗、诊断，药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术，有必要了解其核心原理，才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理： 质谱是
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（四）
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
蛋白质组质谱新方法一览
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（二）
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（一）
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
《自然》子刊专题：蛋白质组学中的质谱
涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条，一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化，另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术（Mass spectrometry，MS）是蛋白质组学常用
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目，不一定要用到质谱技术简单说，蛋白质测序的方法有很多，一般是在构建完成后，通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后，用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
蛋白质组学的标准化(下)
蛋白质组学信息学研究组 蛋白质组学信息学研究组的任务是教育蛋白质组学研究实验室最大程度地应用和实践生物信息学方法，向精确和复杂的蛋白质组学数据分析方向发展。iPRG积极地支持和参与开发和提高新的算法、软件工具以及蛋白质组信息学战略，目标是向全体会员教育和介绍这些新技术。iPRG已经发起了两
蛋白质组学的标准化(上)
Tim Wehr 由于人类基因序列的建立已经接近完成，人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域，蛋白质组学将其研究目标定位于：鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质，这样做的预期是，将能发现那些能够成为疾病生物标志物(bioma
质谱组学，引领精准
8月，上海。炎炎夏日，骄阳似火，正值生机盎然的季节，一场造福行业发展的合作协议今日于上海签订。赛默飞世尔科技（中国）有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多组学及精准医疗领域，建立战略合作伙伴关系。出席本次签订协议的嘉宾有赛默飞世尔科技（中国）有限公司商务运营副总裁冯时瀚先生、上海中科新生命
基于质谱的空间蛋白质组学系统研究方法
蛋白质亚细胞定位及其动态变化过程对于蛋白质功能至关重要。随着鸟枪法蛋白质组学的发展，通过亚细胞分离及质谱技术同时测定数千个蛋白质稳态定位的“蛋白质组学显微镜(proteomic microscope)”出现了。然而，表征因扰动导致的亚细胞定位变化的工具却一直局限在光学显微镜，每次仅能成像一个或几
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人
AB－SCIEX三大质谱平台支撑蛋白质组学研究
2010年10月18~19日，由国家自然科学基金委、中国化学会分析化学委员会主办，复旦大学、上海交通大学承办的2010年微纳尺度分离和分析技术学术会议暨第六届全国微全分析学术会议在上海复旦大学复宣大酒店隆重召开。来自全国高等院校、科研机构、企事业单位的300余名专家学者出席了本次会议。
“组学国标”项目结硕果：最精准的mRNA测序与蛋白质组质谱
二代测序、蛋白质组质谱，这些“高大上”的组学手段早已不是稀罕事，使人们对生命和疾病的理解进入了一个崭新的时代。这些组学技术大量用于科研的同时，在应用领域却陷入了巨大的困境。 蛋白质组质谱技术和RNA测序目前几乎没有任何值得一提的临床应用，即便是在临床应用得相对较多的DNA测序，也饱受重复性差、
质谱技术帮助科学家发现蛋白质组学重要成果
最近，来自瑞士和荷兰的科学家，对在22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质，进行了定量和定性分析。确定了超过2300个蛋白质，其中一些处于每个细胞一个副本的平均水平。由此产生的数据集描述了细胞中大多数(> 90%)的蛋白质量，对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。相关研究结果发表在十二月出版的《Na
AB－SCIEX推出创新的蛋白质组学质谱应用新技术
将与苏黎世联邦理工学院通力合作，专注发展 TripleTOF 5600 系统上的 SWATH™ 采集方式，来研究全面的系统蛋白质组学 马萨诸塞州弗雷明汉市2011年6月7日电 /美通社亚洲/ --苏黎世联邦理工学院及 AB SCIEX（全球领
综述：基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展
糖是组成生命体的四大类重要分子之一，糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内，在很多生命过程中起着重要作用，如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时，糖基化修饰在疾病中，特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用，许多疾
蛋白质组学质谱分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
杭州质谱学术大会系列：Astral突破质谱组学新极限
——2020-2023杭州质谱学术大会系列报导 6月11日，中国质谱学术大会 “新方法与新技术”专场报告中，来自北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院大连化物所张丽华研究员、南京大学鞠幌先教授、赛默飞应用主管范自全等专家、学者和企业代表带来了关于蛋白质相互作用、结构分析的最新质谱检测方法与应用
ASMS－2018赛默飞世尔科技揭晓串联质谱格兰特奖
——国际竞争奖颁给四位在蛋白质组学领域具有杰出影响力的科学家 分析测试百科网讯 2018年6月4日，在圣地亚哥ASMS 2018上，赛默飞世尔科技将在美国当地时间2018年6月6日，与ASMS共同举办的第66届早餐研讨会上宣布2018年赛默飞串联质谱研究奖的获奖者名单。 现在，该奖项已经进入
质谱技术助力全新定量蛋白质组数据差异分析计算模型
8月13日，国际学术期刊Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所中科院计算生物学重点实验室（马普计算生物学研究所）邵振课题组研究论文“MAP: model-based analysis of proteomic data to detect proteins wit
赛默飞在ASMS发布Orbitrap－Eclipse质谱－激活高端蛋白质组研究
分析测试百科网讯 2019年6月3日，赛默飞在ASMS 2019大会推出全新的Orbitrap Eclipse三合一超高分辨质谱仪，通过智能数据采集最大化获取研究信息并提高效率，其扩展的分析功能可重新激活高端蛋白质研究。Orbitrap Eclipse 三合一超高分辨质谱仪 面对日益复杂的学术
谭敏佳：色谱质谱双翼护航－助力蛋白质组学新突破
分析测试百科网讯 2021年9月23日，赛默飞双重新品线上直播发布会召开，重磅推出了Thermo Scientific™ TSQ™ Plus 三重四极杆质谱仪和Vanquish Neo UHPLC 系统，为蛋白质组学、精准医学、制药和生物制药、临床研究、转化研究等领域提供了从色谱到质谱的高效、高
基于质谱的蛋白质组学，揭示不老分子的抗衰奥秘
——清华大学蛋白质化学与组学平台主管邓海腾教授专访 近年来， NAD+的前体NMN作为抗衰老保健品成为京东最畅销的商品，这是因为NAD+可能和每个人的健康寿命都有关系。这激励着更多科学家们开展研究，探索NAD+多靶标抗衰老的功效和机理。基于质谱的蛋白质组学研究方法也在NAD+的研究中发挥重要作
赛默飞在ASMS－2017上公布TMT研究奖获奖者名单
分析测试百科网讯 在第65届美国质谱年会（ASMS）上，赛默飞公布2016年赛默飞TMT（Tandem Mass Tag）研究奖的获奖者名单。这已经是第三年，这一奖项根据申请者应用串联质谱标记试剂的创新性和影响力，在全球众多蛋白质组学研究者当中评选出获奖者。专有的TMT试剂由Proteome S