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Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27,341对lncRNA-药物可预关联(lncRNA-drug predictive pairs)并绘制出了lncRNA癌症药物基因组图谱。 研究结果以“Systematic Identification of Non-coding pharmacogenomic landscape in cancer”为题发表在《Nature Communications》杂志上。 LncRNA是一类长度超过200个核苷酸的ncRNA,少部分lncRNA在肿瘤细胞生长、迁移及耐药发生中的关键调控作用已被多次报道1-7,但人们对于大部分lncRNA......阅读全文

出人意料的新才能:非编码RNA

  在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过

非编码RNA为癌症研究提供新思路

  澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明,非编码RNA(核糖核酸)在癌症治疗方面存在巨大潜力,有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。  非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来,全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因,这些基因只占人类基因组的2%。  发表

癌症研究大师Cell惊人发现:致癌的假基因

   假基因(Pseudogenes),这一由基因组的2万个蛋白质编码基因衍生而来,现在丧失了蛋白质生成能力的一个长链非编码RNA(lncRNA)子类,长期以来都被视为是基因组的“垃圾”。然而这些在进化过程中保留下的2万个神秘的残余物表明,它们实际上有可能具有一些生物学功能,促进了疾病的形成。  现

精准医学:是变革,还是新壶装旧酒

  精准医学的概念不是美国总统奥巴马首次提出的,却因他的大名而成为2015年医学界最热的关键词。今年,各种形式的医学学术会上,精准医学都成为必不可少的“座上宾”。  什么是精准医学?  ——在生命科学和医学实践所处的重要转折点上应运而生  2015年1月20日,美国总统奥巴马在美国国会作国情咨文报告

基因技术专题-2

RNAi技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术,它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象,其本质是siRNA与对应

陈扬超:以微核糖核酸(microRNA)为靶的抗癌药物研发

  在生物谷举办的2014肿瘤转化医学研讨会上,来着香港中文大学生物医学院的陈扬超教授分享了以微核糖核酸(microRNA)为靶的抗癌药物研发。  陈教授现任香港中文大学深圳研究院基因调控与药物研发实验室主任,研究员,博士生导师;香港中文大学生物医学院博士生导师,助理教授。研究兴趣包括癌症生物学,非

陈扬超:以微核糖核酸(microRNA)为靶的抗癌药物研发

  在生物谷举办的2014肿瘤转化医学研讨会上,来着香港中文大学生物医学院的陈扬超教授分享了以微核糖核酸(microRNA)为靶的抗癌药物研发。  陈教授现任香港中文大学深圳研究院基因调控与药物研发实验室主任,研究员,博士生导师;香港中文大学生物医学院博士生导师,助理教授。研究兴趣包括癌症生物学,非

Nature医学揭示抗癌新途径

  VIB-KU Leuven的研究人员发现,非编码RNA NEAT1对于高度分裂的癌细胞非常重要。靶标NEAT1将能更有效的杀死癌细胞。这一重要发现发表在七月五日的Nature Medicine杂志上。  NEAT1参与了细胞核亚结构paraspeckle的形成。虽然paraspeckle在进化过

Cancer Cell:隐藏在“垃圾DNA”中的癌基因

  科学家们一直致力于在基因组中寻找与癌症有关的遗传学改变。在此基础上,人们对癌症的理解以及癌症治疗都取得了巨大的进展。  这类研究大多关注基因组的编码区域,但这一区域只占到人类DNA的2%,应该还有大量癌症相关突变发生在非编码DNA上。非编码DNA曾被称为“垃圾DNA”,虽然人们早已知道它们其实并

关于艾滋病,这里一定有你没看过的新进展!

   1981年6月5日,美国疾病预防控制中心第一次报道艾滋病,目前全世界有3690万人感染艾滋病,死亡人数达到1200万,据WHO估计,中国有超过125万艾滋病患者,艾滋病危害极大,死亡率极高,对全人类的健康产生了极大的威胁,虽然“鸡尾酒疗法”能够有效控制艾滋病进展,但至今仍未研制出根治艾滋病的特

临床质谱中美大咖汇聚第二届中美检验大师论坛

  2017年11月3日~4日,由中国医药教育协会主办, 中华医学会检验医学分会、美国临床化学学会(AACC)联合学术主持的第二届中美检验大师论坛(The Best of AACC China)在上海隆重举行。会议以“全面、快速、精准”为主题,旨在将AACC学术年会的最前沿科学报告和最新研究进展分享

Science子刊专题:癌症中的非编码RNA

  非编码RNA(尤其是microRNA)是众多细胞过程的关键调控子,与发育和癌症进程密切相关。本期Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”,介绍了这类分子的生理和病理学功能。  发现哺乳动物基因组中的非编码RNA,不仅揭示了一类新的生物学调

国家重点基础研究发展计划09申报指南发布

  科技部基础研究司日前发布了《关于发布国家重点基础研究发展计划(含重大科学研究计划)2009年度项目申报指南的通知》。   国家重点基础研究发展计划是以国家重大需求为导向,对我国未来发展和科学技术进步具有战略性、前瞻性、全局性和带动性的基础研究发展计划,主要支持面向国家重大需求的基础研究领域和重

CRISPR:基因编辑刚初出茅庐

  每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就

Nature:CRISPR浪潮席卷学界

  每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就

诱导JNK组合促进胃癌发生研究进展分析

  胃癌是恶性肿瘤最常见的类型之一,是全球第二大癌症相关死亡原因。由于早期胃癌具有非特异度症状,患者往往晚期才能确诊。临床数据表明,晚期胃癌患者术后5年生存率仅为30%-40%,而早期胃癌则为70%-90%。因此,早期诊治是提高患者5年生存率和改善患者预后的重要途径。目前,胃癌的诊断依赖于内镜、病理

俄罗斯科学家绘制出小分子RNA完整基因图

  俄罗斯科学院普通基因研究所与莫斯科物理技术学院联合课题组共同绘制了人和鼠的小分子RNA完整基因图,相关成果刊登在《Nature Biotechnology》科学期刊上。   该课题组研发出专门的算法,不仅可用于寻找新型小分子RNA,而且还可确定不同组织上小分子RNA的活性。课题组收集和分析了人和

人类癌症基因组非编码区域中鉴别出关键的致癌突变

  近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自加拿大安大略省癌症研究所的科学家们通过研究在人类癌症基因组中的大量非编码区域(也被称之为人类癌症DNA的“暗物质”)中发现了一种新型的致癌突变;这种突变或能作为一种新型潜在的治疗靶点,帮助科学家们开发治疗多种类型癌症的新型疗法,包括脑癌、肝

肿瘤标志物“分列式”

癌细胞静悄悄、无休止、无秩序地增生、转移,大量消耗体内营养物质,导致身体免疫机制下降,直到出现身体症状或健康体查时才会注意到它。癌细胞发生、增殖和转移等过程中在患者身体内留下一些踪迹。捕捉到隐藏到这些悄无声息的癌症信号——肿瘤标志物,可以帮助医生癌症诊疗过程中做出更加精准的判断。返祖信号癌细胞被认为

DNA双螺旋六十周年 Nature,Cell发文点评

  今天(美国时间4月25日)是DNA分子结构被发现的六十周年钻石纪念日,在1953年两位学者:Francis Crick和James Watson揭示了遗传信息如何通过双螺旋结构被编码的,从而开启了 “基因组时代”。然而时间过去了超过半个世纪,当时由这篇Nature论文引发的人类基因组计划

精准医学:是变革,还是新壶装旧酒?

  2015年1月20日,美国总统奥巴马在美国国会作国情咨文报告时提出精准医学一词,迅速成为新年伊始世界各国关注的热点。很多人不禁要问,奥巴马口中的精准医学长什么样子?为什么要在这个时候启动精准医学计划?精准医学的概念不是美国总统奥巴马首次提出的,却因他的大名而成为2015年医学界最热的关键词。今年

频频被“泼冷水” CRISPR/Cas基因编辑未来究竟何去何从?

   CRISPR/Cas这项基因编辑技术自从问世以来,已经吸引了无数欢呼和掌声,在短短几年之内,它已经成为了生物科学领域最炙手可热的研究工具。然而它最近也频频被“泼冷水”,那么基因编辑未来究竟何去何从呢?  基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。CRI

中国学者发表6篇Nature,在生命科学领域取得重大进展

  iNature  2019年9月4日,中国学者在Nature连续发表了6项成果,涉及生命科学,天文学,地球科学等不同的领域,iNature系统介绍这些成果:  【1】混合谱系白血病(MLL)家族的甲基转移酶  -包括MLL1,MLL2,MLL3,MLL4,SET1A和SET1B-在赖氨

梁晗:从癌症基因组中寻找性别差异

  如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少,而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女,你会相信吗?可能大部分人都会摇头:怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明,性别在癌症中起着不可忽视的作用。   来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型,在分子水平上认

梁晗:从癌症基因组中寻找性别差异

  如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少,而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女,你会相信吗?可能大部分人都会摇头:怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明,性别在癌症中起着不可忽视的作用。  来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型,在分子水平上认识

梁晗:从癌症基因组中寻找性别差异

  如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少,而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女,你会相信吗?可能大部分人都会摇头:怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明,性别在癌症中起着不可忽视的作用。  来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型,在分子水平上认识

新技术拍"全身照"艾滋病毒基因组结构首破译

  美国北卡罗来纳大学8月5日发布新闻公报称,该校研究人员通过使用一种新的成像技术,首次破译出完整的艾滋病病毒(HIV)基因组结构。这对于了解人类艾滋病具有普遍意义,将有效推进抗艾滋病药物和抗流感病毒药物的研发步伐。该研究成果刊登在8月6日的《自然》杂志上。   人类免疫系统缺陷病毒(HIV)是一

这些新的研究发现或会让你眼前一亮!

  在科学研究道路上,科学家们常常会有一些不经意、让他们眼前为之一亮重要研究发现,而这些研究结果都是他们首次阐明或发现的,本文中,小编就对这些重要研究成果进行整理,分享给大家!  【1】Nature:重磅!解码人体免疫系统!首次对人体免疫系统进行全面测序  doi:10.1038/s41586-01

小条件性RNA分子可让癌细胞自我毁灭

  如果癌症治疗能像计算机程序那样,根据条件执行任务,结果会怎样呢?物理学家组织网近日报道,加州理工学院的研究人员开发出一种小条件性RNA(核糖核酸)分子,它可以按照“如果……只有……才……”的逻辑命令来杀死变异细胞,极大程度地减轻了癌症治疗的副作用,研究论文发表在9月6日的美国《国家

复旦大学,中科院Cancer Res发现癌症转移的新机制

  生物通报道:来自中科院生物化学与细胞生物学研究所,复旦大学中山医院等处的研究人员发表了题为“KRAS-NFκB-YY1-miR-489 signaling axis controls pancreatic cancer metastasis”的文章,发现KRAS通过激活NF-κB炎症信号通路激活